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第八章真核生物基因表达调控
第八章 真核生物基因 表达调控 教学目的: 了解真核基因表达调控的特点 了解转录前的调控, 掌握增强子的作用特点 掌握反式作用因子的DNA结合域的结构花式; 了解转录后加工水平的调控方式, 掌握可变剪接、反式剪接、RNA编辑的概念; 了解翻译水平的调控方式及特点。 第一节 概述 第二节 转录水平的调控 第三节 转录后加工水平的调控 第四节 翻译的调控 原核与真核生物基因表达的差异 第一节 概述 第二节 转录水平的调控 第三节 转录后加工水平的调控 第四节 翻译的调控 1 顺式作用元件 2 反式作用因子 1 基因转录的顺式作用元件(cis-acting elements) 顺式作用元件:对基因表达有调节活性的DNA序列,其活性只影响与其自身同处在一个DNA分子上的基因; 通常不编码蛋白质,多位于基因旁侧或内含子中。 包括: 启动子、终止子、增强子、沉默子、静息子、转座子、效应元件等。 II型启动子组成 (1) 核心启动子成分,如TATA框; (2) 上游启动子成分(UPE),如CAAT框, GC框,八聚体(octamer)等; (3) 转录起始子(Inr) 真核启动子含有不同的序列,不同序列的位置、种类、距离和方向都不完全相同; SV40 早期启动子 胸苷激酶 组蛋白H2B -140 -120 -100 -80 -60 -40 -20 +1 Oct CAAT GC TATA 1.2 增强子 Enhancer 又称远端上游序列(far upstream sequence)。 最早SV40病毒中发现,可使旁侧基因转录提高100倍。 组成:100-200bp,单拷贝或多拷贝串连形式存在。 正性调控元件,转录因子结合,促进转录。 增强子的作用特点: 促进基因的转录效率远距离发挥作用 (100~500bp,10Kb) 促进转录,不具有启动子专一性 功能与方向、位置无关 具有组织或细胞特异性 对同源或异源基因均有功能。 1.3 沉默子 silencer 负性调控元件, 转录因子结合抑制转录。 作用特点: 不受序列方向的影响, 能远距离发挥作用, 并可对异源基因的表达起作用。 1.4 转座子 转座子---跳跃基因的移动,有时候能够激活或抑制某些结构基因的表达。 效应元件的特点: 有短的保守顺序; 是启动子或增强子的上游元件。 在不同基因中,拷贝相似,有时有多个拷贝; 与转录起点距离不固定。 1 顺式作用元件 2 反式作用因子 2 反式作用因子(trans-acting factors) 反式作用因子:通过扩散自身表达产物(酶、调节蛋白)控制其他基因的表达,其编码基因与其识别或结合的靶序列不在同一个DNA分子上。 包括:转录因子、RNA聚合酶、调控蛋白等。 2.1 反式作用因子的分类 2.2 反式作用因子的调控作用 (3) 诱导型因子:和效应元件(特异调控序列)结合的蛋白因子。 2.2 反式作用因子的调控作用 蛋白质和DNA相互作用; 蛋白质和配基结合; 蛋白质之间的相互作用; 蛋白质的修饰。 DNA结合域,binding domain,BD:100aa, 大沟 转录激活域,active domain,AD:30-100aa (1) 转录激活域 带负电荷的螺旋结构 如GCN4,GAL4 rich-Gln 如SP1, AP2, oct1, oct2 rich-pro 如CTF/NF1 (2) DNA结合域的结构花式/基元( motif) 锌指结构(Zinc finger ) 螺旋-转角-螺旋结构(helix-turn-helix,HTH) 同源异形结构域(Homeodomains,HD) 螺旋-环-螺旋结构(helix-loop-helix,HLH) 亮氨酸“拉链” (leucine zipper ) ① 锌指(zinc finger) 由一小组保守的氨基酸和锌离子结合,形成了相对独立的功能域,像一根根手指伸向DNA的大沟。 有两种基本构型; A. Cys2/His2 ~23aa,两指间7-8aa 共有序列: Cys-X2-4-Cys-X3-Phe- X5-Leu-X2-His-X3-His 串联重复排列, 锌指数目多少不等 SP1 B. Cys2/Cys2 Zn2+与4个Cys结合 共有序列:Cys- X2- Cys-X13- Cys- X2- Cys 无大量重复性锌指 (2) DNA结合域的结构花
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