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生物信息技术第三次作业生物信息技术第三次作业
UniProt数据库检索及数据条目注释信息
UniProt蛋白质序列数据库
阅Swiss-Prot和TrEMBL统计报表（Release Statistics）列表说明这两个子库的总数据量，以及不同蛋白质证据（Protein Existence）的数据条目数数据库子库 总数据量 Protein Existence数据条目数 蛋白水平证据 转录水平证据 同源性推断 预测 不确定 Swiss-rot 542782 82087 62272 380832 15705 1886 TrEMBL22013 93131339720204 0
列表说明Swiss-Prot和TrEMBL中数据条目数列前10位的物种。 Swiss-Prot 中文名 英文名 拉丁文学名 1 智人 Human Homo sapiens 2 小家鼠 Mouse Mus musculus 3 拟南芥 Mouse-ear cress Arabidopsis thaliana 4 大鼠 Rat Rattus norvegicus 5 酿酒酵母 Bakers yeast Saccharomyces cerevisiae 6 牛 Bovine Bos taurus 7 裂殖酵母 Fission yeast Schizosaccharomyces pombe 8 大肠杆菌 strain K12 Escherichia coli 9 枯草杆菌 strain 168 Bacillus subtilis 10 盘基网柄菌 Slime mold Dictyostelium discoideum TrEMBL 中文名 英文名 拉丁文学名 1 人类免疫缺陷病毒 HIV Human immunodeficiency virus 1 2 未培养细菌 Uncultured bacteria uncultured bacterium 3 智人 Human Homo sapiens 4 小麦 Wheat Triticum aestivum 5 粳稻 Rice Oryza sativa subsp. japonica 6 丙型肝炎病毒 HCV Hepatitis C virus 7 乙型肝炎病毒 HBV Hepatitis B virus 8 大豆 Soybean Glycine max 9 宏基因组 mine drainage metagenome mine drainage metagenome 10 二棱大麦 Two-rowed barley Hordeum vulgare var. distichum 拉丁文学名 英文名 N Nr Np Nm Nb 人 Homo sapiens Human 136495 20270 14233 13627 5211 小鼠 Mus musculus Mouse 73479 16658 8208 7472 1465 大鼠 Rattus norvegicus Rat 33577 7887 3407 2918 534 鸡 Allus domestiaus Chicken 23729 2257 705 481 174 非洲爪蟾 Xenopus laevis African clawed frog 16014 3382 578 491 59 斑马鱼 Danio rerio Zebrafish 55756 2916 393 306 64 黑腹果蝇 Drosophila melanogaster Drosophila melanogaster 39998 3220 1974 1910 351 秀丽线虫 Caenorhabditis elegans Caenorhabditis elegans 26657 3461 1489 1475 115 酿酒酵母 Saccharomyces cerevisiae Baker’s yeast 79276 7807 5322 5252 1098 大肠杆菌K12 Escherichia coli Strain K12 15660 5970 2753 2748 1319 拟南芥 Arabidopsis thaliana Mouse-ear cress 53270 12665 12934 13599 5071 粳稻 Oryza sativa subsp keng Japonica 籼稻 Oryza sativa indica Indica 玉米 Zea mays Maize 62877 738 347 203 34 棉花 Gossypium spp Cotton
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