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第二节 RNA转录后的加工 RNA聚合酶合成的原初转录产物,要经过剪切、修饰、拼接等过程,才能转变成成熟的RNA分子,此过程称RNA转录后的加工。 (1)原核、真核的tRNA、rRNA(稳定的RNA) 细胞内的tRNA、rRNA相对稳定,半衰期一般为几个小时。所有的tRNA、rRNA都不是原初转录产物,都要经过一系列的加工才能成为有活性的分子。 a. 原初转录产物的5’是三磷酸(pppG、pppA),而成熟的tRNA、rRNA ,5’是单磷酸。 b. 成熟 tRNA、rRNA分子都比原初转录物小。 c. 所有的tRNA分子,都有原初转录物所没有的稀有碱基(A、G、C、U以外的碱基)。 (2)真核的mRNA 单顺反子,多内含子。寿命比原核mRNA的长。 内含子、内元(intron):在原初转录物中,通过RNA拼接反应而被去除的RNA序列,或基因中与这种序列对应的DNA序列。 外显子、外元(exon):原初转录物通过RNA拼接反应后,而保留于成熟RNA中的序列,或基因中与成熟RNA对应的DNA序列。 (3)原核mRNA 多顺反子,半衰期只有几分钟。这是原核生物重要的调控机制,如果一种酶或蛋白质不再需要时,只需简单地关闭其mRNA的合成就行了。 一、原核生物RNA的加工 在原核生物中,rRNA基因与某些tRNA基因组成混合操纵子,可提高效率、节省空间(增加有效信息)。其它的tRNA基因也成簇存在,并与编码蛋白质的基因组成操纵子,它们在形成多顺反子转录物后,断裂成为rRNA和tRNA的前体,然后进一步加工成熟。 1、原核rRNA前体的加工(E.coli) E.coli共有三种rRNA 5S rRNA 120b 16S rRNA 1541b 23S rRNA 2904b rRNA原初转录物含6300个核苷酸,约30S。 2、原核tRNA前体的加工 E.coli染色体基因组有60个tRNA基因,即某种aa.的tRNA基因不止一个拷贝。 tRNA基因大多成簇存在,或与rRNA基因,或与蛋白质基因组成混合转录单位。 tRNA前体加工步骤 a. 核酸内切酶(RNAaseP、RNAaseF)在tRNA两端切断。 (1)RNAase P 能识别空间结构,很干净地切除tRNA前体的5’端。 (2)RNAaseF 不干净地切除tRNA前体的3’端序列,需要RNAase D进一步修剪。 b. 核酸外切酶(RNAaseD)从3’端逐个切去附加序列。 c. 在tRNA3’端加上-CCA-OH。tRNA核苷酰转移酶 d. 核苷的修饰(修饰酶):甲基化酶 / S-腺苷蛋氨酸(SAM),假尿苷合成酶。 3、原核mRNA前体的加工 由单顺反子构成mRNA,一般不需加工,一经转录,即可直接进行翻译。 有些多顺反子构成的mRNA,须由核酸内切酶切成较小的mRNA,然后再进行翻译。 二、真核生物RNA的加工 真核rRNA、tRNA前体的加工过程与原核的很相似,但mRNA的加工过程与原核的有很大不同。 1、真核rRNA前体的加工 真核生物核糖体的小亚基含:16-18S rRNA,大亚基含:26-28S r RNA、5S rRNA、5.8S rRNA(特有)。 真核rRNA基因拷贝数较多,几十至几千个之间。 真核rRNA基因也成簇排列在一起,18S、5.8S、28S rRNA基因组成一个转录单位,彼此被间隔区分开,由RNA聚合酶I转录生成一个长的rRNA前体。 5SrRNA基因也成簇排列,间隔区不被转录,由RNA聚合酶III转录后经适当加工。 哺乳动物:45SrRNA前体,含18S、5.8S、28S rRNA 果蝇:38SrRNA前体,含18S、5.8S、28S rRNA 酵母:37SrRNA 前体,17S、5.8S、26S rRNA rRNA在成熟过程中可被甲基化,位点主要在核糖2’-OH上。真核rRNA甲基化程度比原核的高,约1-2%的核苷酸被甲基化。 真核生物的核仁是rRNA合成、加工和装配成核糖体的场所,大、小亚基分别组装后,通过核孔转移到胞质中参与核糖体循环。 2、真核tRNA前体的加工 真核tRNA基因的数目比原核tRNA的要多的多。例如,E.coli有60个tRNA基因,啤酒酵母250个,果蝇850个,爪蟾1150个,人1300个。 真核tRNA基因也成簇排列,被间隔区分开,tRNA基因由RNA聚合酶Ⅲ转录。
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