09第十章微生物的分类与鉴定详解.ppt

第十章 微生物的分类与鉴定 第一节 通用分类单元 第二节 微生物在生物界的地位 第三节 各大类微生物的分类系统纲要 第四节 微生物的鉴定 基本概念 微生物分类学（microbial taxonomy） 分类:在研究微生物相似性的基础上，把每一微生物编排在一定的分类单元中，制定出检索表。 鉴定：运用现代分类系统，通过具体菌株描述，给未知物一个具体的分类位置。 命名：按照国际命名法规，给每个新的分类群一个新的学名。 第一节 通用分类单元 一、种以上的系统分类单元 二、学名 三、亚种以下的几个分类名词 一、种以上的系统分类单元 （一）七级分类单元 　　界（Kingdom）、门（Phylum）、纲（Class）、目（Order）、科（Family）、属（Genus）、种（Species），在以上七个主要级别中，当必要时都可补充若干辅助单元，包括加上“亚”、“超”或添上“族”等。 （二）种的概念 　　　在微生物尤其是原核生物中，种的定义是很难下的，至今还找不到一个公认的、明确的种的定义。这是因为，微生物与高等生物不同，在高等生物中可用于定义种的几个主要性状，在微生物中是无法使用的。我们认为，微生物的种是一个基本分类单元，它是一大群表性特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其它种有着明显差异的一大群菌株的总称。在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型菌株（type strain）当作它的具体代表，故此典型菌株就成了该种的模式种（type species）或模式活标本。 二、学名 　　　 物种的学名是用拉丁词或拉丁化的词组成。在一般的出版物中，学名应排斜体字，在书写或打字材料中，应在学名之下划一横线，以表示它应是斜体字母。学名的表示方法分双名法与三名法两种。 （一）双名法 　　双名法指一个物种的学名由前面一个属名和后面一个种名加词两部分构成。属名的词首须大写，种名加词的字首须小写（包括由人名或地名等专用名词衍生的）。出现在分类学文献中的学名，在上述两部分之后还应加写三项内容，即首次定名人（正体字，用括号括住）、现名定名人（正体字）和现名的定名年份。如在一般书刊中出现学名时，则不必写上后3项内容。 （二）三名法 　　　当某种微生物是一个亚种或变种时，学名就应按三名法拼写。 　　　学名=属名+种名加词+符号subsp或var+亚种或变种的加词 　　　属名和种名加词排斜体，符号subsp或var排正体可省略，亚种或变种的加词排斜体不可省略。 　　　如酿酒酵母椭圆变种（椭圆酿酒酵母） 　Saccharomyces cerevisae（var）ellipsoideus (三)有关学名的其它知识 　1、属名 　　　是一个表示该微生物主要特征的名词或用作名词的形容词，单数，第一个字母应大写。其词源可来自拉丁词、希腊词或其它拉丁化的外来词，也有以组合的方式拼成。当前后有两个或更多的学名连排在一起时，若他们的属名相同，则后面的一个或几个属名可缩写成一个、两个或三个字母，在其后加上一个点。如Bacillus（芽孢杆菌属）可缩写成“B.”或“Bac.”等。 三、亚种以下的几个分类名词 　　　亚种以下的分类单元很多，它们的提出和使用均不受“国际命名法规”的限制。 （一）亚种（subspecies,subsp,ssp.） 　　　亚种是进一步细分种时所用的单元，一般指除某一明显而稳定的特征外，其余鉴定特征都与模式种相同的种。其命名方法按“三名法”处理。 第二节 微生物在生物界的地位 一、生物的界级分类学说 二、三域学说 一、生物的界级分类学说 微生物的分类系统 二界系统：植物界和动物界 三界系统：1866年E.N.Haeckel提出动物界、植物界和原生生物界（单细胞生物、无核类）。 四界系统：1956年Copeland提出植物界、动物界、原始生物界（原生动物、真菌、部分藻类）和菌界（细菌、蓝细菌）。 五界系统：1969年R.H.Whittaker提出动物界、植物界、原生生物界（原生动物、单细胞藻类、粘菌等）、真菌界（真菌和酵母）、原核生物界。 六界系统：1977年我国学者王大耜在Whittaker五界系统基础上增加病毒界。 三总界五界系统：我国学者陈世骧提出非细胞总界、原核总界（细菌界和蓝细菌界）、真核总界（植物界、真菌界、动物界）。 五界系统 二、三域学说 　　　20世纪70年代末由于美国伊利诺斯大学的C.R.Woese等人对大量微生物和其它生物进行16S和18SrRNA的寡核苷酸测序，并比较其同源性水平后，提出了一个与以往各种界级分类不同的新系统，称为三域学说。三个域指的是细菌域、古生菌域和真核生物域。 美国科学家Woese （1977） 提出三域学说 16s rDNA 细菌域 古生菌域 真核生物域 第三节 各大类微