第十微生物分类,鉴定和菌种保藏精要.ppt

常用菌种保藏方法的比较 系统发育树的构建 测序得到分离菌株16S rDNA部分序列，此序列一般以*.f.seq形式保存，可以用写字板或Editsequence软件打开，将所得序列通过Blast程序与GenBank中核酸数据进行比对分析( /blast )。 具体步骤如下：点击网站中Nucleotide BLAST下Nucleotide-nucleotide BLAST [blastn]选项，将测序所得序列粘贴在“search”网页空白处，或输入测序结果所在文件夹目录，点击核酸比对选项，即“blast”，然后点击“format”，计算机自动开始有哪些信誉好的足球投注网站核苷酸数据库中序列并进行序列比较，根据同源性高低列出相近序列及其所属种或属，以及菌株相关信息，从而初步判断16S rDNA鉴定结果。 * 第十章 微生物的分类、鉴定和菌种保藏 Taxonomy, Identification, Conservation of Microbiology 微生物分类鉴定目的 分类是人类认识微生物，进而利用和改造微生物的一种手段，微生物工作者只有在掌握了分类学知识的基础上，才能对纷繁的微生物类群有一清晰的轮廊，了解其亲缘关系与演化关系，为人类开发利用微生物资源提供依据。 Phylogeny of the Living World-Overview 第一节 微 生 物 分 类 学 微生物分类学(Taxonomy) 是一门按微生物类群的亲缘关系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群（Taxon）的科学 分类学的任务 分类（Classification）：是指根据相似性或亲缘关系，将一个有机体放在一个单元中 命名（Nomenclature）：是按照国际命名法规给予有机体一个科学的名称 鉴定（Identification）：是指确定一个新分离物是否归属于某个已命名的分类单元的过程。 一、微生物的分类单位 界（Kingdom） 门（Phylum or Division） 纲（Class） 目（Order） 科（Family） 属（Genus） 种（Species） 种是最基本的分类单位。 但分类单元之间科加入亚门、亚纲、亚目、亚科等次要分类单位。种以下又可分为亚种、变种、型、菌株等 微生物种与亚种的概念 种(Species) 凡是于典型培养菌紧密相同的其他培养菌共同统一起来，区分为细菌的一个种（Species），即是以某个“典型菌株”为代表、十分类似的菌株的总称。1987年，国际细菌分类委员会颁布，DNA同源≧ 70%，而且其Tm≦5oC的菌群为一个种 亚种（Subspecies) 在种内，有些菌株在遗传学上关系密切，而且在表型上仅存在较小的某些差异，在种内分成2个或2个以上的分类单位，即为亚种 微生物亚种以下的变型分类 亚种以下 生物变型——表示特殊的生化或生理特征 血清变型——表示抗原结构不同 致病变型——表示某些寄主的专一致病性 噬菌变型——表示对噬菌体的特异性反应 形态变型——表示特殊的形态特征 微 生 物 的 菌 株 菌株(Strain)或称品系 是指同种微生物不同来源的纯培养物即单个分离物的纯培养后代，常以数字、字母、人命或地名等表示 分离物是指已分离得到但为经鉴定的纯培养物的后代即为分离物 群(Group) 为工作方便而将近似的种或介于种间的菌株按其形态或结合生理生化、生态特征归为若干类群。如放线菌中的链霉菌属内的种归为12个类群 二、微 生 物 的 命 名1 微生物的命名按国际命名法命名，即Linna所创立的“双名法” 每一种微生物都用属与种命名，由2个拉丁词或希腊词或拉丁化了的其他文字组成。属名和种名用斜体表达 属名在前，用拉丁名词表示微生物的构造、形态、某科学家名字等，描述微生物的主要特征。第一字母大写 种名在后，第一字母小写。用拉丁形容词表示，描述微生物的色素、形状、来源、病名、地名、某科学家的名字等等 在种名后，附上命名者的姓和命名年份 微 生 物 的 命 名2 如命名对象是新种，需在种名后加n.sp (即novo species) 如仅泛指某一属的微生物，或某属微生物内的某些种，则在属