医疗系统 主成分分析课件.ppt

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主成分分析 学习主成分分析的意义? 研究多个变量之间的依存关系是统计分析的一个重要任务。 分析多个变量之间的依存关系时,经常遇到两个问题: 指标个数过多 指标之间相关 医学研究中广泛存在多指标问题 在心理学研究中: 描述儿童气质的指标:9个 描述儿童性格的指标:12个 描述儿童活动能力的指标:6个 描述儿童精细活动能力的指标:11个 在临床医学研究中: 描述牙槽弓形形态特征的指标:22个 衡量甲状腺机能的指标:21个 鉴别阑尾炎病型的指标:27个 描述儿童生长发育的指标:12个 儿童生长发育指标 身高,腿长,臂长 长度 肩宽,胸宽,臀骨宽 宽度 胸围,臂围,大腿围 围度 如果分别用每一个指标对儿童的生长发育做评价,评价孤立,非综合。 如果仅选用其中的几个独立的指标,失去了许多有用的信息,容易得出片面结论。 医学研究中广泛存在 多重共线性问题 multicollinearity 问 题 如何寻找一种合理的综合性方法,使得: 1. 减少指标变量的个数。 尽量不损失或者稍损失原指标变量中所包含的信息。(用方差衡量) 使得原本相关的指标转化为彼此不相关(用相关系数阵衡量) 多元统计分析中 存在的问题和解决方法 主要存在问题 多指标问题 主要解决方法 主成分分析 因子分析 结构方程分析 什么是主成分分析? 将彼此相关的指标变量转化为彼此不相关的指标变量; 将个数较多的指标变量转化为个数较少的指标变量。 将意义单一的指标变量转化为意义综合的指标变量。 Basic idea Original: New : Dependent Independent More Fewer Single Comprehensive 第一节 主成分分析的基本原理 相关数据的散点图: 序号 胸围 体重 Id x1 x2 1 14 53.5 2 13 52.0 …… n 25 58.0 基本原理 原坐标系: 。x1,x2相关 。x1,x2变异均匀 新坐标系: 。Z1,Z2不相关 。Z1,Z2变异不均匀 var(Z1)var(Z2) 基本原理 坐标变换公式: Z1= cosθX1+sinθX2 Z2=-sinθX1+cosθX2 主成分分析的基本原理 Basic Principle 寻找一个适当的线性变换: 将彼此相关的变量转变为彼此不相关的新变量; 方差较大的几个新变量就能综合反应原多个变量所包含的主要信息; 新变量各自带有独特的专业含义。 主成分分析思想 见板书 主成分的性质 1)E(Zi)=0 2)var(Zi) =λi --- V(X)的特征值 3)Var(Z1)≥var(Z2)≥…≥var(Zk) 4)var(Z1)+…+var(Zk)=k 5)corr(Zi Zj )=0 6)corr(Zi, Xj )=wi j * (λi )1/ 2 7)(wi1)2+(wi2)2+…+(wik)2=1 第三节 主成分分析的方法步骤 估计主成分; 确定主成分个数; 解释主成分意义; 任务1:估计主成分 estimate the principal components 将指标变量标准化为X; 计算X的方差协方差矩阵V(X); 计算矩阵V(X)的特征值Λ; 计算所有特征值对应的特征向量W。 任务2:确定主成分的个数 determine the number of components 1。根据主成分的累计贡献率来确定 ---原则:累计贡献率70%-85% 2。根据特征值来确定 ---原则:特征值≥1 任务3:解释主成分实际意义 explain the real meaning of the components Wij表示第j个指标变量Xj与第i个主成分Zi 的相关程度,|Wij|值越大,说明Xj对Zi 的贡献越大。 用绝对值大的Wij对应的指标变量来解释新变量Zi 的综合意义。 第四节 主成分分析在医学中的应用 减少指标变量的个数 解决多重相关性问题 专业结论 前两个特征值大于1,第三个特征值接近于1,前三个主成分的累计贡献率达到94.83%,即前三个主成分包含了原来四个指标的94.83%的信息。可以确定主成分的个数为3较合理。 在第一主成分中,指标X1和X2对其的影响最大,因此第一主成分是反映转氨酶和肝大指数的综合指标,即第一主成分可以作为急性肝炎的描述指标。 在第二主成分中,指标X3对其的影响最大,因此,第二主成

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