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高级生化实验讲义[精选]
实验一、转录增强因子在DNA转录中的调控作用 – 16学时
一.目的和要求
1. 掌握转录增强因子对启动子控制下报告基因调控的工作原理,了解常见的报告基因种类及启动子种类。
2. 学习PCR克隆转录增强因子CRE,构建报告基因表达载体、细胞培养、细胞转染和荧光素酶活性检测技术。
二.基本原理
报告基因 (reporter gene)是一种编码可被检测的蛋白质或酶的基因。把它的编码序列和基因相融合形成嵌合基因,在调控序列控制下进行表达,利用的表达产物标定目的基因的表达调控。
作为报告基因,在遗传选择和筛选检测方面必须具有以下几个条件:(1)已被克隆和全序列已测定;(2)表达产物在受体细胞中不存在,即无背景,在被转染的细胞中无相似的内源性表达产物;(3)其表达产物能进行定量测定。
在动物基因表达调控的研究中常用的有氯霉素乙酰转移酶基因(cat)、β-半乳糖苷酶基因、荧光酶基因等。(Luciferase) 是生物体内催化荧光素或脂肪醛氧化发光的一类酶的总称。自然界有许多发光生物, 1956年, McElroy 等首次从萤火虫中提取到荧光素酶, 此后各国研究人员相继报道了对各种发光生物中荧光素酶的研究。萤火虫荧光素酶是分子量为60~64kD的多肽链,在Mg2+、ATP、O2存在时,催化D-荧光素(D-Luciferin)氧化脱羧,发出光(λ=550~580nm)荧光酶作为报告基因,具有检测速度快、灵敏度比cat基因高30~1000倍、费用低、不需使用放射性同位素等优点,得到了广泛的采用
调控元件的选择依赖于特定的信号转导途径。很多情况下,GPCRs的活化信号可通过特定的信号转导途径将信息传递至细胞核,调控特定基因的转录。多种自然和合成的调控元件都广泛用于报告基因系统。自然启动子,如c-fos启动子,含有Serum inducible element(SIE)、Serum response element(SRE)、cAMP response element(CRE)等一系列转录因子结合位点,这些调控元件使得该启动子同时受多重信号转导事件的调控。人工合成的启动子中可加入多个单一调控元件,如cAMP反应元件(CRE)。
G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptors,GPCRs)通过与异源三聚体G蛋白的相互作用广泛参与胞内第二信使的调控,从而实现细胞外到细胞内乃至细胞核的信息流通。受体激活后,G蛋白解离为α亚基和βγ亚基并各自激活胞内信号。其中,与Gaq相偶联的GPCRs通过激活磷脂酶Cβ(PLCβ)使质膜上的4,5-二磷酸磷脂酰肌醇(PIP2)水解成1,4,5-三磷酸肌醇(IP3)和二酰基甘油(DG)两个第二信使。IP3与内质网上的IP3配体结合,开启钙通道,使胞内Ca2+浓度升高,激活各类钙离子依赖蛋白。DG可活化与质膜结合的蛋白激酶C(Protein Kinase C,PKC),活化后的PKC通过磷酸化蛋白质的丝氨酸/苏氨酸促使细胞产生不同的反应;与Gas偶联的GPCRs通过激活腺苷酸环化酶(adenylyle cyclase,AC)产生cAMP;与Gai相偶联的GPCRs抑制AC并减弱cAMP水平。同时,来自Gai和其他G蛋白的βγ亚基可通过激活有丝分裂激活蛋白激酶mitogen-activatedprotein kinase,MAP kinase)途径从而活化一系列效应系统。
Gas偶联的GPCRs,在激动剂结合后,可造成胞内cAMP水平的升高,进而激活PKA。活化后的PKA可通过磷酸化CREB(CRE binding protein),促使CREB入核并与特定基因的CRE启动子序列结合,从而促进基因转录。促生长素抑制素somatostatin)、绒毛膜促性腺激素α-chorionic-gonadotrophin)和促肾上腺皮质素释放激素corticotrophin-releasing hormone)基因启动子中的CRE序列由TGACGTCA组成,而c-fos启动子中的CRE则由TGACGTTT组成。
抗原刺激T细胞后可激活PLC,接着PLC活化转录因子NFAT(nucler factor of activated T cells)。PLC激活后可通过水解磷酸肌醇增加肌醇磷酸和二酰基甘油的浓度,后两者分别可增加胞内钙离子水平和激活PKC,PKC可促进AP-1即刻早期基因依赖钙调蛋白的磷酸酯酶un形成转录复合物,最终协同诱导NFAT和AP-1反应元件控制下基因的表达。
血清反应元件(SRE)通过MAP激酶途径激活。SRE由血清反应因子和三元复合因子(如:Elk-1)组成。MAP激酶通过磷酸化三元复合因子而使复合物起始转录。来自于Gai的βγ亚基通过激活Ras依赖的MAP激酶激活此条途径,而通过Gaq偶
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