第二章分类与命名1预案.ppt

第二章 病毒的分类与命名 为何要进行病毒的分类和命名 俗名法：如西尼罗河病毒， 如何进行病毒的分类 1961年以前的病毒分类 1935年的植物病毒的分类标准 传播方式及昆虫媒介,宿主,体外存活期,致死温度和症状 1937年 Levaditi和Lepine就曾根据病毒对组织的亲和性进行分类 1944年引入了生物分类法,出现了目、科、属及种 病毒目下有细菌、植物及动物病毒亚目 1950-1954年引入病毒形态、传播方式及晶体结构 将植物病毒分为①可摩擦传播的球形及近球形的可结晶②昆虫及摩擦传播的杆状或线条状及近球形颗粒，可形成针状结晶 1956年又突出了传播方式：如蚜传、叶蝉传、无介传及介传等病毒目 动物病毒分类法 按照胚胎学及组织嗜性分8个群(外胚层（FMD）、中内（canary-pox virus ) 侵害部位及病症及媒介分10个群 昆虫病毒分类 包涵体的有无及形状分为4个属 以上结合细胞定位分为4个属 包涵体分类的基础上，结合病毒形态分为2大类群、5个属。 病毒分类的机构： ICNV（international committee on Nomenclature of Virus）——国际病毒命名委员会（1966年） ICTV（international committee on Taxonomy of Virus）——国际病毒分类委员会（1973年） ICTV发布病毒分类报告的次数及时间 第七次与第八次病毒分类报告的内容变更 病毒的分类原则 （1）核酸的类型、结构及相对分子质量； （2）病毒的形状和大小； （3）病毒体的形态结构； （4）病毒体对乙醚、氯仿等脂溶剂的敏感性； （5）血清学性质和抗原关系； （6）病毒在细胞培养上的特性； （7）除脂溶剂外对其他化学和物理因子的敏感性； （8）流行病学特点。 命名 病毒是通过它们在寄主上引起病害才被认识的 植物病毒：寄主+症状（俗名） ；寄主+病害+病毒 动物病毒：寄主症状（麻疹病毒）；感染部位（鼻病毒）；传播方式（呼吸道病毒）；寄主种类（野兔痘病毒）；发现者姓名（劳斯氏肉瘤病毒）；发生或发现地（新疆出血热）；一个病毒多名（乙型肝炎病毒，血清性肝炎，输血后肝炎） 噬菌体命名：代号符号命名法，如噬菌体T2、T4 病毒分类命名及书写规则(41条) （一）一般规则 （1）病毒分类和命名应该是国际性的，并且普遍适用于所有的病毒。（2）国际病毒分类系统采用目（order）、科(family)、亚科(subfamily)、属(genus)、种(species)、分类阶元。（3）ICTV不负责病毒种以下的分类和命名，病毒种以下的血清型、基因型、毒力株、变异株和分离株的名称由公认的国际专家小组确定。（4）人工产生的病毒和实验室构建的杂种病毒在病毒分类上不予考虑，它们的分类由公认的国际专家小组负责。（5）分类阶元只有在病毒代表种的特性得到了充分了解和在公开出版物上进行过描述，以致于明确了它们的分类地位，并使其分类阶元与其他类似的分类阶元相区别时，才能确定下来。（6）当病毒有明确的科、而分属未确定时，这一病毒种在分类学上称为该科的未确定种（unassigned species）。（7）与规则2各分类阶元相关联，并得到ICTV批准的名称是唯一可以接受的。 （二）关于分类单元的命名规则 （16）如果所建议的候选名（candidate name）不只一个时，那么相关下属委员会应该首先向ICTV常务委员会作出推荐，然后由ICTV常务委员会决定哪一个候选名是可以接受的。（17）当某一分类阶元建议缺少适当的名称时，这一分类阶元仍然可以被批准，其待定名将保留至有一个建议名称ICTV接受为止。（18）由于所选用的病毒名称完全或部分不隐含分类阶元的任何意义，这样就会出现下列不同的情形：① 一些病毒因名称或缺少描述特征而从表面上看是排斥在该分类阶元中，但它们却是这一已命名的分类阶元成员；② 一些迄今尚未描述的病毒似乎是排斥在该分类阶元中，但它们却可能属于这一已命名的分类阶元；③一些病毒表面上看来是属于这一分类阶元，但它们却又是其他不同分类阶元的成员。（19）新分类阶元名称的选用应考虑国家或地区敏感性的问题，当一些名称已被病毒学工作者在公开出版物上广为使用时，该名称或其派生名称应该是命名的优先选择，而不应该考虑这一名称源自哪一个国家。（20）名称的改变、新名称以及分类阶元的设立和分类阶元的排列的建议应该正式提交给ICTV常务委员会，在作出决定之前，ICTV下属委员会和研究小组应该进行充分协商。 （三）关于种的规则 （21）病毒种是指构成一个复制谱系(replicating lineage)，占据一个特定小生境（ecological niche），具有多原则分类(polythe