MDL有机合成数据库讲述.ppt

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MDL有机合成数据库讲述

计算机工作站上的主要软件和 数据库 美国Tripos公司的分子设计软件系统 可检索的数据库 MDL有机反应数据库 数据库包含有大量有机合成路线。数据摘自世界权威的有机合成学术刊物, 其中包括了反应时间、温度、溶剂、催化剂、收率等等几十条信息,并附有摘要信息。 具有多种检索方法, 结构检索是其主要特色之一, 可大大提高检索的准确性和工作效率。 现有的这个数据库收录的有机合成数据,缺点是1992年前的数据量比较小 CSD数据库 CSD数据库中包含有17余万个有机和有机金属分子晶体结构数据和齐全的参数及相关文献。还包括156个高分子的晶体结构数据,如尼龙、聚乙烯等。由英国剑桥大学的剑桥晶体数据中心收集、整理。 PDB数据库 PDB是关于多肽、蛋白质、DNA、RNA等生物大分子以及它们与小分子相互作用而形成的复合物的晶体数据库。包括有6252个生物大分子的晶体结构结构实验数据。 IsoStar数据库 包含大量关于非键相互作用的试验及理论信息,如几何、能量和非键接触频率信息。是研究物质间相互作用的一个有力工具。IsoStar数据主要从CSD、?PDB和分子轨道计算导出。 MDL有机反应数据库 简单操作方法 介绍 MDL有机反应数据库 由两部分组成 ISIS Base,负责查询条件的设置和对数据库进行查询 ISIS Draw,画分子结构式的软件,可以独立的使用 打开数据库 打开数据库(2) 输入进入数据库的密码 开始进入数据库系统 显示版权信息 选择查询方式 查询选项 查询选项(2) 准备查询 进入ISIS Draw画出分子结构 画好的结构 将画好的结构传递到ISIS Base 单击Search按钮开始查询 查询到的结果 * * * * 如果画的分子式不符合ISIS Base的规定,则会提出警告 在画图的时候,不要使用文字必须画完整的分子结构 首先运行的是ISIS Base 以简单查询为例

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