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章节内容 第一节 通用分类单元 系统分类单元、种的概念、学名、亚种 第二节 微生物在生物界的地位 生物界级分类学说、五界系统、三域学说及其发展、※微生物的进化 第三节 各大类微生物的分类系统纲要 原核微生物分类系统纲要、真菌的分类系统纲要 第四节 微生物的鉴定 经典分类鉴定方法、现代分类鉴定方法。 《伯杰氏系统细菌学手册》第二版 分古细菌和真细菌2个界,下设18门、27纲、73目、186科,包括870余属和4900多个种。 界Ⅰ:古细菌(Archaeota) 部1:热变形菌、硫化叶菌、嗜压菌(Thermoprotei、Sulfolobi、Barophiles,21属36种) 部2:产甲烷菌(Methanogens,21属97种) 部3:盐杆菌(Halobacteria,14属50种) 部4:热原体(Thermoplasma,2属4种) 部5:热球菌(Thermococci,5属19种) 界Ⅱ:真细菌(Bacteria) 部6:产液菌(Aquifex)和相关细菌(3属5种) 部7:栖热袍菌(Thermotoga)和Geotogas,9属22种) 部8:异常球菌(Deinococci,1属8种) 部9:栖热菌和归属不明的属(Thermi,10属21种) 部10:产菌黄(Chrysiongenes,1属2种) 部11:绿屈挠菌和滑柱菌(Chloroflexi和Herpetosiphons,5属11种) 界Ⅱ:真细菌(Bacteria) 部12:热微菌(Thermomicrobia,1属2种) 部13:蓝细菌(Cyanobacteria,69属73种) 部14:绿菌(Chlorobia,6属17种) 部15:α-变形细菌(α-Proteobacteria,117属392种) 部16:β-变形细菌(β-Proteobacteria,53属204种) 界Ⅱ:真细菌(Bacteria) 部17:γ-变形细菌(γ-Proteobacteria,150属854种) 部18:δ-变形细菌(δ-Proteobacteria,39属128种) 部19:ε-变形细菌(ε-Proteobacteria,6属56种) 部20:梭菌(Clostridia)和相关细菌(73属403种) 部21:柔膜菌(Mollicutes,10属191种) 部22:芽胞杆菌和乳杆菌(Bacilli和Lactobacilli,55属535种) 界Ⅱ:真细菌(Bacteria) 部23:放线细菌(Actinobacteria,117属,1371种) 部24:浮霉状菌和衣原体(Planctomycetes和Chlamydia,5属14种) 部26:丝状杆菌(Fibrobacters,3属5种) 部27:拟杆菌(Bacteroides,20属130种) 界Ⅱ:真细菌(Bacteria) 部28:黄杆菌(Flavobacteria,15属72种) 部29:鞘氨醇杆菌(Sphingobacteria,22属76训) 部30:梭形菌(Fusoforms,6属29种) 部31:疣微菌和相关细菌(Verrucomicrobium,2属5种) 1、 API 细菌数值鉴定系统 2、 Enterotube 系统 3、 Biolog 全自动或手动细菌鉴定系统 2、Enterotube 系统 3、Biolog全自动或手动细菌鉴定系统 在96孔的细菌培养板上检测微生物对不同发酵性碳源利用情况进行的分类鉴定。 (二)伯杰氏系统细菌学手册 (Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology) 第一版 1984年问世,至1989年出齐,共4卷。 第二版 由George Garrity主编分为5卷,将从2000年起陆续出版。这一版纳入了研究核糖体RNA测序所产生的许发育)分类系统。 二 真菌(菌物)分类系统简介 Ainsworth et al(1973) V.Arx (1981) 真菌字典(1983) Kendrick (1992) 真菌字典(1995) AlexopoulosMins(1996) 黏菌门:黏菌纲 根肿菌纲真菌门: 鞭毛菌亚门:壶菌纲 丝壶菌纲 卵菌纲接合菌亚门:接合菌纲 毛菌纲子囊菌亚门:半子囊菌纲 不整囊菌纲 核菌纲 盘菌纲 腔菌纲 虫囊菌纲担子菌亚门 :冬孢菌纲 层菌纲 腹菌纲半知菌亚门: 芽孢纲 丝孢纲 腔孢纲 真 菌 界(1995) 第四节 微生物分类鉴定的方法 生物分类的传统指标 分子生物学指标 微型、简便、快
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