NCBI序列比对方法与实例操作讲述.ppt

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NCBI序列比对方法与实例操作讲述

ZMALINGSHU)-A68-M13+_D09 ZMALINGSHU)-A69-M13+_E09 * 点击进入 点击此处进入核酸序列比对 将FASTA格式的序列输入这里 此处可自动识别比对序列名称 点击此处进入序列比对 已知序列编号 所查询分子类型 比对序列长度 序列相似性比对图谱 数据库名称 不同颜色代表两种比对序列具有的相同的碱基数目不同。例如,红色,代表与比对的核酸序列有200个以上的碱基是相同的。 序列长度 序列相似性比对结果 相似序列一:番茄ch07染色体全基因组 相似序列二:潘那丽番茄ch07染色体全基因组 数据库相似序列名称 类似性积分 E值为匹配期望值。说明可以找到与有哪些信誉好的足球投注网站序列相匹配的其它序列的几率。E值越接近零,越不可能找到其它的匹配序列,其背后的含义就是E值越少,匹配度越好 相似度 数据库标识 序列编号 匹配序列长度 匹配范围 对比空白 相似序列,即输入序列和有哪些信誉好的足球投注网站到序列的匹配率 输入序列被随机有哪些信誉好的足球投注网站出来的概率,该值越小越好 询问序列和数据库里面序列的互补链匹配 分数越高,则同源性越好 空白 预测:马铃薯?单酰基甘油脂酶 ABHD-6相似mRNA 番茄ch03染色体全基因组 *

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