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实验十染色质纤维的制备 一、实验目的 1、了解染色质的组装,学会染色质纤维的制备。 二、实验原理 染色质纤维(chromatin fiber),电镜下所见到的染色质的基本结构单位,粗约30 nm,是由线状DNA双螺旋和组蛋白、非组蛋白、少量RNA以及同DNA、RNA合成有关的酶构成的复合物。 目前,染色质纤维制备技术主要有: 1) 分子梳理 就是利用分子自组装方法硅化载玻片,使其对DNA分子末端具有高度的不可逆的结合能力,然后将DNA溶液加到硅化载玻片上,用另一未处理的盖玻片平放其上,使液滴自然扩散成为厚度约为20微米的薄层,在空气中自然干燥,随着空气—水的相互作用,液滴逐渐缩小,DNA分子被拉直。 2) 动力分子梳理 使用的是动力分子梳理仪,将硅化的载玻片浸入制备好的DNA溶液中温育0.4-5分钟,然后以300 μm/s的恒定速度从DNA溶液中抽出载玻片,锚定的DNA分子自由端随载玻片的移动而被拉直。 3) 低熔点琼脂糖包埋技术利用的是低熔点琼脂糖包埋细胞,经蛋白酶K和RNase消化,使琼脂糖小块中仅含有高分子量的DNA,然后将小块琼脂糖置于载玻片上,在微波炉中熔化,再用干净的盖玻片将DNA溶液从载玻片的一侧推向另一侧。 4) 碱裂解直接涂片法 在人和动物中是直接将培养的细胞经过低渗,固定,加到载玻片的一侧;而在植物中,由于植物细胞有细胞壁,难以直接裂解。因此,在植物中是先提取细胞核,然后将细胞核溶液涂于载玻片上,然后加上碱性裂解液处理,如SDS,使细胞核迅速破裂,DNA分子从核中释放出来,一种方法是倾斜载玻片,借助于重力和溶液的张力使DNA自然伸展开来,另一种方法是用盖玻片将载玻片一侧的DNA溶液均匀地,缓慢地拉至另一侧。两种方法均可以使线状DNA纤维伸展开来。 在DNA作图方面,主要有如下主要优点:①它的分辨率大大提高,分辨率为1-2 kb,灵敏度可达200 bp,与常规分子生物学的限制性酶切图谱相差无几 ,能满足图位克隆的要求。②材料要求不高。③在10 ~ 1000 kb以上的线性DNA分子可被伸展为约2.3 kb/μm,因而可把长度结果(μm级)直接转换为DNA片段大小(kb),大大加速了物理图谱的构建进程。 三、仪器与材料 1、材料:小麦的黄化苗。 2、用具及药品:载玻片、盖玻片、离心机, Solution 1(DTT,triton X-100,MgSO4) STE缓冲液(SDS,EDTA,Tris-cl)。 四、实验程序 1、取80mg黄化幼叶,稍微剪碎。 2、将叶片放到皿中,加1ml Solution Ⅰ,用手术刀将叶片切碎至匀浆状(3min内完成)。 3、用滤膜过滤。 4、得到的悬浮液用13200rpm离心40s,去上清,印管底部有个小黑点。 5、加30μl Solution Ⅰ重悬、取5μl在干净的载玻片上划线。 6、晾3 min,使其半干,期间将STE用手捂热。 7、取40μl STE覆盖在划线上面,室温下裂解5min。 8、用盖玻片,沿玻片将裂解液下拉,室温干燥。 [作业] : 1、制备染色质纤维的方法有哪几种,植物中常用的是哪一种? * *
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