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ITK及其在医学图像分割中的应用
ITK及其在医学图像分割中的应用
摘要:ITK (The Insight Toolkit) 是一个开放的、面向对象的类库。它提供了强大的二维医学图像处理功能,主要用于医学图像的预处理、分割及配准。本文主要介绍图像分割的算法以及ITK在图像分割中的应用,并简要介绍一个基于ITK的医学图像处理的实现。
关键字:面向对象程序设计;ITK;图像分割;
ITK and its application of medical image segmentation
Abstract: ITK(The Insight Toolkit) is an open-source, object-oriented insight class libraries. It provides a powerful two-dimensional medical image processing functions, mainly for the purposes of medical image preprocessing, segmentation and registration. This paper introduces the algorithm of image segmentation and application of ITK in medical image segmentation, also briefed on a medical image processing is achieved.
Key word: object-oriented programming; ITK; image segmentation;
引言
随着现代信息技术的进步,医学图像处理与分析系统得到迅速的发展,它能够有效地辅助医生对医学图像进行定性或定量的分析,提高诊断的准确性和科学性,因此在手术模拟、医学教学以及医学研究中发挥着重要的作用。
图像分割是对图像进行进一步分析和处理的基础,是图像处理中的关键技术,所以医学图像分割是医学领域中的一个重要的领域,对医学图像进行分割是病变区域提取、特定组织测量以及实现三维重建的基础。图像分割是指将图像中具有特殊涵义的不同区域区分开来,这些区域应当是互不相交的,每一个区域都满足特定区域的一致性。
但是随着医学影像技术在许多领域的广泛应用,也暴露出一些亟待解决的问题,因为对于许多并不是专业从事医学影像研究的科研人员来说,虽然他们对于医学影像也有很强烈的需求,但是由于对医学影像处理程序的开发并不熟悉,因此会遇到许多的困难。如果能有一个专门的医学影像软件平台,尤其是底层的算法研发平台,能够简化医学影像程序的开发,将会极大的提高工作效率。
本文介绍的ITK是一个用于医学图像分割与配准的开放源码的软件开发包。它提供了一些主流算法,如区域增长、阈值分割、基于分水岭的分割、Fast Marching算法、Level Set(水平集)等多种分割方法,并将这些用于医学图像处理的算法和程序的开发过程屏蔽起来。以类库的形式给我们的开发工作以直接的支持,大大的简化了开发工作,并且提高了开发效率。
ITK简介
ITK是一个开放的、面向对象的类库,它主要提供了医学图像分割和配准的算法平台,大量使用了1998年以后ANSI C++标准里面的新特性,尤其是模块,它是基于范式编程这种思想来设计和实现的。
ITK也支持跨平台开发支持Windows、Unix、Linux等多种平台,它将程序开发过程中会经常遇到的细节屏蔽起来,并将一些常用的算法封装起来。
ITK采用Pipeline机制,它可以处理任何类型的数据,可以用相应的类对任何类型的数据进行转换和处理,根据所要处理的原始数据类型的不同和所使用的算法以及所要达到的结果我们可以设计和建立起自己的流程,并由此选择不同的数据处理和转换的类,用数据通道将这些类连接起来,将原始数据类型转换为所采用的算法模块可以直接进行处理的数据类型,最终得到我们所需要的结果,而且所有的类和算法模块都是可扩充的,用户可以将自己开发的类或模块转换成系统可以接受的形式,并可替换或扩充原有的类。
由于一些历史的原因,ITK没有实现可视化的功能,在VTK中可以实现可视化,所以医学影像系统中,在用ITK进行分割的基础上,结合VTK对图像进行可视化处理。
医学图像分割算法
在医学图像处理系统中,断层扫描仪产生有关人体内部结构的数字图像数据,在这些图像中,包含了某些物体,如某种人体器官。为了分析这些物体的形状、形态和其功能,或对其进行可视化处理,有必要先将其从
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