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2基因工程-工具酶
大肠杆菌DNA聚合酶 大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ(DNApolⅠ) 大肠杆菌DNA聚合酶Ⅱ(DNApolⅡ) 大肠杆菌DNA聚合酶Ⅲ(DNApolⅢ) Klenow片段 T4-DNA聚合酶 耐热DNA聚合酶 Taq DNA 聚合酶 pfu DNA 聚合酶 1、5`?3`聚合酶活性:以DNA为模版,在dNTP和镁离子的存在下,催化单核苷酸结合到引物分子的3`-OH末端,沿5`?3`方向合成DNA。 2、5`?3`外切酶活性:可以从5`端降解双链DNA,使之成为单核苷酸,也可降解DNA:RNA杂交体中的RNA成份,即拥有RNA酶H活性。需要5`端游离的磷酸基团 3、3`?5`外切酶活性:从3`-OH末端降解单链或双链DNA分子,降解产物为单核苷酸,当有dNTP存在时, 5`?3`聚合酶活性抑制3`?5`外切酶活性。 DNA polI具有3种酶活性,在基因工程中常用作制备探针。 用枯草杆菌蛋白酶或胰蛋白酶降解大肠杆菌DNA聚合酶I为两个蛋白质片段,其中较小的片段具有5`?3`外切酶活性,较大的片段具有5`?3`聚合酶和3`?5`外切酶活性,称为Klenow片段。 Klenow片段的功能: 1、补平粘性末端 2、标记末端 3、合成cDNA第二链 4、用于Sanger双脱氧末端终止法的DNA序列分析 5、合成杂交探针 常用功能 DNA聚合酶Ⅰ缺陷的突变株仍能生存,这表明DNApolⅠ不是DNA复制的主要聚合酶。1970年发现了DNApolⅡ。此酶MW为120KD,每个细胞内约有100个酶分子,但活性只有DNApolⅠ的5%。 DNApolⅡ的功能: ⑴聚合作用:该酶催化DNA的聚合,但是对模板有特殊的要求。 该酶的最适模板是双链DNA而中间有空隙(gap)的单链DNA部分,而且该单链空隙部分不长于100个核苷酸。 ⑵该酶也具有3→5外切酶活性,但无5→3外切酶活性。 ⑶该酶对作用底物的选择性较强,一般只能将2-脱氧核苷酸掺入到DNA链中。 ⑷该酶不是复制的主要聚合酶,可能在DNA的损伤修复中该酶起到一定的作用。 DNA polⅢ也有3→5和5→3外切酶活性,但是3→5外切酶活性的最适底物是单链是DNA,只产生5-单核苷酸,不会产生二核苷酸,即每次只能从3端开始切除一个核苷酸。 5→3外切酶活性也要求有单链DNA为起始作用底物,但一旦开始后,便可作用于双链区。 DNA polⅢ是细胞内DNA复制所必需的酶,缺乏该酶的温度突变株在限制温度(non permissive temperature)内是不能生长的,此种突变株的裂解液也不能合DNA,但加入DNA聚合酶Ⅲ则可以恢复其合成DNA的能力。 T4 DNA聚合酶与大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ相似,也是一条多肽链,分子量亦相近,但氨基酸组成不同,它至少含有15个半胱氨酸残基。 T4 DNA聚合酶的作用与大肠杆菌DNA polI不同 [1]它无5→3外切酶活性 [2]它需要一条有引物的单链DNA作模板 [3]它利用单链DNA为模板,也可同时利用它作为引物,3端的未杂交部分即被T4 DNA聚合酶的3→5外切酶活性切去,然后在其作用下从3-OH端开始聚合,合成该模板DNA的互补链,再以互补链为模板合成原来的单链DNA。 分离自水生栖热菌,分子量为94,000,最适反应温度75℃, 对95℃高温具良好稳定性,该酶具有5‘→ 3外切酶活性,不存在3’→5’外切酶活性。 TaqDNA聚合酶还要具有非模板依赖性活性,可将PCR双链产物的每一条链3加入单核苷酸尾,故可使PCR产物具有3突出的单A核苷酸尾; 在仅有dTTP存在时,它可将平端的质粒的3端加入单T核苷酸尾,产生3端突出的单T核苷酸尾。应用这一特性,可实现PCR产物的T-A克隆法。 从高温嗜热菌(Pyrococcus furiosis)中精制而成的高保真耐高温DNA聚合酶,它不具有5-3外切酶活性,但具有3-5外切酶活性,可校正PCR扩增过程中产生的错误,使产物的碱基错配率极低。PCR产物为平端,无3端突出的单A核苷酸。 核糖核酸酶(Ribonuclease, Rnase)是一类催化RNA降解为小片段的核酸酶。 在所有已研究的有机体中都含有大量不同类型的核糖核酸酶,表明RNA降解是一个非常原始而且重要的过程。 除了帮助清除细胞内不再需要的RNA,RNase同时也参与了所有RNA分子的成熟过程,其中既包含了携带遗传物质用于指导蛋白质合成的信使RNA,也包含了细胞内功能多样的各种非编码RNA。 核糖核酸酶可划分为核糖核酸内切酶(endoribonucleases)和核糖核酸外切酶(exoribonucleases)。在生物科研的日常应用中,RNaseA和RNaseH是两类最常见的核糖核酸酶,两者同属于核糖核酸内切酶亚类。 RNase H:是核糖核酸内切酶,它能
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