blast P 的用法.ppt

blast P 的用法 何为blast P BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较，结果中的得分是对一种对相似性的统计说明。 BLASTP是蛋白序列到蛋白库中的一种查询。库中存在的每条已知序列将逐一地同每条所查序列作一对一的序列比对。 使用方法 1.有哪些信誉好的足球投注网站网址：/进入页面 使用方法 点击protein blast 使用方法 使用方法 使用方法 使用方法 比对结果 点击BLAST，开始工作 比对结果 点击BLAST，开始工作 比对结果 点击BLAST，开始工作 比对结果 点击BLAST，开始工作 比对结果 比对结果 使用方法 比对结果 比对结果 比对结果 谢谢！ * 概述数据库的序列对齐到查询序列。每个对齐的得分是由5个不同的颜色表示,将分数的范围分为五组。多个排列在同一数据库序列连接条纹线。鼠标移到打击序列使定义和分数显示在顶部的窗口,点击顺序需要用户相关的调整。新:这个图表是一个数据库序列对齐的查询序列的概述。比对颜色的得分,5个分数范围内。多个排列在同一数据库序列由虚线相连。鼠标在一个对齐显示对齐定义和分数在盒子顶部。点击一个对齐显示对齐的细节。 在此处输入需要检测的蛋白质序列，注意使用单字母简写 输入两个数值，以确定检测范围，若全部比对则不需输入 输入此次检测的标题名称 一些基本设定 调整参数，重新比对 保存有哪些信誉好的足球投注网站条件以便下次比对 调整报告显示的参数 下载结果 名词解释 alignments 代表比对的两个序列 hits 表示两个序列比对上的片段 Score 比对得分，如果序列匹配上得分，不一样减分，分值越高，两个序列相似性越高 E Value 值越小，越可信，相对的一个统计值。 Length 输入序列的长度 Identities 一致性，就是两个序列有多少是一样的 Query 代表输入序列 Sbjct 代表数据库中的序列 此次比对的标题，优先为输入值，若没有填写则可能为输入fasta序列头，若无序列头，则由NCBI自动生成。 序列的信息，包括标识号、描述信息、类型、长度 查看其他报告，比如摘要、分类、距离树、结构、多重比对等 保守域，与保守域数据库比对有结果时，方显示 Distribution of 100 Blast Hits on the Query Sequence，图的说明，仔细研读，是hits在输入序列上的分布 消息显示框，当鼠标放在坐标下的横线上，会显示代表的hit的信息； 颜色比例尺，代表hit的得分（score）区间 输入序列的坐标 每一条线段代表一个hit，在线段上点击，会链接到该hit详细的比对信息部分 * 概述数据库的序列对齐到查询序列。每个对齐的得分是由5个不同的颜色表示,将分数的范围分为五组。多个排列在同一数据库序列连接条纹线。鼠标移到打击序列使定义和分数显示在顶部的窗口,点击顺序需要用户相关的调整。新:这个图表是一个数据库序列对齐的查询序列的概述。比对颜色的得分,5个分数范围内。多个排列在同一数据库序列由虚线相连。鼠标在一个对齐显示对齐定义和分数在盒子顶部。点击一个对齐显示对齐的细节。 * *