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核酸制备的一般方法和原理
核酸的分离与纯化 核酸的分离与纯化 就基因工程而言,核酸分子是其研究所涉及的主要对象,所以核酸的分离与提取是研究中很重要的基本技术。 核酸样品的质量将直接关系到实验的成败。 核酸的分类 DNA 主要存在于细胞核的染色体中。核外也有少量DNA,如线粒体DNA(mtDNA),叶绿体DNA(cpDNA),质粒DNA。 RNA 存在于细胞质中,如mRNA, rRNA, tRNA等。 除上述DNA,RNA外,还有非细胞形式存在的病毒和噬菌体,其或只含DNA,或只含有RNA。 核酸制备的一般原则 分离纯化核酸总的原则: ①应保证核酸一级结构的完整性; ②排除其它分子的污染。 核酸纯化应达到的要求: ①核酸样品中不应存在对酶有抑制作用的 有机溶剂和过高浓度的金属离子; ②其它生物大分子的污染应降低到最低程度; ③排除其它核酸分子的污染。 核酸制备的一般原则 核酸制备时应注意的事项: ①尽量简化操作步骤,缩短提取过程。 ②减少化学因素对核酸的降解。PH4-10 ③减少物理因素对核酸的降解。机械剪切力和高温 ④防止核酸的生物降解。 核酸制备的一般原则 核酸制备的步骤: 破碎细胞 提取 纯化 核酸制备的一般方法和原理 核酸酶的抑制和抑制剂剂 降低温度,改变pH及盐的浓度,都利于对核酸酶活性的抑制,但均不如利用核酸酶抑制剂更有利,当然,几个条件并用更好。 对于DNA,抑制DNase活力很容易,但防止机械张力拉断则更重要。 对于RNA,因分子较小,不易被机械张力拉断,但抑制RNase活力较难,故在RNA提取中设法抑制RNase更重要。 核酸制备的一般方法和原理 核酸酶的抑制和抑制剂剂 DNase抑制 ①加入少量金属离子螯合剂,如0.01E DTA mol/L或柠檬酸钠,DNase基本可以全 部失活。 ②去垢剂、蛋白变性剂及DNase抑制剂 也可使DNase失活。 核酸制备的一般方法和原理 核酸酶的抑制和抑制剂剂 RNase抑制 ①操作要带手套。 ②所有器皿要严格消毒, ③试剂处理 ④低温操作 ⑤在分离过程中要加入一定的RNase抑制剂。 核酸制备的一般方法和原理 核酸制备中常用的去垢剂 核酸本身带负电荷,结合带正电荷的蛋白质。用于核酸提取的去垢剂,一般都是阴离子去垢剂,去垢剂的作用: 1.溶解膜蛋白及脂肪,使细胞膜破裂; 2.溶解核糖体上面的蛋白质,使其解聚,将核酸释放出来; 3.对RNase、DNase有一定的抑制作用。 核酸制备的一般方法和原理 核酸制备中常用的去垢剂 SDS 脱氧胆酸钠 4-氨基水杨酸钠 萘-1.5-二磺酸钠 三异丙基萘磺酸钠 核酸制备的一般方法和原理 核酸制备中常用的蛋白质变性剂 蛋白质变性剂的作用: 1.使蛋白质变性、沉淀,从核酸提取液中分离除去,以防造成蛋白污染。 2.使蛋白质变性,故可使核糖体解聚释放出核酸。 3.某些蛋白质变性剂也有抑制RNase活性和破裂细胞的作用。 核酸制备的一般方法和原理 核酸制备中常用的蛋白质变性剂 苯酚 氯仿 盐酸胍 DEPC 核酸制备的一般方法和原理 核酸制备中常用的酶制剂 DNase RNase 蛋白酶K 溶菌酶 核酸制备的一般方法和原理 核酸提取的一般过程 破碎细胞(防止核酸酶的作用) 微生物:溶菌酶、SDS裂解。 高等植物:捣碎器破碎、液氮研磨。 酶法:蛋白酶,如胰蛋白酶, 冰冻法:反复冻融或液氮冻后组织捣碎。 动物:液氮处理后用匀浆器破碎。 细胞器DNA,首先纯化细胞器。 以上处理时均要同时加入核酸酶抑制剂 核酸制备的一般方法和原理 核酸提取的一般过程 破碎抽提核酸除去杂质 1.首先使脱氧核糖核蛋白、核糖体、病毒的核蛋白与其它成分分离 2.使核酸与蛋白质分离 3.除去脂类 4.多糖的除去 核酸制备
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