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拟南芥核苷二磷酸激酶基因家族的生物信息学比较和分析.pdfVIP

拟南芥核苷二磷酸激酶基因家族的生物信息学比较和分析.pdf

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河南农业科学, , (): 2012414 3844   - JournalofHenanA riculturalSciences         g   拟南芥核苷二磷酸激酶基因家族的 生物信息学比较与分析 * , 孙小洁 王增兰 ( , ) 山东师范大学山东省逆境植物研究重点实验室 山东济南 250014 : ( ) , 、 摘要 为研究拟南芥核苷二磷酸激酶家族 个成员之间的差异 对其在蛋白质结构 AtNDPKs 5 、 、 , 。 磷酸化位点 信号肽序列 功能区方面的差异进行了生物信息学的比较分析 并建立了系统进化树 , 、 。 , 结果显示 个成员在等电点 吸光值和亲水性方面的差异明显 二级结构中 的 螺旋 5 AtNDPK2 α ; , 比例与其他成员差异显著 在 转角和无规则卷曲方面 AtNDPK1a与AtNDPK3a表现出相反的 β 。 , 。 情况 个成员各含有 个 结构域 但分布位置不同 中酪氨酸磷酸化明显增 5 1 NDK AtNDPK3a 多, 的磷酸化位点与其他成员差异显著。 和 的信号肽裂解点位 AtNDPK1a AtNDPK1 AtNDPK2 , , 于第 和 位氨基酸之间 和 的位于第 和 位之间 而 16 17 AtNDPK3 AtNDPK3a 42 43 AtNDPK1a 的位于第 和 位之间。 的进化地位高于其他成员, 与 的亲 24 25 AtNDPK1a AtNDPK3 AtNDPK3a , 。 缘关系最近 而AtNDPK1与其他成员的亲缘关系较远 : ; ; ; ; 关键词 拟南芥 生物信息学 核苷二磷酸激酶家族 序列分析 系统分析 中图分类号: 文献标志码: 文章编号: ( )

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