SDSPAE凝胶电泳2.ppt

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SDSPAE凝胶电泳2

同济大学 周智敏 SDS凝胶电泳 实验原理 实验步骤 注意事项 SDS的优点 SDS的缺点 实验常见问题及处理 小技巧 实验步骤 1.试剂配制  (1) 30%丙烯酰胺(Acr):称Acr30g,甲叉双丙烯酰胺(Bis)0.8g,加蒸馏水至100ml,过滤后置棕色瓶中。 4℃,1~2月 (2)10%SDS(十二烷基磺酸钠) (3)1.5mol/L Tris-HCl缓冲液(pH8.8): 称取Tris 18.2g, 加入50ml水,用1mol/L盐酸调pH8.8,最后用蒸馏水定容至100ml。 (4)1.0mol/LTris-HCl缓冲液(pH6.8): 称取Tris12.1g,加入50ml水,用1mol/L盐酸调pH6.8,最后用蒸馏水定容至100ml (5)0.05mol/LTris-HCl缓冲液(pH8.0):称取Tris0.6g,加入50ml水,用1mol/L盐酸调pH8.0,最后用蒸馏水定容至100ml (6)TEMED(四甲基乙二胺) (7)样品溶解液: SDS(100mg)+巯基乙醇(0.1ml)+ 溴酚蓝(2mg)+甘油(2g)+ 0.05mol/L pH8.0Tris-HCl(2ml),最后定容至10ml (8)固定液:50%甲醇454ml,冰乙酸46ml混匀 (9)染色液:称取考马斯亮蓝R250 0.125g,加上述固定液250ml,过滤后备用 (10)脱色液: 冰乙酸75ml,甲醇50ml,加蒸馏水定容至1000ml (11)电极缓冲液 (内含0.1%SDS,0.05mol/LTris- 0.384mol/L甘氨酸缓冲液pH8.3):称Tris6.0g,甘氨酸28.8g,加入SDS1g,加蒸馏水使其溶解后定容至1000ml 2. 聚胶前准备   (1) 配制10%过硫酸铵溶液(需每天新鲜配制)。  (2) 将单体储存液、缓冲液、水按照一定比例配制成凝胶溶液。  (3) 将灌胶装置准备好。  (4) 待凝胶溶液平衡至室温(23~25℃)后,真空脱气15 min。 3.不连续系统下层分离胶的聚合 在10 ml凝胶溶液中加入10%过硫酸铵50 μl (最终浓度为0.05%),TEMED原液5μl (最终浓度为0.05%)。轻缓地摇动溶液(8~10下),使激活剂混合均匀。 将凝胶溶液平稳地注入两层玻璃板中(注意要以连续平稳的液流从中间位置注入),再在液面上小心注入一层水或正丁醇(约2~3mm高),以阻止氧气进入凝胶溶液中,然后静置至少90 min。 4.不连续系统中的上层浓缩胶 和连续系统凝胶的聚合    连续系统只含一种凝胶,它和不连续系统中的浓缩胶具有相同之处,即在其液面处与空气相接触,因此激活剂的含量应相应地增加,在10m1凝胶溶液中加入10%过硫酸铵50 μl (最终浓度0.05%),TEMED原液10 μl (最终浓度0.1%)。    同前将激活剂混合均匀,但摇动溶液时不要摇得过于剧烈以免引入过多的氧气。 吸去不连续系统中下层分离胶上的水分,以连续平稳的液流注入凝胶溶液,然后小心插入梳子并注意不得在齿尖留有气泡。 静置90 min以上以保证完全聚合。 如果在聚胶过程中发现一道道纹线,即凝胶不均匀,可能是聚合速度太快或激活剂未充分混合导致局部浓度过高。 凝胶聚合的速度可以通过紫外吸收检测,由于丙烯酰胺中的双键在260nm有吸收,聚合后双键消失,光吸收减低。将凝胶溶液倒入石英比色杯中,可观察到20~30 min后光吸收读数开始下降,至80 min以后趋于稳定,说明聚合完成。 5.电泳 将聚合好的凝胶板安置于电泳槽中,上样,选择适当的电压进行电泳。 6.染色和脱色    电泳完毕需通过染色和脱色评定其结果的优劣,此外根据不同的研究目的,也可将凝胶直接进行放射自显影及电印迹。 7.结果处理 测量并计算分子量 蛋白质的分子量与它的电泳迁移有一定关系式,经37种蛋白的测定得到以下的关系式 Mw = K(10-bm) (1) lgMw = lgK-bm = K1-bm (2) 其中MW是蛋白质分子量;K和K1为常数 b为斜率,m是电泳迁移率,实际使用的是相对迁移率mR。 mR=dpr/dBPB 实验注意事项 1. 形成凝胶的试剂要有足够的纯度:丙烯酰胺是形成凝胶溶液中的最主要成份,其纯度的好坏

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