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[第五章晶体的结构和绘图表达
目录 晶体的化学结构 晶体中的化学作用力 晶体结构表达、绘图和分析 原子和离子半径的周期性变化 堆积的产生 原子和离子都具有一定的有效半径,因而可以看成是具有一定大小的球体。 在金属晶体和离子晶体中,金属键和离子键没有方向性和饱和性。 从几何角度看,原子之间或者粒子之间的相互结合,在形式上可以看作是球体间的相互堆积。 晶体具有最小内能性,原子和离子相互结合时,相互间的引力和斥力处于平衡状态,这就相当于要求球体间做紧密堆积。 简单立方堆积Simple Cubic Structure(SC) 只有钋(Po)采用这种堆积模式 配位数6,每个晶胞单元中包含1个原子 原子堆积因子Atomic Packing Factor(APF) 在晶体学里,原子堆积因子(或称APF)是计算一个晶体的体积里原子体积占的比例的函数。在计算前,必须假定原子是坚硬的球体,而且有确定的表面(而不是含糊不清的电子云)。 SC原子堆积因子计算 体心立方堆积Body-Centered Cubic Structure(BCC) 沿体对角线做紧密堆积 立方体 8 个顶点上的球互不相切,但均与体心位置上的球相切。 配位数8,每个晶胞单元中包含2个原子 BCC原子堆积因子计算 面心立方堆积 Face-Centered Cubic Structure(FCC) 沿面对角线做紧密堆积 配位数12,每个晶胞单元中包含4个原子 FCC原子堆积因子计算 FCC原子堆积方式详解 FCC原子堆积方式详解 另一种堆积方式…… 六方密堆积Hexagonal Close Packing(HCP) 六方晶胞,沿c轴做紧密堆积 配位数12,每个晶胞单元中包含6个原子,原子堆积因子0.74,与FCC相同 晶体结构绘图表达Diamond的使用 Diamond是一种广泛使用的绘制晶体结构图的软件 根据原子坐标构建出结构 导入数据文件绘制晶体结构 NaCl晶体结构模型的构造 NaCl晶体的结构数据为:空间群Fm-3m(225);晶胞参数a=5.64?;原子坐标Na:4a, Cl:4b CIF文件 CIF文件的特点 CIF文件格式示例 亚磷酸钙晶体结构模型和分子模型的构造 1、从“.CIF”格式文件(晶体信息文件)中获得晶体结构数据; Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 晶体结构参数及其表达的国际通用文件 Crystallographic Information File (CIF) 空间群 晶胞参数 单胞内分子数 原子坐标 晶体结构图 晶体学计算 …… Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 后缀*.cif 为多个数据库的标准格式 剑桥结构数据库(The Cambridge structural Database, CSD )(英国);蛋白质数据库(The Protein Data Bcmk PDB)(美国);无机晶体结构数据库(The Inorganic Crystal Structure Database ICSD)(德国);NRCC金属晶体学数据文件库(加拿大) 记录了晶体结构的所有信息 点群、空间群、晶胞参数、原子坐标、单胞分子数、数据来源…… 可由相关晶体学软件直接读取 Diamond、Mercury、Atoms、CrystalStudio …… Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. Carbon: ?? | ?? | ? ? ? ?? | ? ? ? ? 1s 2s 2p 1s 2(sp3) C-C-C angle = 109o 28’ 金刚石的结构-sp3杂化 化学键 共价键 cov
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