细菌分类学[精选].doc

细菌分类学课件 第一章 绪论 细菌分类学是研究细菌分类理论和方法的科学，它包括（分类、命名、和鉴定)3个独立和相关的分类学领域。 细菌分类的目的？课本第一页 第一节 细菌分类学的发展和趋势 细菌分类学的发展： 一、形态学时期：分类依据：细菌的形态特征 1872年，德国植物学家Cohn提出第一个细菌分类系统。将细菌分为球菌、短杆菌、长杆菌和螺旋菌 二、生理学时期(第二纪元) 分类依据：生理特征为主 起始于：Orla-Jesen(1909年)的分类系统 主要贡献：1916-1918年，美国微生物学家Buchanan对细菌的命名和分类进行了研究，把细菌分成科、族和属。 1957年，英国细菌学家Sneath把电子计算机技术应用于细菌分类，建立数值分类法。 三、分子生物学时期(第三纪元) 分类依据：化学结构和核酸 起始于：20世纪60年代 应用： 1、分子生物学技术在细菌分类中的应用： 一、DNA分子中G＋C百分含量测定：亲缘关系越近的细菌，G+Cmol%越相近 二、DNA-DNA杂交 三、16S?rRNA相关度分析 2、分子生物学技术在细菌鉴定中的应用： 一、核酸探针：原理：用带有酶、化学荧光物、放射性核素或生物素标记的已知序列特定DNA片段(探针)，在一定条件下，按碱基互补原则探针与待测标本中的核酸杂交，通过对杂交信号的检测，从而鉴定标本中有无相应的病原微生物基因及其分子大小 二、核酸扩增技术 3、分子生物学技术在细菌药敏试验中的应用： 检测耐药基因 第二节 细菌的分类单元和命名规则 一、分类单元及其等级：分类单元：是指具体的分类群。和 其他生物分类一样，细菌的分类单元也分为七个基本的分类等级或分类阶元，由上而下依次是界、门、纲、目、科、属、种。 1、种的概念：具有高度特征相似性的菌株群，这个菌株群与其它类群的菌株有很明显的区别。 2、亚种：当某一个种内的不同菌株存在少数明显而稳定的变异特征或遗传性而又不足以区分成新种时，可以将这些菌株细分成两个或更多的小的分类单元—亚种。 亚种是细菌分类中具有正式分类地位的最低等级。 3、亚种以下的等级：生物型、培养型、致病型、血清型、噬菌型、化学型、形态型等。 在细菌分类中，还常常使用非正式的类群术语。如培养物、菌株、居群和型 培养物（culture),是指一定时间一定空间内微生物的细胞群或生长物 菌株（strain)，从自然界分离得到的任何一种微生物的纯培养物都可以称为微生物的一个菌株 居群（population)是指一定空间中同种个体的组合 型（form或type)：常指亚种以下的细分，当同种或同亚种不同菌株之间的性状差异，不足以分为心的亚种时，可以细分为不同的型 。 生物型 biovar biotype 特殊的生理生化性状的菌株群 血清型 serovar serotype 不同的抗原特征的菌株群 致病型 pathovar pathotype 对宿主致病性的差异的菌株群 噬菌型 phagovar phagotype lysotype 对噬菌体有特异性反应的菌株群 形态型morphovar morphotype 特殊的形态学特征的菌株群 4、属：是介于种（或亚种）与科之间分类等级，也是生物分类中的基本分类单元。通常把具有某些共同特征或密切相关的种归为一个高一级的分类单元，称之为属。 5、科：把具有某些共同特征或相关的属归为更高一级的分类单元称为科。 二、细菌分类单元的命名规则 (一)国际细菌命名法规 1、分类单元的命名法 (1)属名 用一个单数主格名词或当作名词用的形容词来表示，可以是阳性、阴性或中性，首字母要大写。 如：Bacillus(芽胞杆菌属)(阳性) Lostridium(梭菌属)(中性) Salmonella(沙门氏菌)(阴性) (2)种名 双名法命名 由属名和种名两部分组合而成。第一个词为属名，首字母要大写；第二个词为种名词，常用形容词，也可以用人名、地名、病名或其他名词(名词用主格或所属格形式)，种名加词首字母不大写。例： Pseudomonas aeruginosa(铜绿色假单胞菌) Mycobacterium tuberculosis(结核分枝杆菌) Bacillus thuringiensis(苏云金芽胞杆菌) (3)亚种名 由属名、种名加词和亚种名加词构成 如：Alcaligenes denitrificans subsp.xylosoxydans (反硝化产碱杆菌氧化木糖亚种) (4)属以