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第三章 核酸Nucleic Acid 主讲教师:唐煌 电话E-Mail:hyhth@163.com 1、核苷酸的结构 1.2 碱基的结构与性质 1.2 碱基的结构与性质 这种水解稳定性差异具有重要的生理意义:DNA作为遗传信息的携带者,在遗传信息的存储和传递中处于中心地位,要求其结构有高度的稳定性;而RNA在大多数情况下是作为DNA的信使,完成任务后即行分解,所以要求RNA具有容易水解性质。 2、核酸的结构 定义 核酸中核苷酸的排列顺序。 由于核苷酸间的差异主要是碱基不同,所以也称为碱基序列。 2.2 DNA的空间结构 2.2 DNA的空间结构 2.3 RNA的空间结构 tRNA的一级结构特点 分子量小,稀有碱基多. 含 10~20% 稀有碱基,如 DHU 3′末端为 — CCA-OH 5′末端大多数为G 具有 T?C 3、核酸的理化性质 3.1 核酸的两性性质及等电点 与蛋白质相似,核酸分子中既含有酸性基团(磷酸基)也含有碱性基团(氨基),因而核酸也具有两性性质。 由于核酸分子中的磷酸是一个中等强度的酸,而碱性(氨基)是一个弱碱,所以核酸的等电点比较低。如DNA的等电点为4~4.5,RNA的等电点为2~2.5。 RNA的等电点比DNA低的原因,是RNA分子中核糖基2-OH通过氢键促进了磷酸基上质子的解离。DNA没有这种作用。 3.2 核酸的水解 (1)酸或碱水解 核酸分子中的磷酸二酯键可在酸或碱性条件下水解切断。 DNA和RNA对酸或碱的耐受程度有很大差别。例如,在0.1 mol/L NaOH溶液中,RNA几乎可以完全水解,生成2’-或3′-磷酸核苷;DNA在同样条件下则不受影响。这种水解性能上的差别,与RNA核糖基上2’-OH的邻基参与作用有很大的关系。在RNA水解时,2’-OH首先进攻磷酸基,在断开磷酯键的同时形成环状磷酸二酯,再在碱的作用形成水解产物。 (2)酶水解 生物体内存在多种核酸水解酶。这些酶可以催化水解多聚核苷酸链中的磷酸二酯键。 以DNA为底物的DNA水解酶(DNases)和以RNA为底物的RNA水解酶(RNases)。 根据作用方式又分作两类:核酸外切酶和核酸内切酶。 核酸外切酶的作用方式是从多聚核苷酸链的一端(3’-端或5’-端)开始,逐个水解切除核苷酸;核酸内切酶的作用方式刚好和外切酶相反,它从多聚核苷酸链中间开始,在某个位点切断磷酸二酯键。 在分子生物学研究中最有应用价值的是限制性核酸内切酶。这种酶可以特异性的水解核酸中某些特定碱基顺序部位。 3.3 核酸的紫外吸收 在核酸分子中,由于嘌呤碱和嘧啶碱具有共轭双键体系,因而具有独特的紫外线吸收光谱,一般在260nm左右有最大吸收峰,可以作为核酸及其组份定性和定量测定的依据。 3.4 核酸的变性、复性与杂交 (1) 核酸的变性 核酸的变性是指核酸双螺旋区的多聚核苷酸链间的氢键断裂,变成单链结构的过程。变性核酸将失去其部分或全部的生物活性。核酸的变性并不涉及磷酸二酯键的断裂,所以它的一级结构(碱基顺序)保持不变。 DNA变性的特征 当DNA的稀盐溶液加热到80-100℃时,双螺旋结构即发生解体,两条链彼此分开,形成无规线团。 DNA变性后,它的一系列性质也随之发生变化,如紫外吸收(260 nm)值升高, 粘度降低等。 DNA变性的特征 DNA的变性过程是突变性的,它在很窄的温度区间内完成。因此,通常将引起DNA变性的温度称为融点,用Tm表示。 DNA变性的特征 RNA本身只有局部的双螺旋区,所以变性行为所引起的性质变化没有DNA那样明显。 利用紫外吸收的变化,可以检测核酸变性的情况。 例如,天然状态的DNA在完全变性后,紫外吸收(260 nm)值增加25-40%. 而RNA变性后,约增加1.1%。这种现象称为增色效应. (2) 核酸的复性 变性DNA在适当的条件下,两条彼此分开的单链可以重新缔合成为双螺旋结构,这一过程称为复性。DNA复性后,一系列性质将得到恢复,但是生物活性一般只能得到部分的恢复。 DNA复性的程度、速率与复性过程的条件有关。 将热变性的DNA骤然冷却至低温时,DNA不可能复性。但是将变性的DNA缓慢冷却时,可以复性。分子量越大复性越难。浓度越大,复性越容易。此外,DNA的复性也与它本身的组成和结构有关。 DNA复性 (3) 核酸的杂交 热变性的DNA单链,在复性时并不一定与同源DNA互补链形成双螺旋结构,它也可以与在某些区域有互补序列的异源DNA单链形成双螺旋结构。 这样形成的新分子称为杂交DNA分子。DNA单链与互补的RNA链之间也可以发生杂交。 核酸的杂交在分子生物学和遗传学的研究中具有重要意义。 核酸的杂交 2.3.3 转运RNA的结构与功能 N,N二甲基鸟嘌呤 N
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