松江鲈遗传多样性解读.doc

本科毕业论文 题 目 松江鲈遗传多样性分析 系（院） 生物与食品工程系 年 级 2004 级 专 业 生物科学（师范） 班 级 （2）班 学 号 060104210 学生姓名 鲍 峰 指导教师 郁建锋 职 称 讲师 论文提交日期 2008 年6月5日 松江鲈遗传多样性摘 要通过正交实验设计分别从TagDNA聚合酶、Mg2 +、dNTPmix和引物4种PCR原料因素的3个水平，筛选并确立了松江鲈ISSR- PCR反应最佳体系，并通过温度梯度PCR，确立了适于的退火温度。结果表明，利用所建立的ISSR-PCR反应体系，对松江鲈样本进行检验，获得了清晰、重复性好、多态性高的DNA谱带。 从77个ISSR引物中筛选出4个引物，对松江鲈2个群体（辽宁丹东野生群体、河北秦皇岛F1群体）共48个样品进行扩增，共得到44个清晰的扩增位点，其中多态性位点37个，多态位点百分率为84.09%。Popgene分析结果表明：丹东野生群体的遗传多样性水平(P=79.55%，h=0.2750，I=)略高于群体的遗传多样性水平。48个个体间最大的遗传距离为0.8389 ,个体间最小的遗传距离为，48个个体的平均遗传距离为群体间的Nei’s遗传分化系数为0.0876；利用MEGA3.0软件构建了松江鲈48个个体的UPGMA系统树，松江鲈个体不以地理群体分别聚类，无明显分支表明松江鲈种群的遗传多样性处于中等水平，2个群体的遗传分化尚未达到种群的分化水平。 本文从分子遗传学入手，采用ISSR分子标记技术分别对松江鲈的野生与人工繁育群体进行遗传多样性研究，为其种质资源的科学管理研究野生松江鲈的遗传背景比较野生群体与人工繁育群体之间的遗传差异探讨由于辽东半岛沿岸带有较多松江鲈分布而产生的基因交流对2个群体遗传结构的影响提供理论依据。 关键词：松江鲈ISSR 遗传多样性 Study on the genetic diversity of Trachidermus fasciatus Abstract ISSR technique was used to assess the genetic diversity of two populations (24 wide individuals from the Yalu River, and 24 cultured individuals from the Qinhuang Island). In this study, orthogonal design was used to optimize ISSR amplification system on Trachidermus fasciatus Heckel in four factors (Taq DNA polymerase, dNTP, primer, Mg2+) at three levels respectively. Therefore best reaction systems could be established. And the optimal annealing temperature 51℃ for ISSR-PCR reaction was proposed by gradient PCR. The clear and polymorphic DNA bands were amplified repeatedly from 24 wild Trachidermus fasciatus Heckel by the established ISSR amplification system. The genetic diversity of 48 samples from two populations (24 wide individuals from the Yalu River, and 24 cultured individuals from the Qinhuang Island ) were studied using the inter-simple sequence repeat (ISSR) markers. The ISSR bands can be differentiated highly in 4 primers after screening. A total of 37