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河南农业科学, , ():
2012414 3844
-
JournalofHenanA riculturalSciences
g
拟南芥核苷二磷酸激酶基因家族的
生物信息学比较与分析
*
,
孙小洁 王增兰
( , )
山东师范大学山东省逆境植物研究重点实验室 山东济南 250014
: ( ) , 、
摘要 为研究拟南芥核苷二磷酸激酶家族 个成员之间的差异 对其在蛋白质结构
AtNDPKs 5
、 、 , 。
磷酸化位点 信号肽序列 功能区方面的差异进行了生物信息学的比较分析 并建立了系统进化树
, 、 。 ,
结果显示 个成员在等电点 吸光值和亲水性方面的差异明显 二级结构中 的 螺旋
5 AtNDPK2 α
; ,
比例与其他成员差异显著 在 转角和无规则卷曲方面 AtNDPK1a与AtNDPK3a表现出相反的
β
。 , 。
情况 个成员各含有 个 结构域 但分布位置不同 中酪氨酸磷酸化明显增
5 1 NDK AtNDPK3a
多, 的磷酸化位点与其他成员差异显著。 和 的信号肽裂解点位
AtNDPK1a AtNDPK1 AtNDPK2
, ,
于第 和 位氨基酸之间 和 的位于第 和 位之间 而
16 17 AtNDPK3 AtNDPK3a 42 43 AtNDPK1a
的位于第 和 位之间。 的进化地位高于其他成员, 与 的亲
24 25 AtNDPK1a AtNDPK3 AtNDPK3a
, 。
缘关系最近 而AtNDPK1与其他成员的亲缘关系较远
: ; ; ; ;
关键词 拟南芥 生物信息学 核苷二磷酸激酶家族 序列分析 系统分析
中图分类号: 文献标志码: 文章编号: ( )
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