清华大学微生物学方案.ppt

第二节 微生物在生物界的地位一、生物的界级分类学说 第三节 微生物的分类系统纲要 美国微生物学会《伯杰氏细菌鉴定手册》 苏联 克拉西里尼科夫 《细菌和放线菌的鉴定》 法国 普雷沃 《细菌分类学》 二、 菌物分类系统纲要 (一)经典的鉴定指标 形态 生理生化反应 生长特性 生活史，有性生殖情况 血清学反应 对噬菌体的敏感性 其他 (二)自动化鉴定技术 1.API细菌数值鉴定系统 法国 2.“Biolog”全自动和手动细菌鉴定系统 美国 二、微生物分类鉴定中的现代方法 G+C碱基比例的测定 G+C碱基比例相差多少，可以认为是不同的种 G+C碱基比例相差多少，可以认为是不同的属 核酸杂交 G+C碱基比相差多少，鉴定需要做核酸杂交？ 16SrRNA碱基测序 (三)细菌数值分类 采用较多的分类特征 根据“等重原则”各个特征不分主次,同等对待 步骤： 计算两菌株间的相关系数 列出相似度矩阵 将矩阵图转化为树状图谱 * 第十章 微生物分类和鉴定 基本概念： 分类 （classification），根据各种细菌的相似性和进化关系将其分为类群，排放在适当的分类单元中。 鉴定（identification），是分类的操作过程，经过一系列测定来确定所研究的菌株属于哪个类群。 命名（nomenclature），根据命名的国际法则对所鉴定的菌株给以科学名称（学名）。 第一节 通用分类单元 一、种以上的系统分类单元 （一）7级分类单元 界 Kingdom 门 Phylum 纲 Class 目 Order 科 Family 属 Genus 种 Species 微生物种下单位-------------------------------- 亚种 subspecies，subsp. 变种 variety，var. 致病变种 pathovar，pv. 第一节 通用分类单元 一、种以上的系统分类单元 （二）种的概念 种(species):是一个基本分类单元，它是一大群表性特征高度相似、亲缘关系及其接近、与同属内其他物种有明显差异的一大群菌株的总称。 新种（species nova）：指权威性的分类、鉴定手册中从未记载过的一种新分离并鉴定的微生物。 二、学名 （一）双名法 依照国际命名法则，采用瑞典科学家林奈（Carl von Linne）在1753年提出的双名法： 学名=属名+种加词+（首次定名人）+现名定名人+现名定名年份 斜体字 正体字（一般省略） 例1.大肠埃希氏菌（简称“大肠杆菌） Escherichia coli （Migula） Castellani et Chalmers 例2.枯草芽孢杆菌 Bacillu subtilis（Ehrenberg） Cohn 1872 第一节 通用分类单元 （二）三名法 二、学名 学名=属名+种加词+符号subsp.或var.+亚种或变种加词 斜体字 正体字（一般省略） 斜体字 例1.苏云金芽孢杆菌腊螟亚种 Bacillus thuringiensis subsp. galleria Pseudomonas syringae pv. tabaci 例2. 丁香假单胞烟草致病变种 第一节 通用分类单元 （三）有关学名的其他知识 1.属名 表示该微生物主要特征，单数，第一个字母大写 属名什么时候可以缩写？ 2.种名加词 代表一个物种的次要特征，字首一律小写 Bacillus sp. 一种芽孢杆菌 Bacillus spp. 若干芽孢杆菌 二、学名 第一节 通用分类单元 （一）亚种 进一步细分种时所用的单元，一般指除某一明显而稳定的特征外，其余鉴定特征与模式种相同的种。 命名按照三名法 三、亚种以下分类名词 提出和使用不受国际命名规则的限制 第一节 通用分类单元 （四）菌株 菌株又称品系（在病毒中称为毒株或株），他表示任何由一个独立分离的单细胞（或单个病毒粒）反制而成的纯遗传型群体及其一切后代。 菌株的名字可以随意确定。 一般用字母加编号。 如：Escherichia coli K12 三、亚种以下分类名词 第一节 通用分类单元 菌株 菌落 菌苔 斜面 菌种 克隆 分离物 掌握以下名词 二界 （1753年） 三界 （1860年） 四界 （1956年） 五界 （196