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1. ds DNA Virus 多为动物病毒和噬菌体。研究较多的如 SV40、腺病毒、λ噬菌体和T4 噬菌体等。它们均采用与寄主相同的半保留方式进行复制, 但复制的场所及具体过程有所不同。 疱疹病毒 腺病毒 T4 噬菌体 复 制 类 型 1. 真核寄主病毒 仅限于寄主细胞核内进行复制, 对细胞因子的依赖程度较高(无DdRp)。如乳多空病毒科(C)、疱疹病毒科(L)、腺病毒(L)。 在细胞质内进行复制, 自身含有转录及复制的绝大部分因子, 对于细胞因子的依赖程度较低。如痘病毒(L)等。 2.原核寄主病毒 ( λ 噬菌体) 在溶原侵染和溶菌侵染中存在着不同的DNA复制方式。 复 制 特 点 ds DNA病毒具有与细胞ds DNA相似的基因组,基本上采用细胞基因相同的机制进行复制(半保留复制)和表达。 基因组一般较小(3.0-6.0kb), 多数对于寄主细胞的依赖程度极高, 如细小病毒科、微小噬菌体科(φX174)、联体病毒科。复制在细胞核内进行, 通过合成一条负链做为模板进行正链合成。 2. ssDNA Virus 细小病毒(Parvovirus) 无包膜,基因组约5kb, 线状, 含有一定比例的正意链(positive),但大部分区域为负意链(negative)。复制过程中基因组5’和3’末端的回文序列(约100-200 base)可形成“发卡”/“Y”型结构。 rep cap Terminal palindrome 3’ 5’ Coliphage φX174 基因组约5.4kb, 环状, 编码10-12种蛋白,其中三个为重叠基因(B/A、K/A+C、E/D)。共有三个启动子, 结构与E. coli的启动子相似。复制过程中单链DNA形成双链中间形式 (RF: 超螺旋ds环状和松弛ds环状), 有“复制叉(θ)”和“滚环 (σ) ”两种过程。 ss(-) ds(+ and-) 蛋白质 mRNA ss(+) M13-phage, circular, 6.4 kb. 双生病毒(联体病毒,Geminivirus) circular, one or two segments (A B), 2.5-3.0 kb, or 4.8-5.6 kb. 以呼肠孤病毒(Reovirus)为代表,球形粒子,双层衣壳。基因组16-30kbp,分为10-12个节段,长度不等(呼肠孤病毒10-12个片段; 囊状噬菌体 3个片段),多为单顺反子,5’、3’末端序列保守。正链RNA 5’端为“帽子”结构, 3’末端为polyA尾序, 负链RNA无此类结构。 病毒颗粒核心含有RNA聚合酶, 在酸化作用下病毒部分脱壳, 形成亚颗粒(ParticleSubviral particleViral core—RNA+内衣壳)。在亚颗粒中,以负链为模板产生单顺反子RNA(mRNA), 并表达各种蛋白。在侵染过程后期方以正意链(mRNA)为模板合成负链,并形成双链基因组片段---以全保留方式在寄主细胞质中进行复制。 3. ds RNA Virus 呼肠孤病毒 10 segments, linear, total 23.7kbp 轮状病毒(Rotavirus) ---11 segments, linear, total genome length from 16.5-21 kb 斐济病毒属(Fijivirus)—RBSDV 10 segments, linear, total genome length c. 29 kb S1 S2 S3,4 S5 S6 S7 S8 S9 S10 S1: AY144568; 4501 bp,1个ORF; S2: AF521806; 3813 bp,1个ORF; S3: AF432355; 3572 bp,1个ORF; S4:AY144568; 3517 bp, 1个ORF; S5: AY144569; 3164 bp,2个ORF; S6: AY144570; 2645 bp,1个ORF; S7: AF397894; 2193 bp,2个非重叠的ORF; S8: AF397826; 1936 bp,1个ORF; S9: AF536564; 1900 bp,2个非重叠的ORF; S10:AF227205;1801bp , 1个ORF。 Fijivirus con
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