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2.蛋白质的结构组成(Protein’s building-block units) 蛋白质(Pr)分子量很大,可水解成简单有机化合物——氨基酸(amino acids),Pr含有数以百计的氨基酸(aa),氨基酸按固定的排列顺序以共价键的形式连接形成长的不分支的链。 蛋白质是由多肽组成的。 蛋白质:分子量6000时,有完整的生物学功能,至少40个aa。 多肽:分子量6000时,不完全有生物学功能。 3、蛋白质的水解(Hydrolysis of proteins) 蛋白质可以被酸、碱和酶水解,可以产生aa。 根据水解程度分: 完全水解?产物为aa,不完全水解?产物不同的片断混合物,无确定组成成分。 根据片断的大小,可以分为: 1).酸水解 方法: 6N HCl,煮沸回流20小时左右,或加压于120°C水解12小时. 优点: 水解彻底,水解的最终产物是L-氨基酸,没有旋光异构体生成. 缺点: 色氨酸全部破坏,丝,苏,酪氨酸部分破坏.有腐黑质生成,水解液呈黑色. 2).碱水解 方法: 6M NaOH或4M Ba(OH)2煮沸6小时. 优点: 色氨酸不被破坏,水解液清亮透明. 缺点: 水解产生的氨基酸发生旋光异构作用,产物中有L-,D-型两类氨基酸. 3).酶水解 方法:蛋白质可以由蛋白酶水解,不同的蛋白酶专一性不同。 优点: 条件温和,常温常压(36-60°C) 及pH 2-8时,氨基酸不受破坏,无旋光异构体产生. 缺点: 各蛋白酶有不同的专一性,用单一的酶作用水解不彻底. 四、蛋白质分子的构象与结构层次 蛋白质都有自己特有的天然空间结构,称为构象。 ? 氨基酸是蛋白质的结构单元,这一点已由蛋白质的水解可以得到证明。 所有生物中最常的是20种氨基酸,在生物界中是通用的。 氨基酸通式为: (二).氨基酸的分类(Classification of amino acids) 1、参加Pr组成的氨基酸 1)有遗传密码的aa,共有20种,可根据侧链的极性不同,将这些氨基酸分成四类(有的是按照R基团的结构来分)。 ①非极性R基氨基酸,侧链无极性 ②不带电荷的极性R基的aa ③带正电荷的极性R基aa——碱性aa ④带负电荷的极性R基aa ——酸性aa (一).氨基酸的物理性质(Physical property of amino acids) 一般性质 (General physical property) 氨基酸的旋光性 (Optical activity of amino acids) 氨基酸的光吸收 (The aromatic amino acids absorb light strongly in the ultraviolet region ) 1、一般性质 (General physical property) 1).形态:均为白色结晶或粉末,不同氨基酸的晶型结构不同。 2).溶解性:一般都溶于水,不溶或微溶于醇,不溶于丙酮,在稀酸和稀碱中溶解性好。 3).熔点:氨基酸的熔点一般都比较高,一般都大于200℃,超过熔点以上氨基酸分解产生胺和二氧化碳。 1、氨基酸的酸碱性质与两性解离 1).氨基酸以偶极离子 (zwitterions or dipolar ions)存在 ①晶体溶点高 → 离子晶格,不是分子晶格。②不溶于非极性溶剂 →极性分子。③介电常数高→ 水溶液中的氨基酸是极性分子。 1).由a-氨基与羧基共同参与的反应 (1).茚三酮的颜色反应 (2).成肽反应 2).a-NH2参与的反应 (1).与亚硝酸反应 (2).与甲醛反应 (3).酰化反应 (4).烷化反应 (5).希夫反应 3).a-COOH参与的反应 (1).成盐反应 (2).成酯反应 (3).酰卤化反应 (4).脱羧反应 (5).叠氮反应 4).氨基酸的侧链基团的反应 续 表 1、?? 旋光性 一般短肽的旋光度等于其各个氨基酸的旋光度的总和。 2、?? 肽的酸碱性质 短肽在晶体和水溶液中是以偶极离子形式存在。 肽的酸碱性质主要取决于N端a-NH2和C端a-COOH以及侧链R上可解离的基团。 在长肽或蛋白质中,可解离的基团主要是侧链基团。 一级结构(共价结构): 蛋白质分子中氨基酸残基的排列顺序。 (3)酶法水解 蛋白质可以由蛋白酶水解,不同的蛋白酶,往往专一性不同,只作用某个或某些aa,所形成的肽键,因此酶解常用于不完全水解,酶解法可以用来测定蛋白的氨基酸顺序(条件比较温和)。 如果完全水解蛋白,则需要多种酶的共同作用。 a-碳是手性碳。 ①非极性R氨基酸,侧链无极性 包括:Gly, Ala, Val, Leu Ile, Pro,
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