二。血液肿瘤的分子检测-杭州绪论.ppt

* * * * * * 与血液病密切相关的112个基因，包括髓系白血病、淋系白血病、MDS、MPN密切相关的65个基因，淋巴瘤相关的27个基因、骨髓瘤相关的14个基因，以及嗜血综合症10个基因，范可尼贫血的3个基因，与TTP（血栓性血小板减少性紫癜）相关的1个基因. AML: 25; ALL: 19; MD 28 * * 血液病的“基因扫描”-外显子捕获测序 FLT3 NPM1 DNMT3A IDH1 IDH2 NRAS KRAS RUNX1 TET2 TP53 CEBPA WT1 KIT MPL JAK2 SH2B3 ASXL1 CBL EZH2 SF3B1 SRSF2 PHF6 JAK1 PTPN11 PTEN AML T-ALL NOTCH1 FBXW7 RUNX1 DNMT3A PHF6 PTEN FLT3 WT1 JAK1 EZH2 TEL/ETV6 RAS FLT3 TP53 JAK2 ASXL1 IKZF1 JAK3 PTPN11 NF1 PAX5 B-ALL CRLF2 CML ABL1 SETBP1 BRAF NF1 PTPN11 IDH1 IDH2 NRAS KRAS RUNX1 TET2 EZH2 IKZF1 PHF6 CALR CBL CSF3R CLL CLL TP53 ATM SAMHD1 RUNX1 TP53 TET2 KIT IDH1 IDH2 CALR ASXL1 CBL EZH2 SF3B1 SRSF2 NOTCH1 FBXW7 PHF6 I KZF1 JAK1 FLT3 NPM1 DNMT3A NRAS JAK2 PAX5 MPN 淋巴瘤 ARIDA ATM BCL2 BCL6 BIRC3 CCND1 CDKN1A CREBBP CRLF2 CXCR4 EPHA7 FAT1 MLL2 NOTCH2 PDGFRB PIK3CA TAL1 TEL WHSC1 。。。 FGFR3 MAFB MUM1/IRF4 PAX5 PRDM1 RB1 TRAF3 。。。 骨髓瘤 CCND1 CCND3 c-MAF c-MYC CYLD DIS3 FAM46C 。。。 T-ALL NRAS SH2B3 GATA3 KRAS JAK1 JAK3 IL7R FLT3 BRAF ETV6 RUNX1 EZH2 EP300 IKZF1 EED SUZ12 SETD2 DNM2 WT1 PHF6 NOTCH1 RELN ECT2L FAT1 FAT3 MLL2 BMI1 DNMT3A EP300 造血过程相关 组蛋白修饰相关 Nature 481：157-163. 2012 新基因 噬血细胞综合症 (HPS) 历史 1979年首先由Risdall等报告,是一种多器官、多系统受累，并进行性加重伴免疫功能紊乱的巨噬细胞增生性疾病 流行病 流行病学以儿童多见，男性多于女性。儿童原发性HLH(FHL)的年发病率约为0.12/1O万。在日本和亚洲国家发病率较高。本病来势凶险，东方患者的死亡率约为45％。 遗传 检测相关基因RAB27A、 XIAP、 STXBP2、 ITK、 LYST、 PRF1、 SH2-D1A、 UNC13D、 STX11和 WAS的点突变、插入和缺失，从来帮助临床检测 范可尼贫血（Fanconi Anemia，FA） 定义 分子检测 涉及范围 范可尼贫血（Fanconi anemia，FA）是一种常染色体隐性遗传病，为先天性再障中最为常见的一种 分析FANCA，FANCC，FANCG外显子范围内的点突变、短片段的插入和缺失型突变 最常见的三种FA 相关基因：FANCA、FANCC 和FANCG，这三种基因突变约占全部FA 患者的85% FANCA FANCC FANCG 突变基因在血液疾病中的分布 CLL ALL CML AML MDS MPN MM Lymphoma FA HLH TTP 我们通过外显子捕获测序对血液疾病进行“基因扫描”。 检测在血液疾病发生、发展过程中起关键及辅助作用的基因进行全外显子的一个捕获和深度测序，发现这些 “元凶”及“从犯”的一个本质的特征（点突变、短的插入和缺失，以及重复序列），从而轻松的协助疾病的诊断，并对疾病进行一个危险度的分层、预后判断以及用药的指导等。 高通量测序进行“基因扫描” 测序流程 3.5小时 3小时 2小时 0.5小时 01 构建文库 02 制备模板 03 运行序列 04 分析数据 患者中发现的SNP和in/del 正常多态性 基因突变 COSMIC，dbSNP, 1000 genome数据库查询 罕见突变 以往研究中有过报道 临床