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11 转录前的基因活化 基因表达调控的层次 DNA 水平的调控 基因丢失 基因丢失(续) 基因丢失(续) DNA 水平的调控 基因扩增(续) 基因扩增(续) 基因扩增(续) DNA 水平的调控 基因重排 基因重排 基因重排 鼠胚系Ig基因的构成 人胚系Ig基因的构成 小鼠Igμ重链的基因重排、转录与合成的顺序 小鼠Igμ重链的基因重排、转录与合成的顺序(续) 小鼠Igκ轻链的基因重排、转录与合成的顺序 小鼠Igμ重链的基因重排、转录与合成的顺序(续) 图11-1 真核生物染色体的组装模式 常染色质和异染色质 DNase Ⅰ超敏感位点 常染色质,示活性染色质和非活性染色质及DNaseⅠ超敏感位点 H1组蛋白的修饰 核心组蛋白修饰 非组蛋白修饰 核基质 基质附着区 基质附着区(续) 图11-3 MAR与核基质的相互作用 图11-4 活体或离体两种方法检测MAR(1) 图11-4 活体或离体两种方法检测MAR(2) MARs在基因表达中的作用 图11-7 侧向构建有MAR的转基因形成独立活性结构区 图11-6 基质附着区(MARs)功能分析 MARs 的调节作用 MARs 的调节作用(续) DNA甲基化 DNA甲基化的作用 限制性内切酶对甲基化和非甲基化CCGG的切割 图11-9 DNA复制时甲基化类型的传递 DNA甲基化与基因表达 甲基化对基因表达的影响机理 图11-11 看家基因的CpG岛和启动子 DNA甲基化的进化 与核基质结合 活体方法 离体方法 提取的DNA跑两个泳道,用特异的DNA探针检测其中一个泳道,看是否有特异的MAR片段 活体方法 离体方法 MARs在基因表达中可能有4种作用: ① 边界元件作用,它确定了独立的基因调节区域。 ② 染色质调节作用,MARs作为刺激或阻遏基因表 达的顺式作用元件,可促进调节蛋白的结合和 作用。 ③ 作为DNA复制起点的组成起作用。 ④ 对于有丝分裂中期染色体的组装并保持一定形状 是重要的。 MARs的边界作用 1kb DNA β-云扁豆蛋白基因 增强子不能促进表达 增强子激活了表达 MARs的边界作用 当用一个异源的酵母ARS1 MAR作为侧翼的GUS(β—葡糖苷酸酶)报告基因转入烟草细胞,使报告基因的表达水平提高了12倍,最高达24倍。而改用来自烟草内源的与核基质结合较强的R67 MAR替换上述与核基质结合较弱的酵母ARS1 MAR时,GUS的表达水平提高了60倍,最高达140倍。这说明与核基质结合力较强的MAR比结合力较弱的MAR对基因表达的影响较大。 在对番茄热激蛋白基因表达的研究中发现,只有在3’MAR、5’MAR及内含子均存在的情况下基因正常表达,缺少其中一个将大大降低基因表达。这说明基因侧翼的MARs和内含子对于基因表达的调控有关。 在真核生物DNA中,甲基化发生在胞苷酸残基胞嘧啶环的5位碳原子上。甲基化位点通常在CG序列上。对于植物来说,甲基化还能在CNG序列的C上发生。 —— CG —— —— CNG —— —— GC —— —— GNC —— 在上述序列中,如果一个位点上只有一条链的C被甲基化,称为半甲基化;如果一个位点两条链的C都被甲基化,称为完全甲基化。 一般认为,高度甲基化的区域是不转录区域。 甲基化能防止相关限制酶的切割作用,还能阻碍调节蛋白与之结合,在基因启动子和编码区的甲基化可能抑制转录。 植物DNA甲基化主要存在于核基因组。 不对称序列的甲基化,新合成的子链不甲基化。 高度甲基化基因的表达受到抑制。由于不同的基因在不同的器官或不同的发育阶段表达,其甲基化状况也发生相应的变化。如雌性哺乳动物的一条X染色体高度甲基化,而以非活性状态存在;珠蛋白基因在红细胞中是低甲基化的,而在不表达珠蛋白的其他细胞中则高度甲基化;管家(看家、持家)基因(housekeeping gene)是持续表达的,其转录起始区很少发生甲基化。实验表明,低甲基化区域与DNaseⅠ超敏感区域是十分吻合的。 * 11.1 DNA水平的调控 11.2 染色质结构与基因活化 11.3 核基质附着区与基因表达 11.4 DNA甲基化在调节基因表达中的作用 基因表达受发育阶段及环境因素的影响。生物体对基因表达的调控有许多的层次,如转录前的基因活化、转录过程、转录后的RNA加工成熟过程、翻译过程、翻译后的多肽加工过程。这些过程对于生物生长发育是非常重要的。 某些原生动物、线虫和甲壳类动物在个体发育中,体
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