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(第十一章RNA的生物合成
第十一章 RNA的生物合成
Chapter 11 RNA Biosynthesis,
生物界,RNA合成有两种方式:
一是DNA指导的RNA合成,也叫转录,此为生物体内的主要合成方式,也是本章介绍的主要内容。
另一种是RNA指导的RNA合成(RNA-dependent RNA synthesis),也叫RNA复制(RNA replication), 由RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase)催化,常见于病毒,是逆转录病毒以外的RNA病毒在宿主细胞以病毒的单链RNA为模板合成RNA的方式。
重点内容
掌握不对称转录、模板链和编码链的概念。
(二)掌握原核生物RNA聚合酶的全酶及核心酶 的组成;熟悉模板与酶的辨认结合,启动子的 概念。了解-35区、-10区、上游、下游序列 等概念,以及两区的作用特点。
(三)熟悉原核生物的转录起始,转录的方向, 原核生物的转录终止分两种方式。了解原 核生物RNA合成的过程。
(四)熟悉真核生物的RNA聚合酶的分类,作 用特点以及各自相应的产物;了解真核生 物转录过程。
(五)掌握断裂基因、内含子、外显子的概念;
(六)熟悉真核生物mRNA,tRNA的修饰过程。
复制与转录的相同点:
①都是酶促的核苷酸聚合过程
②以DNA为模板
③遵循碱基配对原则
④都需依赖DNA的聚合酶
⑤聚合过程都是生成磷酸二酯键
⑥新链合成方向为5’→3’
原核生物转录的模板和酶
Section 1 Templates and Enzymes in Prokaryotic Transcription
原核生物转录的模板
DNA分子上转录出RNA的区段,称为结构基因(structural gene)。
转录的这种选择性称为不对称转录(asymmetric transcription),它有两方面含义:
在DNA分子双链上,一股链用作模板指引转录,另一股链不转录;
模板链并非总是在同一单链上。
全称:依赖DNA的RNA聚合酶(DDRP)。
RNA合成的化学机制与DNA聚合酶催化DNA合成相似,沿5‘→3’聚合RNA。
DNA聚合酶在启动DNA链延长时需要引物存在,而RNA聚合酶不需要引物就能直接启动RNA链的延长。
RNA聚合酶和DNA的特殊序列——启动子(promoter)结合后,就能启动RNA合成。
原核生物中的RNA聚合酶全酶由五个亚基构成,即?2??‘?(ω),分子量达480kD 。
?亚基能引导RNA-pol 稳定的结合在DNA启动子上。
?亚基存在对核心酶的构象有较大影响,能导致RNA-pol 与DNA上的一般序列和启动子序列的亲和力有很大不同:
极大降低了酶与DNA一般序列的结合常数,和停留时间,同时又增加了酶与启动子的亲合力和停留时间
其他原核生物的RNA聚合酶,在结构、组成、功能上均与E.coli相似。
抗结核药利福平或利福霉素可专一性地结合RNA聚合酶的β亚基,抑制RNA合成。
原核生物一个转录区段可视为一个转录单位,称为操纵子(operon),包括若干个结构基因及其上游(upstream)的调控序列。
启动子(启动序列,promoter)是RNA聚合酶结合并起动转录的特异DNA序列。
启动子(promoter)是调控序列的一部分,控制转录的关键部位,决定着基因的表达强度。
第三节 原核生物RNA转录合成的过程
一、转录起始需要RNA聚合酶全酶
RNA聚合酶必须准确地结合在转录模板的起始区域。
DNA双链解开,使其中的一条链作为转录的模板。
转录起始过程:
1. RNA聚合酶全酶(a2s¢bb)与模板结合,形成闭合转录复合体(closed transcription complex) ;
2. DNA双链局部解开,形成开放转录复合体(open transcription complex) ;
3. 第一个NTP加入,形成转录起始复合物:
DNA双链解开的范围只有≈ 17bp,比复制叉小得多。
转录起始生成RNA的5’总是GTP,且保留三个磷酸基团
第一个磷酸二酯键生成后,σ亚基即从转录起始复合物上脱落,核心酶连同四磷酸二核苷酸,继续结合于DNA模板上,酶沿DNA链前移,进入延长阶段。
二、 原核生物的转录延长时蛋白质的翻译也同时进行
?亚基脱落,RNA–pol聚合酶核心酶变构,与模板结合松弛,沿着DNA模板前移;
在核心酶作用下,NTP不断聚合,RNA链不断延长。
三、原核生物转录终止分为依赖ρ(Rho)因子与非依赖ρ因子两大类
转录终止指RNA聚合酶在DNA模板上停顿下来不再前进,转录产物RNA链从转录复合物上脱落下来。
依赖Rho (ρ)因子的转录终止
非依赖Rho因子的转录终止
(一)依赖ρ因子的转录终止
ρ
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