质谱技术在微生物鉴定和生物医学中的应用.ppt

SARAMIS – 比较工具 3000 4000 5000 6000 7000 8000 9000 10000 11000 12000 13000 m/z 5263 7774 9638 8176 8792 9970 6009 4817 6746 4086 7545 8339 8962 10219 4469 6788 3771 5709 7888 3142 6260 Cluster analysis of selected reference and sample mass spectra Comparison to mass spectral patterns of reference spectra in the database 在SARAMIS数据库中一个菌种的典型代表包含典型和非典型菌株（基于质谱图谱，基因组学，表型数据） atypical reference isolates are over-represented in SARAMIS phylogenetic distance phylogenetic distance frequency frequency 自然界菌种多样性 SARAMIS SuperSpectra Database 1. Unambiguous identification with 80+ % confidence LIMS SARAMIS Reference Spectra Database 2. Identification 80% confidence or no identification by SSp: Examination of significant matches and release LIMS SARAMIS与LIMS系统 Culture from the stock in gricelol Culture in various conditions Collect isolates from our lab and other facilities (10) Measure MS spectra and construct Database Apply to uncertainty, which reduce stability of identification Difference in colony in a same media ? 2 HW product tolerance ? 3 system Operator ? 12people Culture media ? maximum 5 kinds Culture length ? 24, 48, 72h Culture vender? 3 venders Max 3,240 spectra 深度透视数据库 MicroID system intrucduction Version 1.0 Sample Transfer of cells to MALDI target Export data to MicroID LIMS Identification / Comparison Analysis Matrix 自动鉴定界面 比对鉴定界面 MicroID MALDI-TOF MS 微生物鉴定优势 一种对所有微生物都适用的方法 无需预选测试 与现代分类学结果一致 高度配合有特殊需求使用者 可扩展新菌种及其应用 非常耐用且重复性高 样品准备过程非常简化 可进行高通量分析 绝佳成本与效益比 * AXIMA MALDI: 线性 反射不只是微生物鉴定 MALDI TOF全面解决方案 布鲁克 各类现代生物质谱： 离子阱 MALDI TOF/TOF ESI-Q-TOF FTMS 高分辨质谱仪 全方位应用 天然产物分析 药物研究 蛋白质组学 代谢组学 ............ micrOTOFQ Dry Gas Heater Orthogonal Accelerator Glass Capillary Collision Gas Supply Hexapole 电喷雾离子源 去溶剂系统 飞行管 检测器 反射镜 离子聚焦系统 四级杆Q 碰撞池 micrOTOFQ Dry Gas Heater Orthogonal Accelerator Glass Capillary Collision Gas Supply Hexapole 电喷雾离子源 去溶剂系统 飞行管 检测器 反射镜 离子聚焦系统 离子漏斗式传输 四级杆Q 碰撞池 布鲁克公司独家专利设计： 离子漏斗式传输系统 离子流方向 离子传输率大大提高，从而提高灵敏度。 增宽传输离子质量范围