计算机在生命科学中的应用报告1.doc

16srRNA的点阵分析报告 前言： 序列比对是生物信息学研究的一个基本方法，对于发现生物序列中的功能、结构和进化信息具有重要的意义 ringency =50 window =100 16srRNA横坐标：链球菌mutans16SrRNA基因序列 16srRNA2纵坐标：运动发酵单胞菌subsp mobilis部分的16srRNA基因序列 图像分析：由上图可以看出，在对角线上有一条明显的实线，说明链球菌与运动发酵单胞菌有很近的亲缘关系，同时在A点处出现了水平位移，说明在该处运动发酵单胞菌与链球菌相比发生了插入突变，对角线方向上出现了两处间断，说明在这两处发生了缺失。 :ringency 46 window 100 16sRNAa横坐标：链球菌mutans16SrRNA基因序列 16SRNA3纵坐标：霍乱弧菌局部的16srRNA基因序列 图像分析：由上图可以看出，在对角线上有一条明显的实线，说明链球菌 与霍乱弧菌有很近的亲缘关系，在实线上只有两处间断，没有水平或垂直的位移，说明霍乱弧菌与链球菌相比，基因发生了两处缺失，没有插入或删除。 :ringency 53 window 100 16sRNAa横坐标：链球菌mutans16SrRNA基因序列 16sRNA4纵坐标：嗜热脂肪地芽孢杆菌局部的16srRNA基因序列 图像分析：由上图可以看出，在对角线上有一条明显的实线，说明链球菌与嗜热脂肪地芽孢杆菌有很近的亲缘关系，在实线上A点有一处间断，没有水平或垂直的位移，说明嗜热脂肪地芽孢杆菌与链球菌相比，基因发生了一处缺失，没有插入或删除。 :ringency 50 window 100 16sRNAa横坐标：链球菌mutans16SrRNA基因序列 16sRNA5纵坐标：肠球菌局部的16srRNA基因序列 图像分析：由上图可以看出，在对角线上有一条明显的实线，说明链球菌与肠球菌有很近的亲缘关系，在实线上A点处有一处间断和B点处一小段重叠，没有水平或垂直的位移，说明嗜热脂肪地芽孢杆菌与链球菌相比，基因在A处发生了缺失，在B处发生基因重复，没有插入或删除， :ringency 40 window 100 16sRNAa横坐标：链球菌mutans16SrRNA基因序列 melmttrna纵坐标：爪哇根结线虫的16srRNA基因序列 图像分析：由上图可以看出，对角线上几乎看不出有明显的实线，说明链球菌与爪哇根结线虫的亲缘关系很远，爪哇根结线虫与链球菌相比，16srRNA的基因发生了较大的改变。 :ringency 45 window 100 16sRNAa横坐标：链球菌mutans16SrRNA基因序列 sulfolobus纵坐标：硫磺矿硫化叶菌p2完全基因组序列 图像分析：由上图可以看出，对角线上有一条不明显的实线，说明硫磺矿硫化叶菌p2与链球菌的亲缘关系较远，对角线为一些断断续续的点，说明基因发生了较大的突变。 :ringency 50 window 100 16sRNA2横坐标：运动发酵单胞菌subsp mobilis部分的16srRNA基因序列 16sRNA3纵坐标：霍乱弧菌局部的16srRNA基因序列 图像分析:由上图可以看出,对角线上有一条明显的实线，说明运动发酵单胞菌与霍乱弧菌有较近的亲缘关系，同时可以看出，在对角线的A点和B点各有一处垂直方向上的位移，说明霍乱弧菌与运动发酵单胞菌相比，在这两处上发生删除突变，在C点有一间断，说明在此处发生了基因缺失。 :ringency 50 window 100 16sRNA2横坐标：运动发酵单胞菌subsp mobilis部分的16srRNA基因序列 16sRNA4纵坐标 ：嗜热脂肪地芽孢杆菌局部的16srRNA基因序列 图像分析：由上图可以看出,对角线上有一条明显的实线，说明运动发酵单胞菌与嗜热脂肪地芽孢杆菌有较近的亲缘关系，同时可以看出，在对角线的A点和B点各有一处垂直方向上的位移，说明嗜热脂肪地芽孢杆菌与运动发酵单胞菌相比，在这两处上发生删除突变，在C点有一间断，说明在此处发生了基因缺失。 :ringency 50 window 100 16sRNA2横坐标：运动发酵单胞菌subsp mobilis部分的16srRNA基因序列 16sRNA5纵坐标 ：肠球菌种局部的16srRNA基因序列 图像分析：由上图可以看出,对角线上有一条明显的实线，说明运动发酵单胞菌与肠球菌有较近的亲缘关系，同时可以看出，在对角线的A点和B点各有一处垂直方向上的位移，说明肠球菌与运动发酵单胞菌相比，在这两处上发生删除突变，在C点有一间断，说明在此处发生了基因缺失。 :ri