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6 遗传密码
6.1 mRNA与遗传密码
蛋白质是由20种氨基酸组成的,不同的蛋白质中氨基酸排列顺序不同,这种排列顺序是按基因中碱基顺序决定的。
基因的遗传信息在转录过程中从DNA转移到mRNA,再由mRNA将遗传信息表达为蛋白质中氨基酸顺序的过程称翻译。即蛋白质的生物合成过程。
6.1.1 mRNA
1956~1961年Jacob等四个实验室用T4噬菌体感染大肠杆菌,发现了真正的模板。T4噬菌体感染后,宿主细胞E. coli的RNA合成停止,转录出的RNA仅来源于T4 DNA,T4 RNA的碱基组成不仅与T4 DNA非常相似,而且能与tRNA和E. coli核糖体结合指导合成蛋白质。因为T4 RNA携带了T4 DNA的遗传信息,所以称为mRNA (messenger RNA)。
现已纯化了许多真核细胞mRNA,并测定了一些mRNA的序列。mRNA都有合成一种多肽链的信息,具有共同的结构特征。如成熟的卵清蛋白mRNA含1859nt。5’端有“帽子”,3’端含poly A。在5’端非翻译序列(64nt)和3’端非翻译序列(637nt)间是编码区(1158nt)。
原核细胞每个mRNA分子带有多个功能相关蛋白质的编码信息,以多顺反子形式排列,可翻译出几种蛋白质。原核mRNA半衰期很短,一般只有2min。
真核细胞每个mRNA一般只带一种肽链编码信息,是单顺反子的形式。mRNA半衰期为1~24hr。
不同的蛋白质有各自不同的mRNA,mRNA除含有编码区外,两端还有非编码区。
非编码区对于mRNA的模板活性是必需的,特别是5’-端非编码区在蛋白质合成中可能是与核糖体结合的部位。
基因中各种序列的一般排列次序为:启动子-5’-端非编码区-编码区-3’-非编码区–终止子。
6.1.2 遗传密码
遗传密码(Genetic code)是DNA上核苷酸与蛋白质中的氨基酸的对应关系。也是mRNA中蕴藏遗传信息的碱基顺序。
mRNA中的4种碱基组成的密码子代表了20种氨基酸,同时决定了翻译过程的起始与终止位置。
所有多肽链都从AUG,终止密码子是UAA、UAG及UGA。
mRNA分子上以5’→3’方向,从AUG开始每3个连续的核苷酸(三联体)组成一个密码子(codon),决定一种氨基酸。
DNA上从起始密码子至终止密码子间的一段序列称为一个开放读框(open reading frame,ORF或可读框)。
每种氨基酸至少有一种密码子,最多的有6种密码子。通过遗传学和生物化学实验,1966年编排出遗传密码表。
6.2 体外翻译系统
在生物体内,蛋白质合成过程中需要200多种生物大分子参加,包括核糖体、mRNA、tRNA及多种蛋白质因子。
蛋白质体外合成实验
用活跃进行蛋白质合成的大肠杆菌制备细胞提取液,并用放射性同位素标记(3H、14C、35S)的氨基酸以研究氨基酸掺入到蛋白质中的情况。
低温破碎迅速生长的大肠杆菌细胞,离心收集细胞液,加入DNase破坏DNA;在含有核糖体、mRNA、tRNA及酶的细胞液中加入ATP,GTP和放射性氨基酸,于37℃保温不同时间;沉淀蛋白质,从沉淀的放射活性测出氨基酸掺入蛋白质的量。
由于在提取液中存在RNase使mRNA分解,合成一般只进行几min便逐渐减慢以至停止。
如果加入新的mRNA于已停止合成蛋白质的提取液,又可重新开始合成。这证明无细胞体系也可以进行蛋白质的合成。同时,蛋白质合成需要mRNA作为模板。而且用已停止合成蛋白质的提取液,加入不同的mRNA,都可进行蛋白质的合成。
1962年,用E. coil提取液进行体外合成实验,加入细菌病毒f2的RNA,合成了与天然f2蛋白完全相同的蛋白质。证明在体外条件下可准确地按mRNA的遗传信息合成相应的蛋白质。
现在已用无细胞系统合成多种病毒和细菌蛋白以及哺乳动物蛋白(如血红蛋白、轻链和重链免疫球蛋白、肌动蛋白、胶原蛋白、肌球蛋白等),证明高等生物蛋白也能在体外合成。
无细胞翻译体系自身的mRNA可被自解,在加入外源mRNA(人工合成模板)则可利用无细胞翻译体系的蛋白质合成组分,研究mRNA的编码情况。
用于蛋白质的生物合成研究的体外翻译系统主要有:细菌(大肠杆菌)无细胞系统、动物无肝细胞系统、网织红细胞裂解系统和麦胚系统等。只要加入外源mRNA模板,则可进行体外翻译。
6.3 遗传密码的破译
基因密码的破译是多位科学家从五十年代开始,先后经过了数学推理和一系列实验研究,于1966年才解决了这个问题。
6.3.1 遗传密码的推测阶段
1954年物理学家George Gamov提出遗传密码的问题,并根据DNA中有4种核苷酸和蛋白质中有20种氨基酸的对应关系,推理认为3个核苷酸为一个氨基酸编码,可编64种氨基酸(43=64)是最理想的。因为在有四种核苷酸条件下,64是
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