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多态性 随机婚配的群体中不同个体在等位基因拥有状态上存在的差别。即在一个特定的基因座位上以稳定的频率出现两种或两种以上的基因产物 人群中除同卵双生外，无关个体间HLA型别完全相同的可能性极小 意义：利---个体多样化，有利物种发展，利于法医 个体鉴定 弊---器官移植配体选择难 复等位基因（multiple alleles） 位于一对同源染色体上对应位置的一对基因叫等位基因。由于群体的突变，同一基因座的基因系列称为复等位基因，对某一个体来说一个基因座只有一对等位基因，复等位基因是群体的概念。HLA存在为数众多的复等位基因 共显性（codominant） 一对等位基因所控制的性状都表现出来，HLA每个基因座上的等位基因都是共显性 连锁不平衡 在某一群体中不同座位上某两个等位基因出现在同一条单元型上的频率与预期的随机频率之间存在明显差异的现象，称连锁不平衡 由于HLA不同基因座位的某些等位基因经常连锁在一起遗传，而连锁的基因并非完全随机地组成单元型，有些基因总是较多地在一起出现，致使某些单元型在群体中呈现较高的频率，从而引起连锁不平衡，可能与进化中的选择压力有关 肽结合区（peptide-binding region） α链的α1和α2结构域分别折叠成一个α螺旋和4条β片层并相互作用构成抗原结合槽。此槽结构特点为两端封闭状，只能容纳较短的抗原肽，一般为8-11个氨基酸残基。 免疫球蛋白样区（immunoglobulin-like region） 重链的α3片段起始于α2的羟基端，终止于插入的质膜部分，约由90个氨基酸残基组成。在HLA I类分子中，这个区域的氨基酸组成和序列具有高度的保守性，并与免疫球蛋白分子的恒定区同源。 α3片段含有一个与免疫球蛋白类似的二硫键连成的链内环，通过HLA分子突变分析证实，此区是与CD8分子相互作用的位置。 穿膜区（transmembrane region） 由α3结构域的羧基端约25个疏水性氨基酸残基组成，形成α螺旋穿过双层脂质的细胞膜，并锚在细胞膜上。 胞浆区(cytoplasmic region) 具有数个cAMP依赖的蛋白激酶和酪氨酸激酶的磷酸化位点。此外，在羧基端含有一个谷氨酰胺残基，作为转谷氨酰胺酶转肽作用的底物。 β2m和α3片段相同，与免疫球蛋白恒定区结构相似，含有由二硫键连成的环。 β2m和α1、α2、α3的相互作用对于稳定HLA I类分子的构象是关键因素，去掉β2m 则重链的构象改变。 不同种动物之间β2m很少有区别。其本身与HLA的抗原特异性无关，也不直接参与同抗原的结合，但对于α重链在细胞膜表面的表达以及执行其正常生理功能是必须的。此外，这种低相对分子质量的蛋白质可能与淋巴细胞转化有关。 HLA I类抗原分子的多态性主要位于形成两侧面的α螺旋结构上，与提呈抗原的功能相关；位于深槽外部和表面氨基酸是TCR识别的部位。上述发现是近年来基础免疫学中分子免疫学领域中最杰出的成就之一，为TCR识别MHC与加工处理的抗原复合物的理论研究和某些自身免疫性疾病的发病机理提供了重要依据。 肽结合区 类似于I类分子， HLA II类分子的抗原结合槽由两条链的α1和β1分别折叠成一个α螺旋和4条β片层相互作用而成。抗原结合槽两端呈现开放结构，故相对于I类分子， HLA II类分子能容纳较长的抗原肽，一般为10-30个氨基酸残基。 α2 和β2组成了HLA II类分子的免疫球蛋白样区维持II类分子的构型。 Β2还参与了和T细胞表面的CD4分子结合，促进CD4 T细胞的活化。 α2 和β2结构域的延伸部分形成HLA II类分子的跨膜区（25个疏水性氨基酸残基组成）和胞浆区。跨膜区的主要作用是将HLA II类分子锚定于细胞膜上。 抗原肽和HLA分子相互作用的分子基础 锚定位(anchor site) 锚定残基(anchor residue) 共同基序(consensus motif ) 一种HLA分子结合的不同抗原肽具有相同或相似的锚定位和锚定残基 抗原肽和HLA分子相互作用的特点 MHC限制性 T细胞只能识别由MHC分子结合提呈的抗原肽，即T细胞抗原识别受体在识别抗原时必须同时识别MHC分子。 相对特异性 共同基序 诱导T细胞成熟 阳性选择阴性选择 胸腺内成熟的细胞前体为CD4+CD8+双阳性细胞 MHC I类分子选择CD8复合受体，而使双阳性细胞表面CD4复合受体减少；MHC II类分子选择CD4复合受体，而使CD8复合受体减少。 经阳性选择后的胸腺细胞如识别DC或Mφ表面自身抗原与MHC复合物，即发生自身耐受而停止发育，而不能结合的则继续发育为识别外来抗原CD4+