实验一植物基因组DNA的提取.doc

实验一 植物基因组DNA的提取 sarkosyl 、十六烷基三甲基溴化铵 hexadyltrimethyl ammomum bromide，简称为CTAB 、十二烷基硫酸钠 sodium dodecyl sulfate，简称SDS 等离子型表面活性剂，能溶解细胞膜和核膜蛋白，使核蛋白解聚，从而使DNA得以游离出来。再加入苯酚和氯仿等有机溶剂，能使蛋白质变性，并使抽提液分相，因核酸 DNA、RNA 水溶性很强，经离心后即可从抽提液中除去细胞碎片和大部分蛋白质。上清液中加入无水乙醇使DNA沉淀，沉淀DNA溶于TE溶液中，即得植物总DNA溶液。 三、实验材料 水稻幼叶 四、主要试剂配方 2% CTAB抽提缓冲溶液: CTAB 4g NaCl 16.364 g 1M Tris-HCl 20ml PH8.0 0.5M EDTA 8ml，先用70ml ddH2O溶解, 再定容至200ml灭菌, 冷却后0.2-1% 2-巯基乙醇 （400ul） 氯仿-异戊醇（24：1）：先加96ml氯仿，再加4ml异戊醇，摇匀即可。 五、实验步骤 1. DNA的提取 （1） 2%CTAB抽提缓冲液在65℃水浴中预热。 （2）取少量叶片（约1g）置于研钵中，用液氮磨至粉状； 加入700ul的，轻轻搅动； 将磨碎液分倒入1.5 ml的灭菌离心管中，磨碎液的高度约占管的三分之二； 5）置于65℃的水浴槽或恒温箱中，每隔10 min轻轻摇动，40 min后取出； 6）冷却2 min后，加入氯仿-异戊醇（24：1）至满管， min，使两者混合均匀； （7）放入离心机中10 000 rpm离心10 min，与此同时，将600 μl的异丙醇加入另一新的灭菌离心管中； （8） 10 000 rpm离心1 min后，移液器轻轻地吸取上清夜，转入含有异丙醇的离心管内，将离心管慢慢上下摇动30 sec，使异丙醇与水层充分混合至能见到DNA絮状物； （9）10000 rpm离心1 min后，立即倒掉液体，注意勿将白色DNA沉淀倒出，将离心管倒立于铺开的纸巾上； （10）60 sec后，直立离心管，加入720 μl的75%乙醇及80 μl 5 M的醋酸钠，轻轻转动，用手指弹管尖，使沉淀与管底的DNA块状物浮游于液体中； （11）放置30 min，使DNA块状物的不纯物溶解； （12）10000 rpm离心1 min后，倒掉液体，再加入800 μl 75%的乙醇，将DNA再洗 30 min； （13）10000 rpm离心30 sec后，立即倒掉液体，将离心管倒立于铺开的纸巾上；数分钟后，直立离心管，干燥DNA（自然风干或用风筒吹干）； （14）加入50 μl 0.5 × TE RNase 缓冲液，使DNA溶解置于37℃恒温箱约15 h，使RNA消解； （15）置于-20℃保存、备用。 2. DNA 琼脂糖电泳检测，原理和方法见实验二。 六、 注意事项 （1）叶片磨得越细越好。 （2）移液器 （3）由于植物细胞中含有大量的DNA酶，因此，除在抽提液中加入EDTA抑制酶的活性外，第一步的操作应迅速，以免组织解冻，导致细胞裂解，释放出DNA酶，使DNA降解。 DNA提取过程示意图 电泳检测DNA图谱 思考题： 1. 本实验中所用到的各试剂的作用是什么 CTAB, 氯仿, 异丙醇, 75%乙醇, EDTA 2．提取基因组DNA的方法有哪些？各有何优缺点？