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2017-04-15 发布于上海
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生物资讯程式语言应用Part

Regular expression in Perl 樣式 (pattern) 的表達. 繫結符號 =~. =~可用來將右邊的樣式比對左邊的字串純量，成功傳回1，失敗傳回0. 表否定則可改用!~ 通常搭配判斷式使用. Regular expression in Perl cont. 比對. $` : 代表字串中比對成功之前的部分. $ : 代表字串中比對成功的部分. $‘ : 代表字串中比對成功之後的部分. Regular expression in Perl cont. 字元取代. $var =~ tr/xxx/yyy/ 把變數 $var 內的 xxx 字元都逐一代換成 yyy 字元字串取代. $var =~ s/xxx/yyy/ 把變數 $var 內的第一個 xxx 子字串整個代換成 yyy 子字串 $var =~ s/xxx/yyy/ig I : 忽略大小寫 g : 取代 $var 字串內所有符合的子字串 Regular expression in Perl cont. Practice. 比對. 字元取代. 字串取代. * 生物資訊程式語言應用生物資訊程式語言應用 Part 3 Perl Language Outline Introduction. Installation. Background knowledge in Perl. Data type. Control structure. Regular expression. Overall practice. Introduction Perl is free software. Larry Wall (He is a linguist). The history of Perl language. 1987- Perl 1.0. 1994 - Perl 5 (contain OOP). OOP (object oriented programming) 物件導向程式語言 Perl 5.8.0 – support unicode. 2003 – Perl 6. Now. Characteristic. The script language base on C language (具跨平台的特性). Installation Perl is the default language in any distribution of Linux. Perl can be executed and worked by the ActivePerl package in windows platform. /activeperl/ How to edit Perl program? Notepad in windows, UltraEdit and any text editor. Installation cont. Practice. Download ActivePerl software file. Install ActivePerl. Background knowledge Data type in Perl. Control structure in Perl. Regular expression in Perl. Data type in Perl Like English Scalar (純量變數) – 比喻單件事物. 數字常數 $x = 5; 字串常數 $y = “Hello” ; The special expression of Perl. Print “Hello” . ”World” ; (Hello World). Print “Hello” * 2 ; (HelloHello). 字串與數字間的轉換 $x = 123; $y = “456”; Print $x + $y ; (數字) Print $x . $y ; (字串) Data type in Perl cont. Practice. Using scalar. Special expression. 字串與數字間的轉換. Data type in Perl cont. Array (陣列). The definition of Array in Perl. @student=(9154610,9154611,”9154612”); my @student; $student[0