文献报告Classification and characterization of microsatellite概要.ppt

* 2.研究内容 MSI分类 肿瘤中的MSI MSI-H VS MSS MSI-H与肿瘤 MSI与肿瘤相关基因 MSI与患者预后 MSS MSI-L MSI-H * 2.研究内容 MSI与患者生存率 结直肠癌中，MSI-H与患者生存率有正相关关系 MSI-H含量最高的四种肿瘤，MSI含量与生存率有微弱的联系 将MSI含量处理成连续变量 有更强的联系 对于MSS肿瘤，MSI含量与患者预后也是有联系的 * * 2.研究内容 MSI与患者生存率 结直肠癌中，MSI-H与患者生存率有正相关关系 MSI-H含量最高的四种肿瘤，MSI含量与生存率有微弱的联系 将MSI含量处理成连续变量 有更强的联系 对于MSS肿瘤，MSI含量与患者预后也是有联系的 * * 2.研究内容 MSI与患者生存率 结直肠癌中，MSI-H与患者生存率有正相关关系 MSI-H含量最高的四种肿瘤，MSI含量与生存率有微弱的联系 将MSI含量处理成连续变量 有更强的联系 对于MSS肿瘤，MSI含量与患者预后也是有联系的 * * 2.研究内容 MSI与肿瘤转移 7份乳腺癌样本 7份甲状腺癌样本 7份胶质瘤样本 MSI含量与肿瘤的转移无关（样本量较少） LOGO 感谢观映 此处添加公司信息 LOGO 文献阅读交流会 郑子奇 2016.11.08 * Classification and characterization of microsatellite instability across 18 cancer types 18种肿瘤的微卫星分类及其特点 —— Nature Medicine 2016.10.03 * 1.基本认识 微卫星（Microsatellites） 人类基因里的简单重复序列 单核苷酸，双核苷酸，或高位核苷酸的重复 重复次数为10-50次 单一型： ATATATATATATATATATATATAT 复合型： ATATATCACACACACACACAC 间断型： ATATATCAATATATCAATATATA * 1.基本认识 微卫星不稳定性（MSI） 重复单位插入/缺失 微卫星长度改变 新的微卫星等位基因 最早发现于结直肠癌 MSI持续呈现MMR缺陷的特征 MLH1，MSH2，MSH6和PMS2的突变 MMR：错配修复系统（Mismatch System），是监督和纠正微卫星中产生的错误，具有高度保守性 * 1.基本认识 如何判断MSI MSI-H：≥2个位点不稳定性（大于30%的大标准） MSI-L: 1个位点不稳定性（10-30%的大标准） MSS：没有位点不稳定（小于10%） * 2.研究内容 背景资料 18种肿瘤，5930个肿瘤外显子，20万个以上的微卫星位点 识别出最有可能成为MSI的位点，可作为肿瘤特征性的MSI信号 某些MSI在肿瘤的某些位点高频出现，可能因为它们能作为肿瘤的驱动因子，这是自然选择的结果 * 2.研究内容 背景资料 MSI（+）的肿瘤患者使用细胞程序性死亡抑制剂可以提高疗效（新表达的位点提高了T细胞的识别能力） 样本来源：Cancer Genome Atlas Research Network（TCGA） * 2.研究内容 MSI分类 肿瘤中的MSI MSI-H VS MSS MSI-H与肿瘤 MSI与肿瘤相关基因 MSI与患者预后 MSS MSI-L MSI-H * 2.研究内容 MSI分类 肿瘤中的MSI MSI-H VS MSS MSI-H与肿瘤 MSI与肿瘤相关基因 MSI与患者预后 MSS MSI-L MSI-H * 2.研究内容 1900多万个肿瘤 外显子基因 51.6万（2.7%） 95.9%的微卫星编码区和98.4%的剪切位点 * 2.研究内容 * 2.研究内容 MOSAIC 建立一种MSI分类法——MOSAIC 对比传统的MSI-PCR，拥有更高的准确性（灵敏度95.8%，精确度97.4%） 最初应用于子宫内膜癌的研究，有很多证据表明该分类法优于MIS-PCR（16个例子中有7例完全支持MOSAIC分类法而不支持MIS-PCR法） * 2.研究内容 MSI分类 肿瘤中的MSI MSI-H VS MSS MSI-H与肿瘤 MSI与肿瘤相关基因 MSI与患者预后 MSS MSI-L MSI-H * 2.研究内容 关于MSI-L MSI-L是MSI的一种亚型 划分仍有争议：人为划分 OR 独特的临床表现？ 研究成果 MSI-L与MSS在微卫星总数及等位基因的差异性上没有明显的区别 将其归入MSS中