培训课件_生物信息学文章 SCI发表sw.pptxVIP

基于生物信息学的方法发表SCI文章宋伟目 录一、生物信息学简介生物信息学（bioinformatics）定义：是在大分子方面的概念型的生物学，并且使用了信息学的技术，这包括了从应用数学、计算机科学以及统计学等学科衍生而来各种方法，并以此在大尺度上来理解和组织与生物大分子相关的信息。 (Luscombe,2001)一、生物信息学简介研究内容生物信息的存储与查询；序列比对；基因预测及基因组分析；分子进化与系统发育分析；RNA结构预测；蛋白质结构预测；分子设计与药物设计；生物网络；生物芯片；一、生物信息学简介归根结底，生物信息学主要研究两种信息载体：DNA分子蛋白质分子从信息学的角度来看，生物分子是生物信息的载体一、生物信息学简介生物分子至少携带着三种信息：遗传信息与功能相关的结构信息进化信息一、生物信息学简介遗传信息的载体——DNA。控制生物体性状的基因是一系列DNA片段，DNA通过自我复制，在生物体的繁衍过程中传递遗传信息蛋白质的结构决定其功能：空间结构。DNA分子和蛋白质分子都含有进化信息通过比较相似的蛋白质序列，如肌红蛋白和血红蛋白，可以发现由于基因复制而产生的分子进化证据二、生物信息学优势二、生物信息学优势20世纪50年代，DNA双螺旋结构的阐明开创了分子生物学的时代。以生物学和医学为主要研究内容的生命科学研究从此进入了前所未有的高速发展的阶段。生物数据激增，平均每10个月翻一番，仅从文章的增长数量来看，分子生物学和遗传学的文献积累从60年代中期的接近10万篇, 到2000年，则增长至约50万篇！生物学家HGP生物数据的激增（每10个月翻一番）生物信息学（bioinfomatics)的诞生数学家计算机科学家二、生物信息学优势另外，更为大量的数据已经不再以传统的文献形式发表；这里，最为典型的是DNA序列的数据。DNA序列的数据已经从80年代初期的约百条序列、几十万碱基上升至90年代末的数十亿碱基及包括人类基因组在内的一大批(数百万)cDNA、基因和基因组序列了。至2000年底，国际数据库中记录的接近一千万条DNA序列的碱基数已超过100亿！也就是说，在短短的约18年间，数据量增长丁近十万倍！二、生物信息学优势事实上， 在今天的一个大型的基因测序中心，每天可进行十万个测序反应，产生出l07的序列数据。参与人类基因组测序的公共部分合作的各国测序中心，自1999年6月开始进入大规模测序阶段，在短短的8个月内，测序能力上升了将近8倍。至2000年6月，这些中心在6个星期内的测序量就相当于一个人的基因组。也就是说，每周7天，每天24小时。每秒即可产出1000个碱基的数据！至2000年10月，从230亿的测序数据中产生的草图总数据数已达45亿碱基(4．5Gb)。计算机计算 + 生物分子数据 二、生物信息学优势 生物信息是一门交叉学科，无论是生物学，计算机学，数学等都可以对其进行系统研究，进而快速高效的发表SCI文章二、生物信息学优势生物信息学发表文章的优势1. 丰富的数据资源和生物软件工具； 数据库：NCBI, EBI, DDBJ, PDB, SWISS-PROT等； 软件工具：Cytoscape，BLAST, R语言，String, David等；2.免去了繁杂和重复的实验；3.速度快；3.是一门新兴的学科且具有长远的研究意义；4.内容丰富，知识庞大，可研究和待解决的问题很多。 包括生物学方面的(如分子的功能如何进化)和计算方面的(如数据库系统间如何最有效地协同)三、SCI介绍Science Citation Index, SCI三、SCI介绍SCI是美国《科学引文索引》的英文简称，其全称为：Science Citation Index，创刊于1961年，它是根据现代情报学家加菲尔德(Engene Garfield) 1953年提出的引文思想而创立的。SCI是由ISI（ Institute for Scientific Information Inc.）美国科学情报所出版，现为双月刊。SCI是一部国际性索引，包括有：自然科学、生物、医学、农业、技术和行为科学等，主要侧重基础科学。所选用的刊物来源于94个类、40多个国家、50多种文字，这些国家主要有美国、英国、荷兰、德国、俄罗斯、法国、日本、加拿大，中国等。三、SCI介绍SCI基本概念引文(Citation)和来源文献(Source Item)： 一篇文章的参考文献称为引文，该篇文章称为来源文献。刊载来源文献的期刊或专著丛书等称为来源出版物(Source Publications)。被引作者或引文作者(Cited Author)：即参考文献的作者。引文索引：反映文献之间引用和被引用关系及规律的一种新型的索引工具。影响因子（Impact Factor,IF)是ISI的期刊引证报告