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第四章 DNA重组和基因转移 第一节 目的基因与载体的连接 一 粘末端DNA片段的连接 (一)具有相同粘末端的DNA分子 之间的连接 使用碱性磷酸酶处理载体DNA,去掉其5’末端的磷酸基,以防质粒DNA的自身环化 。 (二)具有不同粘性末端的DNA分子之间的连接 用两种不同的限制性内切酶对载体和外源DNA进行切割后,在它们两端会产生非互补的突出端,经DNA连接酶连接后即产生定向重组体。 HindIII EcoRI HindIII EcoRI 对载体酶切 HindIII EcoRI 对基因酶切 质粒载体的定向重组 二 平末端DNA片段的连接 1 直接用T4连接酶连接 2 同聚物加尾法 3 衔接物连接法 衔接物是指用化学方法合成的一段由10~12个核苷酸组成,具有一个或数个限制酶识别位点的平末端的双链寡核苷酸片段。 所谓载体与DNA片段酶切位点不匹配,指载体与待克隆的DNA片段上的酶切位点不相同,因而用一种或两种酶切制造不出可互补的粘性末端。 1 按照平末端连接方法加上接头 2 将凹端变为平端 (1)使用Klenow酶在4种dNTP存在下,将3′凹端完全补平。 (2)用S1核酸酶去除3′突出末端产生平端DNA分子 三 载体与DNA片段酶切位点不匹配的连接 3 使用大肠杆菌DNA聚合酶I Klenow片段部分补平3′凹端转 变成粘端。 载体经XhoI酶切形成: 外源基因用San3A酶切形成: 用Klenow酶部分补平二者的3′ 凹端,形成: TCGA AGCT GATC CTAG CT TC AG GA 这样,就可以实现有效重组。 TCGA AGCT 3′ 3′ 5′ 5′ GATC CTAG 3′ 3′ 5′ 5′ 四 cDNA与载体的连接 通过依次加入、连接合成的DNA接头进行cDNA克隆 第二节 重组DNA分子的筛选与鉴定 外源基因与载体连接后转化大肠杆菌可能的三种情况: (2) (3) (1) 转化 E.coli 一 遗传检测法 (一)根据载体表型特征选择重组体分子 1 抗药性标记插入失活筛选法 例:pBR322 如果外源基因插入到tetr基因内部,tetr抗性消失,表型为不抗四环素(tets)、而仍抗氨苄青霉素(ampr),这样的转化细胞在含有 amp的培养基仍可生长,但在含有四环素的培养基上不能再生长;反之,如果ampr基因由于外源基因插入其内部而失活,带有重组DNA分子的转化细胞在含有tet的培养基平板上生长,在含有 amp的培养基不能生长。 例: pUC质粒 在LacZ—的大肠杆菌中,在平板培养中,菌落是白色的。若在该细胞中引入pUC质粒,其上有LacZ′,质粒和大肠杆菌DNA可实现α—互补,菌落呈蓝色。 如果在质粒的多克隆位点的某个酶切点上克隆了外源基因,则LacZ′基因受到破坏,便不能再和缺陷型受体菌中生成有活性的β-半乳糖苷酶,因此,菌落呈白色。 (二)根据插入序列的表型特征选择重组体 进入受体细胞的重组DNA分子中的外源基因如果在宿主细胞中能实现功能表达,产生出有功能活性的基因产物,那么鉴定此种重组体最简便的方法就是表型特征的直接选择法。 2 α—互补 二 物理检测法 凝胶电泳检测法 三 核酸杂交检测法 例:原位杂交筛选重组体菌落(或噬菌斑) 四 免疫化学检测法 免疫化学检测法是利用抗体与抗原结合的高度特异性来鉴别基因的。如果某个重组克隆中的外源基因能够表达,在这个克隆中就存在着这个基因的特定蛋白,即可用特异性抗体来检测。常用的有标记抗体测定法和免疫沉淀测定法两种 。 标记抗体测定法的步骤: 转化菌落 影印平板 置于含氯仿饱合气体的容器 细菌裂解,抗原释放 覆盖吸附有未经标记的抗体的NC膜 形成抗原抗体复合物 将NC膜与I125标记的抗体温育 放射自显影 与母板对照,挑取所需的重组克隆 用免疫化学法检测克隆在表达载体pUC8上的基因 第三节 基因转移方法 一 重组DNA导入大肠杆菌 (一)转化 将外源DNA分子导入某一宿主细菌细胞的过程都叫转化。 为了有效地使细菌吸收外源的DNA分子,我们通常要对它们进行一些物理或化学的处理,处理后的细胞吸收外源DNA的能力大大提高,被称为感受态细胞。 对于大肠杆菌细胞,一般采用50mmol/L的CaCl2溶液来制备感受态细胞。 (1)吸附阶段:完整的双链DNA分子吸附于感受态细胞表面 (2)转入阶段:双链DNA分子解链,以单链形式进入细胞, 而另一链则被降解 (3)自身稳定阶段:外源质粒在细胞内又复制成双链环型 DNA (4)表达阶段:即目的基因随质粒的复制子一起复制,并被 转录、转译 DNA分子转化的过程
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