土壤微生物多样性研究方法..doc

应用生态学报 2004 年 5 月　第 15 卷　第 5 期 CHIN ESE J OU RNAL O F A PPL IED ECOL O GY ,May 2004 ,15 (5) ∶899～904 土壤微生物多样性研究方法3 1 ,2 3 3 1 钟文辉 　蔡祖聪 (1 中国科学院南京土壤研究所 ,南京 210008 ;2 南京师范大学化学与环境科学学院 ,南京 210097) 【摘要】　概述了研究土壤微生物多样性的主要方法. 传统上 ,土壤微生物群落的分析依赖于培养技术 ,使 用各种培养基最大限度地培养各种微生物群体 ,但仍只能培养和分离出一小部分土壤微生物群落. 使用 Biolog 分析、磷脂脂肪酸分析和核酸分析等方法 ,可研究和表征那些现在还不能够被培养的土壤微生物 , 从而获取关于土壤微生物群落多样性的更多和更完整的信息. 关键词 土壤 　微生物多样性 Biolog 　磷脂脂肪酸　核酸分析 文章编号 1001 - 9332 (2004) 05 - 0899 - 06 中图分类号 S15413 文献标识码 A Methods f or studying soil microbial diversity. ZHON G Wenhui1 ,2 ,CA I Zucong1 (1 I nstit ute of S oil S cience , Chi2 nese A cadem y of S cience , N anji ng 210008 , Chi na ;2 College of Chem ist ry an d En v i ron ment al S cience , N anji ng N or m al U ni versity , N anji ng 210097 , Chi na) . 2Chi n . J . A ppl . Ecol . ,2004 ,15 (5) :899～904 . This paper gave a review on t he main met hods for st udying soil microbial diversity. Traditionally ,t he analysis of soil microbial communities relied on cult uring techniques ,using a variety of cult ure media. However ,only a small f raction of t he soil microbial community has been cult ured and isolated wit h t his app roach. Ot her met hods such as Biolog GN analysis ,p hosp holipids fat ty acids analysis and nucleic acid2based analysis can be used to st udy and characterize soil microbes which currently cannot be cult ured ,and to get more and complete information about soil microbial community. Key words Soil , Microbial diversity , Biolog , FL FA , Nucleic acid2based analysis. 平板上的微生物群落的组成. 在后一种情况下 ,需从琼脂平 1 　引 　　言 生物多样性包括物种多样性、遗传(基因) 多样性和生态 系统多样性. 土壤微生物多样性包括在栖息地中微生物分类 群的多样性和在微生物分类群内的遗传多样性 ,以及包括群 落结构的变异性、相互作用的复杂性、营养水平( t ropic level) 和共位群(guild) 数量(功能多样性) 在内的生态多样性. 其中 遗传多样性可认为是遗传信息在微生物聚集地或群落中的 量和分布 ,反映微生物群落中总的遗传潜力. 功能多样性则 是指发生在一个群落中的碳源利用模式或作用过程数[ 33 ] . 土壤微生物多样性的研究方法大体上可分为两类 :一类 是用于分析土壤中可培养的微生物群落 ;另一类是用于分析 土壤的整个微生物群落. 第一类分析方法基于微生物分离菌 (isolates) 的形态判别、微生物分离菌在 Biolog