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琼脂糖凝胶电泳法教材.ppt

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▲微量移液器的使用 规格 100—1000 μL ---蓝色吸头 20—200 μL-----黄色吸头 10—100 μL-----黄色吸头 0.5—10 μL----- 白色吸头 0.1—2.5 μL----- 白色吸头 ▲微量移液器的使用 简单结构 卸枪头按钮 握移液器手法 一、标准操作 适用的液体:水、缓冲液、稀释的盐溶液和酸碱溶液。 1)按到第一档,进入液面几毫米。 2)缓慢松开控制按钮,否则液体进入吸头过速会导致液体倒吸入移液器内部吸入体积减少。 3)打出液体时贴壁并有一定角度,先按到第一档,稍微停顿1s后,待剩余液体聚集后,再按到第二档将剩余液体全部压出。 ▲微量移液器的使用 二、注意事项 1)吸液时: 应进入液面,慢吸慢放;若移液器倾斜,则移液不准确。 2)装配吸头时: 应用力适当,选择匹配的吸头;若用力过猛,则吸头难以脱卸。 3) 应选择合适量程范围的移液器;切忌用大量程的移液器移取小体积样品。 4) 切忌直接按到第二档吸液。 5) 使用完后,应将移液器挂在移液器架上。 6) 移液器吸头都已灭菌,吸液体时不碰任何其他东西,避免交叉污染。 ▲微量移液器的使用 移液器使用视频 琼脂糖凝胶电泳法 —分离鉴定核酸的常规方法 用琼脂糖作支持介质的一种电泳方法。 琼脂糖(Agarose,AG)是琼脂中不带电荷的中性组成成份(几乎不含硫酸根,主要成分为多糖),其水溶液可以制成凝胶,具有多孔网状结构。 DNA分子在电场中移动方向: 等电点等于pH2~2.5,在常规电泳缓冲液(pH8.5)中,带负电荷,在电场中向正极移动。 核酸分子在琼脂糖凝胶中的迁移率(5个因素): (1) DNA的分子大小: 分子越大,迁移越慢 (2) DNA分子的构象: 超螺旋环状>线状DNA>切口环状 (3)琼脂糖浓度: 浓度越大,凝胶越硬;较高浓度的凝胶有利于较小DNA片段的分离;较低浓度的凝胶有利于较大DNA片段的分离。 琼脂糖凝胶的 百分浓度(%) 线状DNA分子的 有效范围(Kb) 0.3 60~5 0.6 20~1 0.7 10~0.8 0.9 7~0.5 1.2 6~0.4 1.5 4~0.2 2.0 3~0.1 线状DNA片段分离的有效范围与琼脂糖凝胶浓度关系 (4)电源电压: 低电压时,线状DNA片段的迁移速率与所加电压成正比; 高电压时,随着电压增加,琼脂糖凝胶的有效分离范围缩小。 >2 kb 的DNA 片段的分辨率达到最大,所加电压不得超过5 V/cm~8 V/cm。 (5)离子强度影响 在没有离子存在时(如误用蒸馏水配制凝胶),电导率最小,DNA几乎不移动; 在高离子强度的缓冲液中(如误加10×电泳缓冲液),则电导很高并明显产热,严重时会引起凝胶熔化或DNA变性。 结果观察: 制备凝胶时先加入少量荧光染料,其分子可插入DNA的碱基之间,可在紫外灯下直接观察到DNA片段在凝胶上的位置(荧光条带),也可在经凝胶成像系统中直接拍照。 器材 电泳仪、水平电泳槽、梳子、微波炉、紫外灯 试剂 琼脂糖、1X TAE电泳缓冲液 、6x Loading buffer、荧光染料 琼脂糖凝胶制备及电泳过程 琼脂糖凝胶制备及电泳 1、凝胶准备(0.8%):用1×TAE配制1%琼脂糖凝胶。 ① 称0.8 g琼脂糖置三角瓶中,加100 mL 1×TAE ② 微波炉加热大约1分钟,熔化琼脂糖 ③ 熔化的琼脂糖自然冷却到60~70℃,加入荧光染料 2μL,并轻轻混匀。 2、倒胶: ① 将冷却60℃的凝胶缓慢倒入制胶模具中,在胶一端插上梳子。 ②室温下静置20 min,凝胶凝固。 ③拨出梳子,将带凝胶的胶床置于电泳槽中,并使样品孔位于电场负极。 3、点样: ①向电泳槽中加入1×TAE电泳缓冲液,让液面高于胶面1mm。 ② 样品准备:吸取5 μL已提取的基因组DNA点在点样纸上,加入1 μL 6×上样缓冲液,用移液器轻轻混匀。 ③上样:用移液器吸取样品,轻轻的加入到凝胶的样品孔中。 上样缓冲液(loading buffer):可显示两条带,前面蓝色是溴酚蓝,代表300bp左右;后面浅绿是二甲苯青,代表约4000bp左右。 功能:指示剂;沉降作用(含甘油),防止漂样。 4、电泳: ①盖上电泳槽,接通电源,开始电泳 。 电泳条件:电压80v(恒压);时间30 m

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