基因组 Microsoft PowerPoint 演示文稿.ppt

先将染色体打成比较大的片段(几十-几百Kb), 利用分子标记将这些大片段排成重叠的克隆群(Contig), 分别测序后拼装. 这种策略叫基于克隆群(contig-based)的策略. A B C A B C 大片段contig 小片段测序拼装 遗传图谱 遗传图谱（genetic map）又称连锁图谱（linkage map），是表示基因或DNA标志在染色体上以遗传距离表示的相对位置，反映染色体上两点之间的连锁关系。遗传距离通常以基因或DNA片段在染色体交换过程中分离的频率里摩（cM）来表示。 重组值=新组合/（亲本组合+新组合） 物理图谱 物理图谱（physical map）指DNA序列上两点之间的实际距离。 基因或DNA标记之间的物理距离以核苷酸数目的多少来表示。物理图谱是进行DNA序列分析和基因组织结构研究的基础。 转录图谱 转录图谱（transcription map）又称cDNA（complementary DNA）计划或基因图谱。 在整个人类基因组中，只有不到5%的DNA序列为编码蛋白质的序列，因此，确定编码蛋白质的序列及其在基因组中的位置，才是真正的人类基因图谱。利用这份图谱，我们才能掌握人类基因的准确数目、每一个基因的序列及其在基因组中的位置，从而进一步的分析基因产物的功能及其与疾病的关系。 基因组序列分析 人类基因组计划最终要测定出由3×109 bp核苷酸组成的人基因组DNA的全部序列。随着全新测序技术与策略的参与，这项工作的进度大大加快，已远远超越了原定计划的时间表。 DNA分子标记的发展 1．限制性片段长度多态性 (restriction fragment length polymorphism, RFLP) 第一代DNA标记,1980年提出来的 用同一个限制性核酸内切酶消化不同个体的同一段DNA时,会得到长度不同的限制性片段,称为RFLP。 2. 微卫星DNA多态性 第二代DNA标记，1989年被发现和建立的 重复单位长度为2~6个核苷酸，被称为短串联重复STR (short tandem repeat) ，长度为 100~200kb 优点： （1）具有高度多态性，（CA)n等简单重复不受进化上的选择，因而在同位点中数目变化很大，在人群中因重复次数不同而产生等位片段，可形成多达几十种的等位片段 （2）在基因组中出现的频率很高，分布很广 （3）重复序列两侧的特异性单拷贝序列可作为基因组中定点的标记 3. 单核苷酸多态性 ( SNP) SNP是指出现在基因组DNA分子的特定位置的单核苷酸的置换。 SNP位点必须满足该位点的变异在人群中出现的频率大于1%。 在人类任意两个个体基因组中，平均每1000bp至少就会有一个常见SNP位点。 人的基因组中可能存在的SNP数目10万个。 任何两个个体之间所存在的基因组序列差异仅为0.1%。而人DNA变异的90%是由SNP贡献的 。 hppt///SNP/ 求职应注意的礼仪 求职时最礼貌的修饰是淡妆 面试时最关键的神情是郑重 无论站还是坐，不能摇动和抖动 对话时目光不能游弋不定 要控制小动作 不要为掩饰紧张情绪而散淡 最优雅的礼仪修养是体现自然 以一种修养面对两种结果 必须首先学会面对的一种结果----被拒绝 仍然感谢这次机会，因为被拒绝是面试后的两种结果之一。 被拒绝是招聘单位对我们综合考虑的结果，因为我们最关心的是自己什么地方与用人要求不一致，而不仅仅是面试中的表现。 不要欺骗自己，说“我本来就不想去”等等。 认真考虑是否有必要再做努力。 必须学会欣然面对的一种结果----被接纳 以具体的形式感谢招聘单位的接纳，如邮件、短信 考虑怎样使自己的知识能力更适应工作需要 把走进工作岗位当作职业生涯的重要的第一步，认真思考如何为以后的发展开好头。 Thank you 第二章 基因组 基因组(genome)是指细胞或生物体中一套完 整单倍体的遗传物质的总和。 不同生物基因组所含的遗传信息量有巨大的差别 基因组的大小通常以一个基因组的DNA含量来表示，单倍体基因组中全部DNA的量称为C值（C-value) 大肠杆菌基因组 4.6x106 bp 酵母基因组 1.3x107 bp 哺乳动物基因组 109 bp 也有例外，如肺鱼 1011 bp 基因组的大小与基因的数目并没有直接的线性关系 基因组学