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生物化学-核酸化学课件.pptVIP

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染色体的形成: DNA+组蛋白=核小体; 核小体绕成螺线管状(染色质丝); 染色质丝+非组蛋白=染色体; 3.DNA双螺旋的不同类型 3.DNA双螺旋的不同类型 第五节 核酸的性质及分离、分析 一、核酸的理化性质 二、核酸的分离 三、核酸的分析 四、核酸测序的研究方法 核酸的物理特性 纯品DNA为白色纤维状固体,RNA为白色粉末。 DNA、RNA及核苷酸为极性化合物,溶于水,不溶于有机溶剂。DNA能被乙醇和异戊醇沉淀。 核酸的两性解离 DNA和RNA都为两性电解质,具有等电点。 核酸在pH4时,带负电荷 等电点(pI): DNA的相对分子质量较大,一般为106~109 bp,大多数DNA为线性分子,分子极不对称,虽然其长度可达厘米级但分子的直径只有纳米级。 RNA的相对分子质量较小,通常为104~106 bp。 DNA能被乙醇和异戊醇沉淀。 DNA分子的粘度比RNA分子的粘度要大得多 。 不同相对分子质量的核酸沉降速度不同。一般情况下,超螺旋DNA 环状DNA 线形DNA。 嘌呤碱与嘧啶碱有共轭双键,使碱基核苷、核苷酸和核酸在240~290nm紫外波段有一强烈的吸收峰,最大吸收值在260nm附近。 Sanger双脱氧链终止法 Gilbert化学断裂法 必威体育精装版的测序方法: 焦磷酸测序技术: Roche公司的GS FLX系统(454系统); 桥扩增测序技术: Illumina公司的Genome Analyzer系统(Solexa系统); 连接测序技术: ABI公司的SOLiD系统; 第六节 核酸的应用研究 一、人类基因组计划 二、分子杂交 三、小RNA和微小RNA 四、反义RNA 1990年,美国国会批准美国的“人类基因组计划”于10月1日正式启动。美国的人类基因组计划总体规划是:拟在15年内至少投入30亿美元,进行对人类全基因组的分析。 美国:WASH&MIT等研究中心,贡献率为54%; 英国:SANGER等研究中心,贡献率为33%; 日本:RIKEN等研究中心,贡献率为7%; 法国:GENOSCOPE研究中心,贡献率为2.8%; 德国:IMB等研究中心,贡献率为2.2%; 中国:华大基因等,贡献率为1%; 2002,12,18日,水稻基因组由中国领衔完成。 pI= pKa1+pKa2 2 1.相对分子质量 2.粘度与沉降特性 3.紫外吸收 4.变性与复性(变性) 定义:指核酸双螺旋区氢键断裂,变成单链,它并不涉及共价键(磷酸二酯键)的断裂。 变性因素:热变性、酸碱变性和化学变性等。 定义:变性DNA在适当条件下,又可使两条彼此分开的链重新缔合成双螺旋结构。 高温变性 缓慢冷却 热复性 退火 4.变性与复性(复性) DNA复性后,许多物化性质又得到恢复,生物活性可以得到部分恢复。但将热变性的DNA骤然冷却,不能复性,只有缓慢冷却时才可以复性。 高温变性 缓慢冷却 热复性 急速冷却 复性失败 4.变性与复性(复性) 4.变性与复性(复性) 影响核酸复性速度的因素很多: ①核酸浓度越高,随机碰撞的频率越高,复性速度越快。 ②核酸分子越大,链间错配频率越高,复性速度越慢。 ③核酸链内重复序列多,易形成互补配对,复性速度较快。 ④维持一定的溶液离子强度,消弱磷酸基静电斥力,可加快复性速度。 ⑤选择最佳的复性温度,温度太高会使核酸发生变性,而温度过低会使错配的两链无法分开。 通常把DNA的双螺旋结构失去一半时的温度称该DNA的溶点或溶解温度,用Tm表示,DNA的Tm值一般在70~850C之间。 变性的相对量 温度0C 60 80 100 1.0 1.2 1.4 1.6 0 Tm Tm Tm 100% Poly d(A-T) Poly d(G-C) DNA 5.熔解温度 Tm值的大小与下列因素有关: (1)DNA的均一性 (2)G-C含量 (3)介质中的离子强度 5.熔解温度 (1)DNA的均一性:一般均一性越高,Tm值的变动范围越小。 (2)G-C含量:G-C含量越高,Tm值越大,Tm与G-C含量成正比关系。因为G-C比A-T更稳定(氢键)。Tm与所含G-C的多少的关系,可用经验公式计算不同DNA的Tm: (G+C)%=(Tm-69.3)×2.44 5.熔解温度 (3)介质中的离子强度:一般离子强度较低,DNA的Tm值也较低,范围也越窄。 温度0C 70 80 100 1.2 1.4 1.5 90 1.1 1.3 A 260 0.01 0.02 0.05 0.2 0.1 0.5 1.0 大肠杆菌DNA在不同KCl浓度下的Tm 5.熔解温度 6.摩尔磷吸光系数 核酸分子中磷原子的含量基本稳定。 根据磷的含量测定核酸溶液的

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