分子生物复习题.docVIP

1.模体及结构域的概念和主要特点 模体(motif)属于蛋白质的超二级结构，由2个或2个以上具有二级结构的的肽段，在空间上相互接近，形成一个特殊的空间构象，并发挥专一的功能。一种类型的模体总有其特征性的氨基酸序列。蛋白质变性（protein denaturation）：蛋白质在某些物理和化学因素作用下其特定的空间构象被改变，从而导致其理化性质的改变和生物活性的丧失，这种现象称为蛋白质变性。变性后生物活性丧失溶解度降低粘度增加蛋白质变性后，分子结构松散，不能形成结晶，易被蛋白酶水解变性作用并不引起蛋白质一级结构的破坏，而是二级结构以上的高级结构的破坏，变性后的蛋白质称为变性蛋白。 如果变性条件剧烈持久，蛋白质的变性是不可逆的。如果变性条件不剧烈，这种变性作用是可逆的，说明蛋白质分子内部结构的变化不大。这时，如果除去变性因素，在适当条件下变性蛋白质可恢复其天然构象和生物活性，这种现象称为蛋白质的复性（renaturation）。透析与超滤 透析法是利用半透膜将分子大小不同的蛋白质分开。超滤法是利用高压力或离心力，强使水和其他小的溶质分子通过半透膜，而蛋白质留在膜上，可选择不同孔径的泸膜截留不同分子量的蛋白质。蛋白质的盐析 中性盐对蛋白质的溶解度有显著影响，一般在低盐浓度下随着盐浓度升高，蛋白质的溶解度增加，此称盐溶；当盐浓度继续升高时，蛋白质的溶解度不同程度下降并先后析出，这种现象称盐析，将大量盐加到蛋白质溶液中，高浓度的盐离子（如硫酸铵的SO4和NH4)有很强的水化力，可夺取蛋白质分子的水化层，使之“失水”，于是蛋白质胶粒凝结并沉淀析出。电泳法 各种蛋白质在同一pH条件下，因分子量和电荷数量不同而在电场中的迁移率不同而得以分开。当带一定电荷的蛋白质在其中泳动时，到达各自等电点的pH位置就停止，此法可用于分析和制备各种蛋白质。 离子交换层析法 当被分离的蛋白质溶液流经离子交换层析柱时，带有与离子交换剂相反电荷的蛋白质被吸附在离子交换剂上，随后用改变pH或离子强度办法将吸附的蛋白质洗脱下来蛋白质的二级结构(secondary structure)是指多肽链中主链原子的局部空间排列，不涉及侧链的构象。蛋白质二级以上结构统称为空间结构或高级结构。 肽单元肽键中的C、O、N和H四个原子和与之相邻的两个α碳原子位于同一刚性平面，构成一个肽单元(peptide unit)多肽链主链围绕中心轴呈有规律的螺旋式上升，每3.6个氨基酸上升一圈，每个氨基酸残基向上平移0.15nm，故螺距为0.54nm。多肽链充分伸展，各肽键平面之间折叠成锯齿状，侧链R基团交错位于锯齿状结构的上下方。两条以上肽链或一条肽链内的若干肽段平行排列，它们之间靠链间肽键羰基中的氧和亚氨中的氢形成氢键，以稳定构象。氢键的方向与折叠的长轴垂直。 β－转角在球状蛋白分子中，肽链主链常常会出现180°回折，回折部分就称为β－转角(β－blend或β-return)，β－转角由四个连续的氨基酸残基组成，第一个残基中羰基中的氧与第四个残基中亚氨基的氢形成氢键。β－转角由连续的三个肽单元构成。在二级结构中，除了α－螺旋、β－折叠和外，其余肽段的空间排列并无较强的规律性，将这些没有规律性的部分肽链构象称为无规卷曲。 1)一级结构：即蛋白质的共价结构或平面结构，核心内容就是aa的排列顺序，它的改变涉及到蛋白质共价键的破坏和重建。一级结构的全部内容包括：肽链的个数、aa的顺序、二硫键的位置、非aa成分。2)二级结构：肽链主干在空间的走向。主干指的是肽平面与α-C构成的链子，空间走向以及维持这种走向的力量：氢键和R基团的影响（离子键、疏水键、空间障碍等）3)三级结构：即蛋白质的三维结构、构象，指其中所有原子的空间排布，是结构域再经过卷曲和折叠后形成的。如果蛋白质是单条肽链，则三级结构就是它的最高级结构，三级结构由二硫键和次级键（氢键、疏水键、离子键、范德华力）维持。级结构：多条肽链通过非共价键（氢键、疏水键、离子键、范德华力）形成的聚合体的结构就是四级结构，每条肽链都有自己的三级结构，称为亚基或亚单位 6.DNA一级结构中的三种重复序列的特点 根据在整个基因组中出现频率不同将DNA序列分为三类： （1）高度重复序列 重复次数105，可以集中在某一区域串联排列。约占DNA碱基对的10%∽30％。 （2）中度重复序列 重复次数为101～105，散在分布，常与单拷贝基因间隔排列。约占基因组DNA总量的35％。包括多拷贝基因和一些非编码序列。 （3）．单拷贝序列（非重复序列）：在基因组DNA只有单一的拷贝或少数几个拷贝。一般由800~10000bp组成。 大多数编码蛋白质和酶的结构基因。 7.试比较DNA和RNA在分子组成和分子结构上的异同点。 DNA的一级结构是指构成核