关于MPI三个不同侧面的定义.pptVIP

* * * * MPI并行程序设计 * 提纲 1. MPI的定义 2. 系统配置 3. MPI编程解析 4. MPI实例 * 提纲 1. MPI的定义 2. 系统配置 3. MPI编程解析 4. MPI实例 * MPI的定义 关于MPI三个不同侧面的定义 对MPI的定义是多种多样的，但不外乎下面三个方面，它们限定了MPI的内涵和外延。 (1)MPI是一个库，而不是一门语言。 许多人认为MPI就是一种并行语言，这是不准确的。但是按照并行语言的分类，可以把FORTRAN+MPI或C+MPI，看作是一种在原来串行语言基础之上扩展后得到的并行语言。 MPI库可以被FORTRAN77/C/Fortran90/C++调用，从语法上说，它遵守所有对库函数/过程的调用规则，和一般的函数/过程没有什么区别。 * MPI的定义 (2) MPI是一种标准或规范的代表，而不特指某一个对它的具体实现。迄今为止，所有的并行计算机制造商都提供对MPI的支持，可以在网上免费得到MPI在不同并行计算机上的实现(mpich/chimp/lam)，一个正确的MPI程序，可以不加修改地在所有的并行机上运行。 (3)MPI是一种消息传递编程模型，并成为这种编程模型的代表和事实上的标准。 MPI虽然很庞大，但是它的最终目的是服务于进程间通信。 * 提纲 1. MPI的定义 2. 系统配置 3. MPI编程解析 4. MPI实例 * 系统配置 必须的软件包 mpich2-*.*.tar.gz (/pub/mpi/) binutils (autoconf, automake) C compiler 如果你需要用Fortran-77、Fortran-90、C++编写MPI程序，则必须安装相应的编译器 Python 2.2 or later * 系统配置 安装 ./configure --prefix=/usr/local/mpich2 --enable-sharedlibs=gcc make make install 设置环境变量 vim $HOME/.bashrc export PATH=/usr/local/mpich2/bin:$PATH [root@node01 bin]# which mpd /usr/local/mpich2/bin/mpd * 系统配置 MPICH密令配置 mpd是mpi的进程管理器，欲启动mpi作业需首先对mpd进行配置，设置好mpd环相互通信的密令 vim /etc/mpd.conf MPD_SECRETWORD=yourword chmod 600 /etc/mpd.conf * 系统配置 本地运行程序测试 [root@node01 bin]# mpd [1] 2969 [root@node01 bin]# mpdtrace -l node01_38927 (71) [root@node01 bin]# mpiexec -n 1 /bin/hostname node01 [root@node01 bin]# mpdallexit [root@node01 bin]# * 系统配置 在一组结点上建立mpd环 配置 vim $HOME/mpd.hosts vim /etc/hosts 交换密钥，使得登录结点无需输入密码 ssh-keygen –t rsa scp cat $HOME/.ssh/id_rsa.pub $HOME/.ssh/authorized_keys scp /etc/mpd.conf 启动 mpdboot -n number to start -f mpd.hosts * 系统配置 查看mpd环的信息 [root@node01 ~]# mpdboot -n 10 -f mpd.hosts [root@node01 ~]# mpdtrace -l node01_52737 (71) node05_57874 (75) node10_46474 (80) node04_44059 (74) node03_39268 (73) node02_41483 (72) node08_57202 (78) node09_45880 (79) node07_54456 (77) node06_37627 (76) * 系统配置 运行及调试MPI作业 mpiexec –n {process_num} –host {host_name} executable mpiexec –gdb mpiexec --help mpdlistjobs * 提纲 1. MPI的定义 2. 系统配置 3. MPI编程解析 4. MPI实例 C语言MPI