第三章转录组学文字复习版【参考】.docx

生物信息学(Bioinformatics)：概论一、生物信息学产生的背景/人类基因组计划 二、生物信息学定义三、生物信息学的研究目标及内容 四、生物信息学的发展五、生物信息学研究方法的新进展 六、国内外生物信息学研究现状七、生物信息学的意义和展望 八、生物信息学与生物实验的关系HGP的最初目标：通过国际合作，用15年时间(1990～2006)至少投入30亿美元，构建详细的人类基因组遗传图和物理图，确定人类DNA的全部核苷酸序列，定位约10万基因，并对其它生物进行类似研究。 HGP的终极目标：?阐明人类基因组全部DNA序列；?识别基因； 建立储存这些信息的数据库； 开发数据分析工具； 研究HGP实施所带来的伦理、法律和社会问题HGP的研究特色：1、大协作研究： 以学科为中心?以问题为中心，多学科合作2、研究的计划性和有序性： 多方共同参与，制定更科学、更全面的研究计划3、商业竞争促进基础研究： 1998年Celera公司的加入4、政府与国家的作用： 美：领导与推动 英：始于1989年2月，贡献为1/3左右 法：始于1990年6月，贡献为3％左右 日：始于1990年，贡献为7％左右 德：始于1995年，贡献为7％左右 中：始于1999年9月，贡献为1％左右生物信息学的定义 生物信息学（Bioinformatics）的来源 ：Dr. Hwa A. Lim （林华安）1987年提出 “Bio-informatique” → “Bioinformatics” 1955年出生于马来西亚。联合国Bioinformatics专家，30岁取得佛罗里达州立大学终生教授。1997年，创立结合软件与数据分析的专业顾问公司D’ Trends，服务生物技术、制药及卫生保健等机构。他认为信息学与生物学相结合时未来科学研究的一个潮流，所以他构思了一个新的名称为这个新学科命名。 生物信息学主要研究两种信息载体：DNA分子 蛋白质分子生物分子至少携带着三种信息 ：遗传信息 与功能相关的结构信息 进化信息 概念（狭义）：生物分子信息的获取、存贮、分析和利用概念（广义）：生物体系和过程中信息的存贮、传递和表达 细胞、组织、器官的生理、病理 、药理过程的中各种生物信息目前为止，尚没有一个标准定义？ 首先，该学科仍然是一门处于高速发展的学科，学科知识每天都在发生着细微的变化，这样使得科学家难以给出一个长久不被动摇的定义； 另一方面，生物信息学是一门多学科交叉的新生学科，不同学科的科学家对生物信息学有着不同的侧重点，给出的定义也有不同的局限性，且这种学科的交叉极有可能会随着生物信息学发展的需要而进一步升级。 美国国家基因组研究中心的定义： Bioinformatics (Bioinformatics is an emerging scientific discipline representing the combined power of biology, mathematics, and computers .) 生物信息学是一个代表生物学，数学和计算机的综合力量的新兴学科 美国乔治亚理工大学：Bioinformatics is an integration of mathematical, statistical and computer methods to analyze biological, biochemical and biophysical data生物信息学时采用数学，统计学和计算机等方法分析生物学，生物化学和生物物理学数据的一门综合性学科。美国密苏里大学：Bioinformatics is the science and technology about learning, managing and processing biological information 生物信息学时获知，管理和处理生物信息的科学技术美国国家卫生研究院（NIH）的定义： Bioinformatics (Research, development, or application of computational tools and approaches for expanding the use of biological, medical, behavioral or health data, including those to acquire, store, organize, archive, analyze, or visualize such data.)为拓展生物学、医学、行为学和卫生学数据的用途而进行有关计算机方法手段的研究、开发与应用，包括此类数据的采集、存贮、整理、归档、分析与可视化。 生物信息学： 存储、修复、分析、整合生物数据的学科 分子