生物化学第二章重点.ppt

第二章 核 酸（Chemistry of nucleic acid） 核酸的发现 1.2 核酸的分布 一 DNA的一级结构 二 DNA的二级结构 三 DNA的三级结构 ● Homologous palindromic sequence in a D. S. DNA -------TTCCCTCTTTCCC------CCCTTTCTCCCTT------ -------AAGGGAGAAAGGG---GGGAAAGAGGGAA---- Mirkin (1987) pGG332 plasmid DNA --------TTCCCTCTTTCCC-------- --------AAGGGAGAAAGGG-------- -------TTCCCTCTTTCCC--------- --------AAGGGAGAAAGGG------- Nodule DNA Hinged DNA free DNA l?????? S. S. DNA + D. S. DNA T. S. DNA ☆????? PU + PU/PY (偏碱性介质中稳定) ☆ PY + PU/PY (偏酸性介质中稳定) 常见类型 第三条链位于B-DNA的 Major groove中 与D. S. DNA一起旋转 T. S. DNA可能的功能 a) T. S. DNA可阻止调节蛋白与 DNA结合, 关闭基因转录过程 b) T. S. DNA 与基因重组, 交换有关 加入第三条S. S. DNA 作为分子剪刀(molecular scissors), 定点切割DNA分子 d) 加入反义的第三条链(anti-sence polydNt) 终止基因的表达 e) 相反的观点----T. S. DNA 与基因表达呈正相关 !? 四股螺旋DNA ( tetraplex DNA, Tetrable Helix DNA ) 发现 ?????? 1958. Poly(I) X-ray photograph? 碱基形成环状氢键连接结构 Tetrable Helix DNA 均有形成 四股螺旋DNA 的可能 5’---TTAGGGTTAGGGTTAGGG-3’ 3’---AATCCCAATCCC-5’ Poly (G), 4 (dG) 染色体端粒高度重复的 DNA序列(TG) 着丝点附近的高度重复序列 结 构 特 点 Linked by Hoogsteen Bonding G G G G 2 × d(T4G4) 2 ×d(G4C4) 结 构 特 点 可能的功能 A 稳定真核生物染色体结构 B 保证DNA末端准确复制 C 与DNA分子的组装有关 D 与染色体的meiosis (减数分裂) mitosis (有丝分裂)有关 Hoogsteen Bonding 5?-----TTAGGGTTAGGGTTAGGGT 3? -----AATCCCAATCCC GGG T A 超螺旋:双螺旋进一步扭曲形成的更高层次的空间结构，包括DNA扭曲、超螺旋、多重螺旋和连环等。 1. DNA超螺旋的概述 DNA正常的双螺旋结构处于能量最低状态，双螺旋中没有张力而处于松弛状态。如果这种正常双螺旋额外增加或减少螺旋圈数，就会使双螺旋内的原子偏离正常的位置而产生张力，这样正常的双螺旋就发生扭曲而形成超螺旋。超螺旋总是向着抵消初级螺旋改变的方向发展。 2. DNA超螺旋的特点 1）线状DNA分子 双螺旋与蛋白质结合后扭曲盘绕而形成螺旋的螺旋结构。 positive supercoiled 2）环状DNA分子 双螺旋扭曲而形成麻花状的超螺旋结构 3、DNA超螺旋的生物学意义 DNA被压缩和包装，使其体积大大减小 增加了DNA的稳定性 可能与复制和转录的调控有关 第四节 RNA的分子结构 一、RNA的结构特点 1. 单链状，但许多区域可自身进行碱基配对，形成回折。 2. 碱基配对规则：A-U，G-C，不能配对区域形成突起。 3. RNA分子比DNA分子小得多，一般含几十至几千个核苷酸 一、RNA的结构特点 核苷酸之间的连结方式：3,5-磷酸