crystalmaker教程..doc

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第一章 界面介绍 本章详细介绍了Crystalmaker的操作界面,便于用户选择操作命令和保存文件。本章所有的图片都是在Mac OS X 10.5 “Peopard”上获得的。 菜单介绍 Crystalmaker (Mac version) 记录、应用文件,隐藏或退出程序 File 打开、创建、保存和关闭文件。输出相关的文本和图片 Edit 编辑文本、结构和化学键;拷贝图片到剪切板,或者取消上步操作 Selection 选择原子相关的操作,例如标注、显示、隐藏原子 Model 选择结构模型显示的形式 Rendering 对模型的显示进行不同的设置 Transform 旋转、测量图片命令。可以测量化学键角度,或者产生粉末/单晶衍射花样 Window 对Crystalmaker操作界面进行设置 Help 提供在线帮助和用户手册 图片界面 结构在图片界面中显示。选择Window Show Ruler可以添加标尺。 图片面板 结构主要在图片面板中显示,在这里可以对结构进行旋转和测量操作,或者使用快捷键对其进行操作。 工具栏 工具栏是对工具板的很好补充。对于常用的命令还设置了快捷键。 打开或关闭工具栏: 选择Winsow Show/Hide Toolbar Sidebar包括Site Browser和Notes pane 打开/隐藏Sidebar的两种方法: (1) 点击Toolbar上的Sidebar; (2) 选择Window Show/Hide Sidebar 隐藏Notes pane的三种方法: (1) 点击Toolbar上的Notes pane来显示/隐藏Notes pane; (2) 双击Sidebrowser和Notes pane之间的分隔栏; (3) 把Sidebrowser和Notes pane之间的分隔栏拖动到最下面 隐藏Site Browser的方法: (1) 把Sidebrowser和Notes pane之间的分隔栏拖动到最上面; Site Browser Site Browser提供关于结构中原子的信息。可以按照元素、位置标注对列表进行重新排列、 同时在Site Browser中,可以对原子的颜色、可见度、标注以及半径进行编辑,并对单个位置或者同元素的原子簇进行编辑。 Notes pane 在Notes pane中,可以保存关于结构的文本信息 Overview Window Overview Window提供关于复杂结构的动画和视频制作、文件浏览以及结构输出的具体细节等信息,由Views, History, file和Log四部分构成。 View Pane View pane有以下用处: (1) 记录从特定视角观察晶体的图片; (2) 在统一界面中同时操作几个晶体; (3) 制作动画和视频 创建操作结构的视图,方法有二: (1) 点击window toolbar中的Snapshot; (2) 选择File Take Snapshot 一张结构图片就会出现在View pane中。 从已有文件中创建视图: (1) 把一个或多个文件拖动到Views pane中。每个文件就会加载到Graphics window中,缩略图会再在到Views pane中; (2) 当Views pane可视时,点击Add按钮,然后选择想要加载的文件。 加载一个视图: 点击views pane中的视图,使用键盘上的箭头进行选择。 重新排列视图: 点击并拖动视图,对其进行重排 重命名视图: 点击视图文件,输入新的文件名,按Return或enter键完成设置 更新视图: 用户可以重新生成一个视图,以匹配与现在显示的结构: 右键单击要选择的视图,选择Replace with current view 同步视图 Crystalmaker强大之处在于它能快读的同步多个窗口。这样,如果一个视图和另一个相关,用户可以对它们的显示进行设置,诸如原子颜色、渲染样式、位向、尺寸等。 使用同步命令: (1) 确保主视图在Graphics window的最前面,这个结构的设置将应用到所有的其他结构中; (2) 选择Transform Synchronize命令; (3) 出现一个对话框,显示需要同步哪些视图; (4) 点击OK开始同步。 动画视图 Overview Actions菜单上的Play命令,可以反复播放视图,同时还可以全屏播放或者结构旋转。用户可以控制播放的速度。按 escape退出动画播放。 从视图中生成视频 使用Overview Actions菜单上的Play命令,可以生成一个Quicktime视频。这在展示结构行为和相转变时比较有用。

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