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第九章 核酸的生物合成 ● DNA的生物合成 ● RNA的生物合成 一、DNA的生物合成(一) DNA的自我复制 1.DNA复制的特点 (1)半保留复制 1953年,Watson和Crick提出DNA半保留复制假说:DNA复制时,以亲代DNA的每一条链作模板,合成完全相同的两个双链子代DNA,每个子代DNA中都含有一股亲代DNA链,这种现象称为DNA的半保留复制(semi-conservative replication)。 (2)从复制起始点开始,多双向进行 DNA复制时,在一些具有特定核苷酸排列顺序的位点起始,即复制起始点。在原核生物中,复制起始点通常为一个,而在真核生物中则为多个。 DNA复制时,以复制起始点为中心,向两个方向进行复制(在低等生物中,也可进行单向复制,如滚环复制)。 (3)半不连续复制 由于DNA聚合酶只能以5’→3’方向聚合子代DNA链,即模板DNA链的方向必须为3’→5’。因此,分别以两条亲代DNA链作为模板聚合子代DNA链时的方式是不同的。 以3’→5’方向的亲代DNA链作模板的子代链在复制时基本上是连续进行的,其子代链的聚合方向为5’→3’,这一条链被称为前导链(leading strand)。 以5’→3’方向的亲代DNA链为模板的子代链在复制时则是不连续的,其链的聚合方向也是5’→3’,这条链被称为后随链(lagging strand)。 由于亲代DNA双链在复制时是逐步解开的,因此,后随链的合成也是一段一段的。DNA在复制时,由后随链所形成的一些子代DNA短链称为冈崎片段(Okazaki fragment)。 冈崎片段的大小,在原核生物中约为1000~2000个核苷酸,而在真核生物中约为100-200个核苷酸。 2.DNA复制的条件 (1)原料:四种脱氧核苷三磷酸(dATP、dGTP、 dCTP、dTTP)。 (2)模板:以DNA的两条链为模板链,合成子代DNA。 (3)引物:DNA的合成需要一段RNA链作为引物。 (4)还需要多种蛋白质: ? ● 解螺旋酶和拓扑异构酶 解螺旋酶(unwinding enzyme),又称解链酶,是用于解开DNA双链的酶蛋白,每解开一对碱基,需消耗2分子ATP。 拓扑异构酶Ⅰ可使DNA双链中的一条链切断,松开双螺旋后再将DNA链连接起来。 拓扑异构酶Ⅱ可切断DNA双链,使DNA的超螺旋松解后,再将其连接起来。 ●单链结合蛋白 单链结合蛋白(single strand binding protein, SSB):能够与单链DNA结合。其作用为:① 使解开双螺旋后的DNA单链能够稳定存在,便于以其为模板复制子代DNA;② 保护单链DNA,避免核酸酶的降解。 ● DNA聚合酶 在原核生物中,目前发现的DNA聚合酶有三种,分别命名为DNA聚合酶Ⅰ(pol Ⅰ)、DNA聚合酶Ⅱ(pol Ⅱ)、DNA聚合酶Ⅲ(pol Ⅲ),这三种酶都属于具有多种酶活性的多功能酶。参与DNA复制的主要是pol Ⅲ和pol Ⅰ。 真核生物的DNA聚合酶有五种:DNA聚合酶α(pol α),β(pol β),γ(pol γ),δ(polδ)和ε(pol ε)。 参与染色体DNA复制的是pol α(后随链)和pol δ(前导链),参与线粒体DNA复制的是pol γ,polε与DNA损伤修复、校正和填补缺口有关,pol β只在其他聚合酶无活性时才发挥作用。 ● DNA连接酶 DNA连接酶(DNA ligase)可将后随链上冈崎片段之间的切口连接起来(DNA片段之间形成磷酸二酯键)。 反应需要能量。 3.DNA的复制过程 (1)解旋解链,形成复制叉 由拓扑异构酶和解链酶作用,使DNA的超螺旋及双螺旋结构解开,碱基间氢键断裂,形成两条单链DNA。SSB结合在两条单链DNA上,形成复制叉。 DNA复制时,局部双螺旋解开形成两条单链,这种叉状结构称为复制叉。 (3)延长 由DNA聚合酶催化,前导链从5’→3’方向连续聚合子代DNA链,后随链则按5’→3’方向合成一个个短的冈崎片段。 去除引物,填补缺口: 在原核生物中,DNA聚合酶Ⅰ(5’→3’外切酶活性)水解去除RNA引物,并由该酶催化延长引物缺口处的DNA,直到剩下最后一个磷酸酯键的切口。 在真核生物中,RNA引物的去除,由一种特殊的核酸酶来水解,而冈崎片段仍由DNA聚合酶来延长。 * 在合成过程中,如果插入了一个错配的核苷酸,DNA polⅠ、DNA pol Ⅲ就能识别、并除掉错配的核苷酸(3’?5’外切酶活性) (4)连接冈崎片段 在DNA连接酶的催化下,形成最后一个磷酸酯键,将冈崎片段连接起来,形成完整的DNA长链。 真核生物细胞中DNA的复制除了多
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