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R语言作业姓名：郭伟跃 学号：10112130244一、实验要求实现数据的可视化（画出直方图，盒图，散点图，并解释各个图形所能展现的区别）完成数据的预处理（要求不可使用一次完成函数，即每一步的处理都要分别选择处理函数），最终得到表达量选取出“表达”基因，把至少在两个芯片中表达的基因选出来对上步得到的“表达”基因进行聚类分析，要求用至少4种方法，且画出的谱系图形均已勾画出分成5类的框架，聚类结果下方应有基因的名称。画出该10个样本的heatmap图二、实验调试过程及结果1、实现数据的可视化：（1）绘制直方图（2）绘制盒图 （3）绘制散点图（4）分析：直方图：对数据进行统计，得到某一数据出现的次数或频率，可以反映数据的整体分布情况。盒图：分析芯片数据的分布情况以及一组芯片之间的相关性。散点图：对来自两个芯片实验的数据进行点对点的比较。2、完成数据的预处理 1、背景处理（background adjustment） 2、归一化处理（normalization，或称为“标准化处理”） 3、汇总，获得表达水平数据3、选取出“表达”基因芯片中可以检测的基因在sample中不一定都有表达，所以在对基因进行差异基因获取前，应该选取真正表达的基因。选取表达基因的方法为调用affy包mas5calls()4、进行聚类分析（1）中间距离法（2）重心法（3）相似法（4）类平均法5、画出该10个样本的heatmap图 姓名：郭伟跃 学号：10112130244
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