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实验六酵母核糖核酸的分离及组分鉴定
酵母核糖核酸的分离及组分鉴定 生物化学实验 5’ 5’ 3’ 3’ 一、实验目的 1. 掌握RNA的提取方法 2. 学会使用地衣酚法测定RNA的含量 3. 熟悉和掌握离心机的使用方法 二、实验原理 由于RNA的来源和种类很多,因而提取制备方法也各异,一般有苯酚法、去污剂法和盐酸胍法。其中苯酚法又是实验室最常用的。组织匀浆用苯酚处理并离心后,RNA即溶于上层被苯酚饱和的水相中,DNA和蛋白质则留在苯酚层中,向水层加入乙醇后,RNA即以白色絮状沉淀析出。此法能较好地除去DNA和蛋白质,提取的RNA具有生物活性。 酵母细胞富含核酸,且核酸主要是RNA,含量为干菌体的2.67%-10.0%,而DNA含量较少,仅为0.03%-0.516%。为此提取RNA多以酵母为原料。工业上制备RNA多选用低成本、适于大规模操作的稀碱法或浓盐法。这两种方法所提取的核酸均为变性的RNA,主要用作制备单核苷酸的原料,其工艺比较简单。 稀碱法是用氢氧化钠使酵母细胞壁变性、裂解,然后用酸中和,除去蛋白质和菌体后的上清液用乙醇沉淀RNA或调pH2.5利用等电点沉淀。提取的RNA有不同程度的降解。浓盐法是用高浓度盐溶液处理,同时加热,以改变细胞壁的通透性,使核酸从细胞内释放出来。 RNA含有核糖、嘌呤碱/嘧啶碱和磷酸各组分。加硫酸煮可使RNA水解,从水解液中可用定糖,加钼酸铵沉淀(或用定磷法)和加银沉淀等方法测出上述组份的存在。(1)嘌呤碱与硝酸银作用产生白色的嘌呤银化合物沉淀。(2)地衣酚显色法:核糖核酸与浓盐酸共热时,即发生降解,形成的核糖继而转变为糠醛,后者与地衣酚(3,5-二羟基甲苯)反应呈鲜绿色,该反应需用三氯化铁或氯化铜作催化剂。(3)磷酸与钼酸铵试剂作用产生黄色的磷钼酸铵沉淀[(NH4)3PO4·12MoO3↓]。 二、实验原理 三、仪器、原料和试剂 仪器:试管; 烧杯:100mL; 移液管:0.2mL(×1)、2.0mL(×2)、1mL(×2); 量筒:10 mL、50mL各一个; 滴管; 电磁炉; 离心机; 布氏漏斗。 原料:干酵母粉 低速离心机 三、仪器、原料和试剂 试剂: (1)0.2%氢氧化钠溶液; (2)10%硫酸; (3)0.1mol/L硝酸银溶液(5%硝酸银溶液); (4)1mol/L浓氨水; (5)酸性乙醇溶液:30mL乙醇加0.3mL HCl; (6)地衣酚试剂:100mg地衣酚,溶于100ml浓盐酸中,再加100mgFeCl3·6H2O或等量的CuO; (7)定P试剂: a.17%硫酸:17ml浓硫酸(比重1.84)缓缓加入83ml水中 b.2.5%钼酸铵溶液:2.5g钼酸铵溶于100ml水中 c.10%Vc(抗坏血酸)溶液:10g抗坏血酸溶于100ml水中。棕色瓶储存。溶液程淡黄色尚可使用。呈深黄色甚至棕色即失效。 临用时将上述三种溶液与水按如下比例混合,a:b:c:水=1:1:1:2 四、实验步骤 1、酵母RNA的提取 (1)称8g干酵母粉悬浮于40mL 0.2%NaOH 溶液的100mL烧杯中 沸水浴加热30分钟,不断搅拌。 (2)冷却后,4000r/min离心8分钟,将上清液慢慢倾入20mL酸性乙醇的烧杯中,边倒边搅。而后静置10分钟,待RNA完全沉淀,4000r/min离心8min。 (3)弃去上清,沉淀为RNA粗制品。 ? 2、水解 RNA粗制品转移至三角瓶中,加10mL10%硫酸,盖上漏斗,沸水浴10分钟,过滤,弃去滤渣,滤液备用。 3、RNA组分鉴定 (1)嘌呤碱:取一支试管,加入20滴5%硝酸银溶液,逐滴加入浓氨水至沉淀消失,然后加入20滴水解液,静止,观察白色絮状沉淀生成即为嘌呤碱银化合物沉淀。 (2)核糖:取一支试管,加入20滴水解液,然后加入20滴地衣酚试剂,在沸水浴中加热5分钟,观察有没有变绿。 (3)磷酸:取一支试管,加入20滴水解液,然后加入20滴定P试剂,在沸水浴中加热5分钟,观察有没有变蓝。 五、结果与讨论 六、注意事项 稀碱法提取的RNA为变性RNA,可用于RNA组分鉴定及单核苷酸制备,不能作为RNA生物活性实验材料。 地衣酚反应特异性较差,凡戊糖均有此反应。因此地衣酚实验不能作为RNA与DNA鉴别的依据。 离心时要配平。 水浴时要搅拌,注意安全。 七、思考题 1. DNA对本法测定RNA含量是否有影响?若有影响,如何消除? 2.你能知道CuO或FeC
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