南京农业大学生物化学复习要点.doc

生化要点 ? 等电点是使氨基酸净电荷为0时的溶液的pH值，用 pI 表示。 ? 一个氨基酸的羧基与另一个氨基酸的氨基脱去一分子水而形成酰胺键，这个键称为肽键，产生的化合物叫做肽。 ? 蛋白质的一级结构广义是指指蛋白质中共价键连结的全部情况：肽链的数目，肽链中氨基酸之间的连结方式，肽链中氨基酸的排列顺序，二硫键的位置。狭义是指肽链中氨基酸的排列顺序。 ? 蛋白质的二级结构指多肽链本身通过氢键沿一定方向盘绕、折叠而形成的构象。天然蛋白质包括α-螺旋、β-折叠、β-转角、无规则卷曲等二级结构。 ? α-螺旋 主链折叠成螺旋状结构 —— 右手螺旋，主链中所有酰胺平面基本上平行于螺旋轴，侧链都伸向螺旋的外侧，螺距 0.54nm，每3.6个氨基酸形成一圈螺旋，每个aa残基沿中心轴上升0.15nm；旋转100°。 ? β-折叠是由两条或多条伸展的多肽链靠氢键联结而成的锯齿状片状结构，侧链基团与Cα间的键几乎垂直于折叠平面，R基团交替地分布于片层平面两侧。 ? β-转角，也称β-回折，存在于球状蛋白中。其特点是肽链回折180°，使得氨基酸残基的C=O和与第四个残基的N-H形成氢键。 ? 无规则卷曲，又称自由卷曲，是指没有一定规律的松散肽链结构。酶的功能部位常常处于这种构象区域。 ? X-射线衍射技术研究表明，肽键C-N键介于单键和双键之间，具有部分双键性质，不能自由旋转，其中决大多数都形成刚性的酰胺平面结构。 ? 超二级结构：指多肽链上若干相邻的构象单元（如a-螺旋、b-折叠、b-转角等）彼此作用，形成有规律的二级结构的聚集体。 ? 结构域：指存在于球状蛋白质分子中的相对独立的、紧密的球状三维实体，其间由松散的一段肽链连接。 ? 三级结构：指的是多肽链在二级结构、超二级结构和结构域的基础上，主链构象和侧链构象相互作用，进一步盘曲折叠形成球状分子结构。特点：a肽链盘绕成紧密的球状结构，b大多数非极性侧链埋在分子内部，形成疏水核；而极性侧链在分子表面，形成亲水面，c分子表面往往有一个内陷的空隙，它常常是蛋白质的活性中心。 ? 四级结构：由两条或两条以上具有三级结构的多肽链聚合而成、有特定三维结构的蛋白质构象。每条多肽链又称为亚基。 ? 蛋白质相对分子量测定：超速离心法，凝胶过滤法，聚丙烯酰胺电泳等。 ? 变性：蛋白质受到某些理化因素的影响，其空间结构发生改变，蛋白质的理化性质和生物学功能随之改变或丧失，但未导致蛋白质一级结构的改变，这种现象叫变性作用。表现：生物活性丧失（酶）；溶解度降低，粘度增大，扩散系数变小（蛋清）；基团位置改变；对蛋白酶敏感性增大。 ? 复性：高级结构松散了的变性蛋白质通常在除去变性因素后，可缓慢地重新自发折叠形成原来的构象，恢复原有的理化性质和生物活性，这种现象称为复性。 ? 由于蛋白质中的Tyr、Trp 和 Phe 残基在紫外区有光吸收，所以蛋白质在 280nm 的光波长处有最大光吸收，这一特性可用于蛋白质的检测。 ? DNA的一级结构：DNA分子上核苷酸（碱基）的排列顺序，四种脱氧核苷酸通过3,5-磷酸二酯键连接起来的多核苷酸链。特点：a无分枝的长链，b具有方向性。两个末端分别为5端和3端，在天然DNA中，5端常为磷酸，3端为游离羟基，c由糖-磷酸相互间隔连接，构成主链；碱基连接在主链的核糖上，形成侧链。 ? DNA的二级结构是指DNA的双螺旋结构，双螺旋结构是DNA的两条链围着同一中心轴旋绕而成的空间结构。 ? 双螺旋结构模型的基本特征：1. 反向平行 的双链沿中心轴盘绕成右手螺旋。2. 双螺旋表面形成两种凹槽：较浅的叫小沟，另一条叫大沟。3. 由糖-磷酸相互间隔连接构成的主链处于螺旋外侧；碱基则伸向螺旋内部，与中轴垂直。4. 双螺旋内部的碱基按规则配对：A与T配对，形成2个氢键；G与C配对，形成3个氢键 (见下图)，称为碱基互补配对，双螺旋的两条链则呈互补关系。5. 双螺旋直径为2nm，每对脱氧核苷酸残基沿纵轴旋转36°，上升0.34nm。所以每10个碱基对形成一个螺旋，螺距3.4nm。 ? 维持双螺旋结构稳定性的力：1互补碱基之间的氢键，2碱基堆集力：碱基堆集成非极性的区域，相互间产生疏水作用和范德华力，3 离子键。 ? DNA的三级结构：双螺旋进一步扭曲形成的更高层次的空间结构，主要指超螺旋结构。生物意义：1DNA被压缩和包装，使其体积大大减小，2增加了DNA的稳定性，3可能与复制和转录的调控有关. ? RNA的一级结构：核苷酸之间的连结方式：3,5-磷酸二酯键。 ? RNA的二级结构：常常形成局部的双螺旋，如RNA的茎环结构。 ? RNA的三级结构：RNA分子在二级结构基础上进一步扭曲折叠便形成三级结构。 ? tRNA的一级结构：1链长相近：约70~90个核苷酸，沉降系数为4S。2 .5